More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2787 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  100 
 
 		 355 aa  712    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  74.12 
 
 		 358 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  60.29 
 
 		 353 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  56.2 
 
 		 356 aa  342  8e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  53.33 
 
 		 360 aa  341  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  52.79 
 
 		 365 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  51.54 
 
 		 367 aa  315  7e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  50.29 
 
 		 360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  50.43 
 
 		 357 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  51.87 
 
 		 360 aa  297  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.61 
 
 		 361 aa  280  3e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  48.28 
 
 		 358 aa  278  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  45.51 
 
 		 356 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  44.22 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  45.82 
 
 		 359 aa  257  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  53.7 
 
 		 634 aa  256  4e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  46.65 
 
 		 364 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  44.61 
 
 		 364 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  46.51 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  45.87 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  45.87 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  45.87 
 
 		 359 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  43.06 
 
 		 362 aa  244  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.68 
 
 		 362 aa  243  3.9999999999999997e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  42.82 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  42.82 
 
 		 374 aa  239  5e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  42.82 
 
 		 374 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  43.55 
 
 		 361 aa  235  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  43.26 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  43.62 
 
 		 375 aa  233  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  45.43 
 
 		 371 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  50.8 
 
 		 362 aa  229  5e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  43.21 
 
 		 352 aa  229  6e-59  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  42.66 
 
 		 365 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  43.45 
 
 		 384 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  44.28 
 
 		 377 aa  223  3e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.42 
 
 		 369 aa  221  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.81 
 
 		 373 aa  206  6e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  39.51 
 
 		 376 aa  205  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  39.71 
 
 		 350 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  41.83 
 
 		 1155 aa  205  1e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  40.84 
 
 		 362 aa  202  9e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.86 
 
 		 347 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  37.46 
 
 		 368 aa  196  7e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  42.5 
 
 		 380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.85 
 
 		 377 aa  183  3e-45  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  40.66 
 
 		 385 aa  183  3e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  36.1 
 
 		 350 aa  182  6e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  37.81 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  37.81 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  37.81 
 
 		 418 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.73 
 
 		 345 aa  129  6e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  32.49 
 
 		 330 aa  127  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.67 
 
 		 360 aa  126  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  31.21 
 
 		 332 aa  125  2e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  24.2 
 
 		 341 aa  123  4e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  35.54 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  32.63 
 
 		 313 aa  116  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  28.06 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  26.04 
 
 		 368 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  31.42 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  29.94 
 
 		 327 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.04 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  33.81 
 
 		 327 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.02 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  26.71 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  31.67 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 359 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  29.32 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  28.18 
 
 		 337 aa  107  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  26.85 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.88 
 
 		 324 aa  106  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  30.72 
 
 		 334 aa  106  5e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  31.37 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  28.87 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  27.17 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.93 
 
 		 332 aa  105  8e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  32.09 
 
 		 366 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  28.06 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.07 
 
 		 348 aa  105  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  30.06 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  29.84 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  31.41 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  32.75 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  29.8 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  27.82 
 
 		 317 aa  104  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  31.6 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  29.8 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  31.29 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  29.8 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  30.37 
 
 		 343 aa  103  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3524  octaprenyl-diphosphate synthase  32.43 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.438623  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  29.66 
 
 		 322 aa  103  6e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3527  octaprenyl-diphosphate synthase  32.43 
 
 		 332 aa  103  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.491243  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  27.27 
 
 		 332 aa  102  7e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0208  trans-hexaprenyltranstransferase  31.11 
 
 		 321 aa  102  7e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.647597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.66 
 
 		 322 aa  102  8e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>