More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3199 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 377 aa  721    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  48.61 
 
 		 356 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.94 
 
 		 361 aa  269  8e-71  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  49.69 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  52.34 
 
 		 362 aa  261  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  47.96 
 
 		 359 aa  255  8e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 360 aa  253  5.000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  48.97 
 
 		 376 aa  246  4.9999999999999997e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  48.81 
 
 		 359 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  45.23 
 
 		 359 aa  242  6e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  44.08 
 
 		 367 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  49.81 
 
 		 634 aa  233  4.0000000000000004e-60  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  47.24 
 
 		 353 aa  230  4e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  46.56 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  46.55 
 
 		 360 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  44.31 
 
 		 357 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.22 
 
 		 362 aa  222  9e-57  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  44.29 
 
 		 360 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  48.19 
 
 		 356 aa  218  2e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  51.3 
 
 		 380 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  46.06 
 
 		 375 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.28 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  47.42 
 
 		 352 aa  210  3e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 365 aa  206  4e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.75 
 
 		 369 aa  199  7.999999999999999e-50  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  44.04 
 
 		 355 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  50 
 
 		 384 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  41.27 
 
 		 358 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  47 
 
 		 365 aa  196  7e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  43.82 
 
 		 372 aa  195  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  43.15 
 
 		 347 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  41.92 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  41.92 
 
 		 374 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  41.92 
 
 		 374 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  39.72 
 
 		 371 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  42.32 
 
 		 364 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  45.71 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  43.29 
 
 		 385 aa  182  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  41.88 
 
 		 377 aa  179  9e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  39.23 
 
 		 1155 aa  178  1e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  39.49 
 
 		 364 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  41.97 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  37.65 
 
 		 362 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 368 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.58 
 
 		 373 aa  170  4e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  46.36 
 
 		 362 aa  170  4e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  41.76 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  41.76 
 
 		 418 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  41.76 
 
 		 418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  36.25 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.74 
 
 		 382 aa  134  3e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.91 
 
 		 360 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  32.28 
 
 		 368 aa  130  5.0000000000000004e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.97 
 
 		 332 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.35 
 
 		 364 aa  119  9.999999999999999e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  32 
 
 		 326 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.05 
 
 		 341 aa  116  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  36.78 
 
 		 366 aa  114  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.83 
 
 		 322 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  30.96 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  36.73 
 
 		 329 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.56 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.03 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.29 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  30.97 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  30.97 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  38.14 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  31.6 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  30.71 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  31.88 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 337 aa  102  1e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  31.98 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  29.88 
 
 		 349 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.87 
 
 		 345 aa  101  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  32.63 
 
 		 333 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 322 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  31.43 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  31.51 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  30.6 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  31.43 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  31.43 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  100  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.42 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.42 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.42 
 
 		 331 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.5 
 
 		 354 aa  100  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.58 
 
 		 343 aa  100  5e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  32.87 
 
 		 351 aa  100  5e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  32.89 
 
 		 342 aa  100  6e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  27.45 
 
 		 326 aa  99.4  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  30.49 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 336 aa  99  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  35.06 
 
 		 350 aa  99.4  1e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>