More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2662 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 362 aa  704    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  53.54 
 
 		 359 aa  335  9e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  52.29 
 
 		 356 aa  317  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  50.99 
 
 		 359 aa  315  9e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  51.86 
 
 		 359 aa  310  2e-83  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.71 
 
 		 361 aa  304  1.0000000000000001e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  49.59 
 
 		 376 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  51.13 
 
 		 361 aa  274  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  45.69 
 
 		 360 aa  273  3e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  46.34 
 
 		 367 aa  268  8.999999999999999e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  48.03 
 
 		 352 aa  265  1e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  46.61 
 
 		 357 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  52.34 
 
 		 377 aa  259  4e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  48.34 
 
 		 353 aa  255  7e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  45.98 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 365 aa  251  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  47.37 
 
 		 360 aa  247  3e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  47.08 
 
 		 380 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  42.6 
 
 		 355 aa  242  9e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  45.72 
 
 		 356 aa  241  2e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  43.9 
 
 		 358 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  41.55 
 
 		 358 aa  229  5e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  45.08 
 
 		 634 aa  227  3e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 375 aa  222  8e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  42.54 
 
 		 364 aa  216  7e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  45.14 
 
 		 365 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  40.06 
 
 		 364 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 371 aa  206  4e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  41.1 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  41.1 
 
 		 374 aa  202  5e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  43.13 
 
 		 377 aa  202  8e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  40.78 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  45.06 
 
 		 372 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  41.29 
 
 		 384 aa  194  3e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.06 
 
 		 369 aa  193  5e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  43.57 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  40.25 
 
 		 362 aa  186  7e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.24 
 
 		 373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  39.69 
 
 		 347 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.83 
 
 		 377 aa  181  2e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  46.28 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  38.51 
 
 		 368 aa  180  4e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 350 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  37.34 
 
 		 1155 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 350 aa  169  9e-41  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  44.05 
 
 		 385 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  36.24 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.23 
 
 		 364 aa  137  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.93 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  30.65 
 
 		 324 aa  124  2e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  29.85 
 
 		 324 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 368 aa  122  6e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.29 
 
 		 382 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  32.11 
 
 		 348 aa  121  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.02 
 
 		 341 aa  120  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  27.73 
 
 		 321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  27.74 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.81 
 
 		 360 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29.2 
 
 		 324 aa  114  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  30 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  30.72 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.94 
 
 		 361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  29.87 
 
 		 337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  30.16 
 
 		 349 aa  110  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  30.61 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  31.61 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  32.81 
 
 		 338 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  38.99 
 
 		 338 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  28.1 
 
 		 330 aa  105  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  33.96 
 
 		 296 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  27.39 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 366 aa  105  9e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  29.37 
 
 		 322 aa  105  1e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  29.64 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  29.64 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  29.64 
 
 		 331 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3026  Polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  29.64 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  29.39 
 
 		 334 aa  105  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  30.77 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  30.99 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0978  trans-hexaprenyltranstransferase  31.61 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000234439  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1538  polyprenyl synthetase  31.6 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000356422  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  29.41 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  31.27 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.21 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  30.77 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  26.44 
 
 		 317 aa  103  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1257  Polyprenyl synthetase  29.66 
 
 		 295 aa  103  6e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00136441  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 339 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  29.97 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  30.99 
 
 		 323 aa  103  7e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>