More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1430 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 368 aa  728    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  52.86 
 
 		 369 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  43.43 
 
 		 365 aa  227  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  38.7 
 
 		 360 aa  225  1e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 364 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  41.07 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  44.13 
 
 		 364 aa  215  9.999999999999999e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 353 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  46.03 
 
 		 360 aa  212  7e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 357 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  41.93 
 
 		 356 aa  206  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  39.83 
 
 		 358 aa  204  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.25 
 
 		 361 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.06 
 
 		 362 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  47.57 
 
 		 372 aa  199  3.9999999999999996e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  43.58 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  37.53 
 
 		 365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  37.43 
 
 		 355 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  42.72 
 
 		 362 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 359 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  47.58 
 
 		 376 aa  189  5e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  38.44 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  38.29 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  39.76 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  41.61 
 
 		 634 aa  186  4e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  39.18 
 
 		 356 aa  182  7e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.26 
 
 		 373 aa  176  6e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  39.05 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  39.05 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  39.05 
 
 		 359 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  39.02 
 
 		 361 aa  170  4e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 371 aa  168  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  38.51 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  37.93 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  36.08 
 
 		 377 aa  167  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.93 
 
 		 377 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  38.59 
 
 		 385 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  41.58 
 
 		 384 aa  158  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  43.75 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.57 
 
 		 360 aa  155  9e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  39.17 
 
 		 384 aa  154  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  28.89 
 
 		 350 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 362 aa  152  1e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  35.27 
 
 		 1155 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  38.41 
 
 		 380 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  39.75 
 
 		 374 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  37.45 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  37.45 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  29.47 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  34.78 
 
 		 347 aa  129  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.28 
 
 		 382 aa  129  8.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  33.44 
 
 		 347 aa  127  2.0000000000000002e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.82 
 
 		 361 aa  123  5e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  36.18 
 
 		 350 aa  119  9e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 313 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  27.81 
 
 		 317 aa  116  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.64 
 
 		 345 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.03 
 
 		 364 aa  115  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  28.93 
 
 		 317 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  32.97 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  29.21 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  29.78 
 
 		 331 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.65 
 
 		 340 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.19 
 
 		 331 aa  113  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  27.65 
 
 		 317 aa  113  5e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 339 aa  112  8.000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.41 
 
 		 332 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  27.16 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  32.85 
 
 		 359 aa  111  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.49 
 
 		 334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  34.11 
 
 		 336 aa  110  3e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3354  trans-hexaprenyltranstransferase  31.58 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00431304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  28.22 
 
 		 317 aa  109  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  28 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.18 
 
 		 338 aa  109  9.000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29.78 
 
 		 324 aa  109  9.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  29.82 
 
 		 323 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  30.28 
 
 		 345 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  32.49 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  32.49 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  32.49 
 
 		 418 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  30.72 
 
 		 336 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.65 
 
 		 334 aa  108  2e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  33.33 
 
 		 327 aa  108  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  28.31 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  29.01 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  31.64 
 
 		 327 aa  107  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  30.26 
 
 		 336 aa  107  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 338 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.78 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  30 
 
 		 320 aa  107  4e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  29.01 
 
 		 336 aa  107  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  29.69 
 
 		 322 aa  106  6e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3739  trans-hexaprenyltranstransferase  28.31 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000225438  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  29.46 
 
 		 322 aa  106  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  30.41 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  30.38 
 
 		 336 aa  106  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.12 
 
 		 351 aa  106  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  29.87 
 
 		 327 aa  105  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>