More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4930 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 384 aa  749    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  85.16 
 
 		 384 aa  586  1e-166  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  47.34 
 
 		 365 aa  279  7e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  49.72 
 
 		 360 aa  275  7e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  47.71 
 
 		 357 aa  265  1e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  49.57 
 
 		 360 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  45.89 
 
 		 360 aa  258  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.96 
 
 		 361 aa  257  2e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  43.82 
 
 		 359 aa  255  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  43.24 
 
 		 355 aa  253  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  43.54 
 
 		 359 aa  248  1e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  46.05 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  49.38 
 
 		 356 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  48.41 
 
 		 358 aa  243  5e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  45.29 
 
 		 634 aa  241  1e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  50.31 
 
 		 375 aa  242  1e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  47.68 
 
 		 356 aa  238  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  46.5 
 
 		 371 aa  238  2e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  47.12 
 
 		 353 aa  235  8e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.08 
 
 		 362 aa  229  4e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  48.6 
 
 		 365 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  45.42 
 
 		 358 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  49.52 
 
 		 377 aa  225  9e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  42.78 
 
 		 352 aa  224  1e-57  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  44.32 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  43.02 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  43.02 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  43.02 
 
 		 359 aa  223  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  43.63 
 
 		 374 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  43.08 
 
 		 374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  43.08 
 
 		 374 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 362 aa  219  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  46.15 
 
 		 372 aa  215  9.999999999999999e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  40.78 
 
 		 364 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  44.81 
 
 		 361 aa  210  4e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  48.01 
 
 		 377 aa  207  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  43.09 
 
 		 1155 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  46.58 
 
 		 385 aa  205  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 347 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  39.55 
 
 		 364 aa  203  5e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  41.57 
 
 		 380 aa  196  6e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  42.24 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.17 
 
 		 369 aa  194  1e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  42.07 
 
 		 362 aa  189  1e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  48.66 
 
 		 362 aa  186  6e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  40.95 
 
 		 368 aa  184  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  41.41 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  41.41 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  41.41 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.41 
 
 		 377 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.4 
 
 		 373 aa  155  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  31.96 
 
 		 350 aa  146  7.0000000000000006e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.69 
 
 		 341 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  35.6 
 
 		 330 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.37 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.74 
 
 		 382 aa  120  3e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.58 
 
 		 361 aa  120  6e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  34.49 
 
 		 313 aa  119  9e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  30.11 
 
 		 320 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  28.18 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  28.8 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  34.45 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  36.48 
 
 		 297 aa  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  32.04 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  29.94 
 
 		 323 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  27.22 
 
 		 317 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  28.93 
 
 		 332 aa  112  8.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  32.35 
 
 		 327 aa  112  8.000000000000001e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  37.83 
 
 		 334 aa  112  9e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  28.75 
 
 		 326 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.71 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  31.11 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  34.63 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1076  polyprenyl synthetase  32.59 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00179719  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  32.27 
 
 		 325 aa  111  2.0000000000000002e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  29.17 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  37.83 
 
 		 334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  27.51 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  29.32 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.13 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  35.05 
 
 		 338 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 325 aa  108  1e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  29.61 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  31.21 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  29.28 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  30.26 
 
 		 326 aa  107  4e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  30.13 
 
 		 317 aa  107  4e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  30.1 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  29.28 
 
 		 332 aa  106  6e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  32.12 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  30 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  35.38 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2959  trans-hexaprenyltranstransferase  31.9 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0367555  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  30.27 
 
 		 321 aa  104  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.74 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.11 
 
 		 337 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.51 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>