More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2503 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 385 aa  749    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.79 
 
 		 361 aa  201  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  43.28 
 
 		 356 aa  196  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  41.98 
 
 		 359 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  42.63 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  40.49 
 
 		 359 aa  189  8e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  47.84 
 
 		 634 aa  185  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 361 aa  185  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  41.24 
 
 		 355 aa  184  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  41.18 
 
 		 376 aa  183  4.0000000000000006e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  39.94 
 
 		 353 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  41.1 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  38.94 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  41.36 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  38.1 
 
 		 358 aa  179  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  41.12 
 
 		 367 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  39.72 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  38.4 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  47.14 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  39.55 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  42.19 
 
 		 365 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  40.06 
 
 		 364 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  43.04 
 
 		 377 aa  173  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  39.76 
 
 		 371 aa  172  9e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  39.46 
 
 		 374 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  39.43 
 
 		 1155 aa  170  5e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  38.12 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  37.17 
 
 		 368 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  41.39 
 
 		 356 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  41.1 
 
 		 360 aa  167  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  39.52 
 
 		 374 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.58 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  45.31 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  44.1 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.76 
 
 		 369 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  38.61 
 
 		 364 aa  163  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  40.36 
 
 		 375 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  39.08 
 
 		 352 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  39.03 
 
 		 347 aa  156  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  39.81 
 
 		 362 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  40.98 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  31.54 
 
 		 350 aa  144  2e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.86 
 
 		 373 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.31 
 
 		 377 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  31.51 
 
 		 326 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  35.17 
 
 		 350 aa  126  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  31.62 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  32.48 
 
 		 317 aa  122  8e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  28.74 
 
 		 323 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 317 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  30.29 
 
 		 317 aa  120  6e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 418 aa  119  7e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 418 aa  119  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  29.7 
 
 		 324 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 331 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  31.2 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.93 
 
 		 364 aa  112  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  27.57 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.13 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  32.41 
 
 		 323 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  29.32 
 
 		 323 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  28.52 
 
 		 331 aa  110  5e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.47 
 
 		 325 aa  109  7.000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  29.35 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  31.72 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  26.92 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.06 
 
 		 325 aa  108  2e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.77 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.28 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2618  farnesyl-diphosphate synthase  35.83 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13433  multi-functional geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA1: dimethylallyltransferase + geranyltranstransferase + farnesyltranstransferase  33.21 
 
 		 359 aa  107  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.17 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  24.76 
 
 		 341 aa  106  7e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  29.07 
 
 		 327 aa  106  7e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  34.01 
 
 		 338 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  31.28 
 
 		 330 aa  105  9e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0483  Polyprenyl synthetase  34.23 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  35.87 
 
 		 336 aa  105  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  31.83 
 
 		 338 aa  105  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  33.67 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1417  polyprenyl synthetase  34.68 
 
 		 296 aa  105  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.88 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  30.85 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  33.07 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  31.03 
 
 		 299 aa  104  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  32.57 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  30 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  32.96 
 
 		 323 aa  103  6e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  27.62 
 
 		 324 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.23 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751296  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  30.4 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.89 
 
 		 340 aa  102  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.89 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>