More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1363 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 332 aa  662    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  38.71 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  35.39 
 
 		 350 aa  157  3e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  29.53 
 
 		 356 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 360 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.05 
 
 		 361 aa  126  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.9 
 
 		 382 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  27.65 
 
 		 358 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.69 
 
 		 362 aa  118  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  26.47 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  28.81 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  27.74 
 
 		 362 aa  113  6e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  25.95 
 
 		 366 aa  111  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  29.77 
 
 		 356 aa  110  3e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  29.07 
 
 		 368 aa  108  9.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  26.97 
 
 		 377 aa  107  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  29.63 
 
 		 347 aa  106  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  28.71 
 
 		 353 aa  105  9e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  27.06 
 
 		 355 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  28.87 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  26.77 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  27.53 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  25.69 
 
 		 376 aa  103  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  29.24 
 
 		 634 aa  102  1e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  27.99 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  25.55 
 
 		 359 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  33.87 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  23.97 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  23.97 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  29.26 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  23.97 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  28.46 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.41 
 
 		 360 aa  99.4  7e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.27 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  26.19 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  27.42 
 
 		 327 aa  99  9e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  23.72 
 
 		 359 aa  99  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  26.35 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 329 aa  99  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  25.84 
 
 		 350 aa  97.8  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.51 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0685  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.27357  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  31.54 
 
 		 380 aa  97.8  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  24.85 
 
 		 358 aa  97.4  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  25.72 
 
 		 384 aa  97.1  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  25.15 
 
 		 352 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  25.89 
 
 		 365 aa  95.9  8e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.21 
 
 		 320 aa  95.9  8e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.35 
 
 		 377 aa  95.9  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  22.92 
 
 		 371 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  25.09 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  30.27 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  27.54 
 
 		 384 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  26.69 
 
 		 367 aa  94  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1465  Polyprenyl synthetase  29.13 
 
 		 345 aa  92.8  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  29.86 
 
 		 322 aa  92.8  8e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  28.87 
 
 		 324 aa  92.4  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2886  farnesyltranstransferase  24.69 
 
 		 320 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  28.91 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  28.53 
 
 		 324 aa  91.7  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  36.49 
 
 		 332 aa  91.3  2e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  30.49 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  29.51 
 
 		 324 aa  91.7  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  28.15 
 
 		 1155 aa  91.3  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  30.49 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  25 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  30.49 
 
 		 386 aa  90.9  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  30.94 
 
 		 323 aa  90.1  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3189  trans-hexaprenyltranstransferase  27.36 
 
 		 322 aa  90.1  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  30.19 
 
 		 343 aa  89.7  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3011  Polyprenyl synthetase  29.6 
 
 		 326 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  23.21 
 
 		 372 aa  89.7  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  29.11 
 
 		 362 aa  89.4  7e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  27.05 
 
 		 317 aa  89  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  28.72 
 
 		 324 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5924  Trans-hexaprenyltranstransferase  25.76 
 
 		 323 aa  88.6  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  24.63 
 
 		 364 aa  88.6  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0645  polyprenyl synthetase family protein  29.13 
 
 		 297 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0989219  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  23.23 
 
 		 385 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  28.37 
 
 		 324 aa  88.2  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  29.34 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0566  polyprenyl synthetase family protein  29.13 
 
 		 297 aa  87.8  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.293627  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  25.08 
 
 		 360 aa  87.4  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.81 
 
 		 326 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  25.5 
 
 		 330 aa  87.8  3e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  28.07 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1389  polyprenyl synthetase family protein  29.13 
 
 		 297 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  25.99 
 
 		 321 aa  87  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0190  prenyl transferase  29.31 
 
 		 326 aa  86.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0926  farnesyl-diphosphate synthase  33.47 
 
 		 301 aa  86.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.19869  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2209  farnesyltranstransferase  25.08 
 
 		 325 aa  86.3  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6988  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.9 
 
 		 321 aa  86.3  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.955894  hitchhiker  0.000428726 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  27.24 
 
 		 317 aa  86.3  7e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  25.8 
 
 		 320 aa  86.3  8e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  26.44 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  26.19 
 
 		 358 aa  85.5  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2956  Polyprenyl synthetase  27.99 
 
 		 308 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.660662  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  28.38 
 
 		 324 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  26.35 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  30 
 
 		 361 aa  84.7  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>