More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_2975 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 359 aa  712    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  87.74 
 
 		 359 aa  633  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  76.6 
 
 		 359 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  76.6 
 
 		 359 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  76.6 
 
 		 359 aa  511  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  66.76 
 
 		 352 aa  434  1e-120  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  50.99 
 
 		 362 aa  297  2e-79  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  45.96 
 
 		 356 aa  296  3e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  45.05 
 
 		 361 aa  295  1e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  47.25 
 
 		 376 aa  291  1e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 353 aa  280  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  44.67 
 
 		 360 aa  279  6e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  47.43 
 
 		 360 aa  273  4.0000000000000004e-72  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  48.99 
 
 		 357 aa  271  9e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  47.14 
 
 		 360 aa  256  4e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  46.27 
 
 		 367 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 365 aa  252  9.000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  44.21 
 
 		 355 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  49.35 
 
 		 358 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  44.21 
 
 		 358 aa  246  3e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  45.64 
 
 		 375 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  45.93 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  46.45 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  47.26 
 
 		 634 aa  238  2e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  42.18 
 
 		 377 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.95 
 
 		 362 aa  226  4e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  45.23 
 
 		 377 aa  224  1e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  43.94 
 
 		 384 aa  224  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  40.56 
 
 		 364 aa  221  9.999999999999999e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  43.92 
 
 		 384 aa  218  2e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  46.42 
 
 		 365 aa  218  2e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  38.76 
 
 		 364 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  39.43 
 
 		 380 aa  209  9e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.76 
 
 		 369 aa  208  1e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  39.62 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 374 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.2 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 374 aa  200  3e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  41.21 
 
 		 372 aa  199  9e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  40.19 
 
 		 362 aa  195  8.000000000000001e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  42.39 
 
 		 385 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.71 
 
 		 373 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  38.29 
 
 		 368 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  39.05 
 
 		 1155 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 362 aa  172  9e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  37.29 
 
 		 350 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.86 
 
 		 347 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 418 aa  162  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  33 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.63 
 
 		 326 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.95 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  28.71 
 
 		 324 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.81 
 
 		 341 aa  122  9.999999999999999e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  29.58 
 
 		 323 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  30.37 
 
 		 368 aa  119  7.999999999999999e-26  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  33.78 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.79 
 
 		 360 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.43 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  28.96 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  32.77 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  29.01 
 
 		 337 aa  112  7.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  34.18 
 
 		 346 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  29.77 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.37 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  32.93 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.87 
 
 		 325 aa  110  3e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  29.29 
 
 		 332 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  29.41 
 
 		 322 aa  110  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.36 
 
 		 364 aa  109  6e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  28.47 
 
 		 332 aa  108  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.57 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  30.72 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  32.06 
 
 		 323 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  28.27 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2372  Polyprenyl synthetase  29.81 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.550389  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1765  geranyltranstransferase  28.72 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.281488 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  28.77 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.88 
 
 		 345 aa  106  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.8 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  26.86 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  27.3 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  27.83 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  32.65 
 
 		 325 aa  104  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  28.27 
 
 		 317 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  31.88 
 
 		 338 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  31.38 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.62 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1777  geranyltranstransferase  37.39 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.66005  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  31.07 
 
 		 338 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  28.14 
 
 		 331 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  31.36 
 
 		 322 aa  102  7e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  35.59 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.7 
 
 		 337 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1816  geranyltranstransferase  30.89 
 
 		 321 aa  102  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.204305  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  30.53 
 
 		 338 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  29.94 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  28.87 
 
 		 349 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>