More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1911 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 362 aa  684    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  48.94 
 
 		 365 aa  267  2e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  52.79 
 
 		 372 aa  258  1e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  50.88 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  50.8 
 
 		 355 aa  256  6e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  50.32 
 
 		 353 aa  252  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.19 
 
 		 369 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  48.01 
 
 		 364 aa  245  9e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  47.63 
 
 		 364 aa  242  7e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  49.04 
 
 		 358 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  44.73 
 
 		 360 aa  240  4e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  46.83 
 
 		 367 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  53.08 
 
 		 360 aa  229  6e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.4 
 
 		 362 aa  226  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  47.93 
 
 		 373 aa  222  7e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 377 aa  219  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  45.9 
 
 		 358 aa  215  8e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.48 
 
 		 361 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  48.65 
 
 		 356 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  48.44 
 
 		 357 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 368 aa  211  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  53.01 
 
 		 634 aa  206  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  50.81 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  43.85 
 
 		 359 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  43.12 
 
 		 359 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  46.96 
 
 		 362 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 362 aa  194  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  41.86 
 
 		 375 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  43.48 
 
 		 356 aa  189  7e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  44.38 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  44.65 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  44.65 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  44.65 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  48.66 
 
 		 384 aa  177  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  43.26 
 
 		 361 aa  172  1e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 384 aa  171  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  47.02 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  40.96 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  43.28 
 
 		 376 aa  165  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  39.04 
 
 		 371 aa  164  3e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 374 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.21 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  39.66 
 
 		 374 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  39.54 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.32 
 
 		 360 aa  160  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  34.06 
 
 		 350 aa  158  1e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  49.16 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  38.38 
 
 		 347 aa  153  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  38.67 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  38.67 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  38.67 
 
 		 418 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  40.08 
 
 		 1155 aa  144  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.26 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.25 
 
 		 361 aa  125  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  31.21 
 
 		 368 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 347 aa  120  4.9999999999999996e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  25.83 
 
 		 341 aa  115  7.999999999999999e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.87 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.43 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  29.77 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  28.83 
 
 		 326 aa  108  2e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  34.01 
 
 		 330 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.56 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  33.33 
 
 		 342 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.59 
 
 		 322 aa  106  8e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.7 
 
 		 345 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  34.59 
 
 		 327 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.8 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1513  farnesyl-diphosphate synthase  35.29 
 
 		 297 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.91 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.81 
 
 		 331 aa  104  3e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  29.11 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  32.06 
 
 		 334 aa  103  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  31.75 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  28.31 
 
 		 332 aa  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  29.1 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1916  Polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 294 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  30.61 
 
 		 320 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  38.78 
 
 		 366 aa  101  3e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  30.98 
 
 		 327 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  34.46 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  31.65 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  31.14 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  34.62 
 
 		 359 aa  99.8  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  28.21 
 
 		 332 aa  99.4  8e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  29.01 
 
 		 330 aa  99.4  9e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  33.23 
 
 		 322 aa  99.4  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  31.19 
 
 		 313 aa  99  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 386 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 337 aa  98.6  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  30.61 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  29.69 
 
 		 324 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  35.31 
 
 		 334 aa  98.6  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  27.91 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  30.07 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  27.44 
 
 		 326 aa  97.4  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  32.99 
 
 		 349 aa  97.1  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.98 
 
 		 322 aa  97.1  4e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>