More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1051 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  100 
 
 		 356 aa  704    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  67.44 
 
 		 360 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  63.98 
 
 		 353 aa  389  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  56.07 
 
 		 355 aa  353  2.9999999999999997e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  54.07 
 
 		 358 aa  349  3e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  53.04 
 
 		 365 aa  348  1e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  54.52 
 
 		 367 aa  341  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  54.26 
 
 		 360 aa  327  3e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  53.98 
 
 		 360 aa  309  5e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  52.48 
 
 		 357 aa  308  6.999999999999999e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  49.86 
 
 		 356 aa  304  2.0000000000000002e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  50.15 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  49.57 
 
 		 358 aa  295  9e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.88 
 
 		 361 aa  294  2e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  49.57 
 
 		 364 aa  285  8e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  54.7 
 
 		 634 aa  280  3e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.59 
 
 		 362 aa  276  5e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  46.67 
 
 		 359 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  45.93 
 
 		 359 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  49.54 
 
 		 375 aa  260  2e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  45.4 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  45.51 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  45.51 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  45.51 
 
 		 359 aa  253  5.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  50.63 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  44.53 
 
 		 376 aa  249  4e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.61 
 
 		 369 aa  247  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  47.02 
 
 		 377 aa  246  4e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  43.48 
 
 		 352 aa  243  3e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  48.18 
 
 		 372 aa  241  2e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  47.44 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  41.93 
 
 		 368 aa  231  1e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  41.74 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  48.19 
 
 		 377 aa  229  5e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  48.59 
 
 		 384 aa  228  2e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  42.15 
 
 		 350 aa  226  6e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  49.01 
 
 		 384 aa  224  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  43.83 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.77 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  40.82 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  40.82 
 
 		 374 aa  210  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  40.97 
 
 		 371 aa  209  5e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  40.51 
 
 		 374 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.14 
 
 		 377 aa  209  8e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  48.65 
 
 		 362 aa  208  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  42.26 
 
 		 1155 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  47.93 
 
 		 380 aa  193  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 350 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  40.8 
 
 		 385 aa  181  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  41.14 
 
 		 418 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.79 
 
 		 360 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  29.77 
 
 		 332 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  31.53 
 
 		 332 aa  125  8.000000000000001e-28  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.64 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  37.8 
 
 		 366 aa  124  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  31.11 
 
 		 368 aa  124  3e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  27.11 
 
 		 324 aa  123  4e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.92 
 
 		 322 aa  115  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  28.14 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  28.3 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  31.2 
 
 		 322 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  25.91 
 
 		 341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.88 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.15 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.75 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  32.34 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  32.03 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.47 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.78 
 
 		 345 aa  112  8.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  29.84 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  33.52 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  26.89 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  32.01 
 
 		 327 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  34.02 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  27.83 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  27.78 
 
 		 317 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  30.03 
 
 		 322 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.15 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  27.8 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  34.67 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  34.24 
 
 		 329 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  32.4 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  28.47 
 
 		 320 aa  107  3e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  32.69 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.64 
 
 		 322 aa  107  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  29.75 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  28.71 
 
 		 324 aa  106  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  30.83 
 
 		 322 aa  106  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.46 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  31.02 
 
 		 322 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  25.93 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3107  polyprenyl synthetase  33.23 
 
 		 325 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  29.69 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.74 
 
 		 354 aa  105  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>