More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3478 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 360 aa  704    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  92.78 
 
 		 360 aa  608  1e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  60.91 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  53.78 
 
 		 360 aa  345  8.999999999999999e-94  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  55.37 
 
 		 367 aa  343  2e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  57.98 
 
 		 353 aa  338  9e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  51.65 
 
 		 365 aa  335  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.68 
 
 		 361 aa  326  4.0000000000000003e-88  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  54.26 
 
 		 356 aa  318  1e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  49.55 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  49.71 
 
 		 356 aa  300  3e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  54.49 
 
 		 375 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  50.59 
 
 		 358 aa  295  7e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  50.86 
 
 		 358 aa  291  2e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  47.69 
 
 		 359 aa  283  5.000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  48.27 
 
 		 359 aa  282  6.000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  55.02 
 
 		 634 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.24 
 
 		 362 aa  278  1e-73  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  51.66 
 
 		 369 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  49.42 
 
 		 364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 364 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  50.83 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 377 aa  259  5.0000000000000005e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  48.05 
 
 		 352 aa  258  1e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  45.98 
 
 		 362 aa  256  5e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  46.38 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  46.38 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  46.38 
 
 		 359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  48.49 
 
 		 372 aa  249  5e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  50.43 
 
 		 384 aa  246  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  48.26 
 
 		 362 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  44.17 
 
 		 376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  47.13 
 
 		 361 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  49.56 
 
 		 384 aa  237  3e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  43.12 
 
 		 374 aa  229  5e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  46.03 
 
 		 368 aa  229  7e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  41.91 
 
 		 371 aa  228  1e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  42.81 
 
 		 374 aa  227  3e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  53.08 
 
 		 362 aa  221  9.999999999999999e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  41.83 
 
 		 347 aa  218  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  44.29 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  40.62 
 
 		 1155 aa  213  4.9999999999999996e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  40.56 
 
 		 380 aa  210  2e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.31 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  41.31 
 
 		 350 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.44 
 
 		 377 aa  200  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  41.06 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 350 aa  188  2e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  39.7 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  40.58 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  40.58 
 
 		 418 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.47 
 
 		 360 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.58 
 
 		 341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.87 
 
 		 364 aa  125  9e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  32.91 
 
 		 322 aa  125  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  27.79 
 
 		 317 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.15 
 
 		 332 aa  122  9.999999999999999e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  30.4 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  26.89 
 
 		 317 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.85 
 
 		 345 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  29.47 
 
 		 332 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.29 
 
 		 323 aa  119  9e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.36 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  34.58 
 
 		 349 aa  117  5e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  30.72 
 
 		 348 aa  116  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  30.84 
 
 		 330 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.39 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 313 aa  115  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  28.09 
 
 		 320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  33.96 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  28.48 
 
 		 332 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  30.22 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0340  trans-hexaprenyltranstransferase  31.65 
 
 		 321 aa  113  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104163  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  31.48 
 
 		 327 aa  113  5e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  30.45 
 
 		 331 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.78 
 
 		 354 aa  112  7.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  28.42 
 
 		 337 aa  112  8.000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  28.38 
 
 		 337 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  31.48 
 
 		 347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  30.41 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  28.76 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  32.73 
 
 		 327 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29.62 
 
 		 324 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  29.02 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  29.33 
 
 		 324 aa  110  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  33.1 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  29.74 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  25.99 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  30.28 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  33.72 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  29.93 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  31.03 
 
 		 327 aa  109  8.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  29.21 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  29.21 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  30.87 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  30.17 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>