More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3110 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 360 aa  720    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  66.48 
 
 		 356 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  58.5 
 
 		 353 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  53.1 
 
 		 358 aa  347  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  50.41 
 
 		 365 aa  345  1e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  53.78 
 
 		 360 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  52.97 
 
 		 367 aa  332  6e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  53.15 
 
 		 355 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  54.65 
 
 		 360 aa  313  1.9999999999999998e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.15 
 
 		 362 aa  307  2.0000000000000002e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.86 
 
 		 361 aa  306  3e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  49.71 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  49.85 
 
 		 364 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  51.02 
 
 		 364 aa  299  4e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  49.03 
 
 		 357 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  49.42 
 
 		 358 aa  288  7e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  50.29 
 
 		 375 aa  282  7.000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  44.17 
 
 		 359 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  45 
 
 		 359 aa  279  6e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  46.38 
 
 		 359 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  46.38 
 
 		 359 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  46.38 
 
 		 359 aa  275  6e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  53.99 
 
 		 634 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  44.23 
 
 		 362 aa  264  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  44.51 
 
 		 365 aa  251  2e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  45.95 
 
 		 372 aa  246  3e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.05 
 
 		 369 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  45.1 
 
 		 377 aa  241  2e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  45.76 
 
 		 377 aa  239  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  41.74 
 
 		 352 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  48.87 
 
 		 361 aa  237  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  42.24 
 
 		 347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  40.43 
 
 		 376 aa  232  8.000000000000001e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  42.86 
 
 		 371 aa  231  1e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  42.22 
 
 		 374 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  42.22 
 
 		 374 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  41.57 
 
 		 1155 aa  228  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  41.9 
 
 		 374 aa  228  1e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 368 aa  226  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  45.56 
 
 		 384 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  42.28 
 
 		 362 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  45.04 
 
 		 384 aa  219  3.9999999999999997e-56  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.22 
 
 		 373 aa  219  7e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  44.73 
 
 		 362 aa  216  4e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  41.69 
 
 		 350 aa  212  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.89 
 
 		 377 aa  206  4e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  46.18 
 
 		 380 aa  206  6e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  40.26 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  33.87 
 
 		 350 aa  183  3e-45  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  38.24 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  38.24 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  38.24 
 
 		 418 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.19 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.07 
 
 		 382 aa  125  1e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.46 
 
 		 332 aa  124  4e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  30.2 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  30.57 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.53 
 
 		 341 aa  118  1.9999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  30.29 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  31.35 
 
 		 327 aa  116  6e-25  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 336 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  27.07 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  34.15 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  34.15 
 
 		 322 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  29.22 
 
 		 325 aa  113  5e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  34.15 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  33.8 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  27.43 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.9 
 
 		 345 aa  111  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  29.3 
 
 		 327 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  30.37 
 
 		 337 aa  110  3e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  32.59 
 
 		 322 aa  110  4.0000000000000004e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  28.99 
 
 		 323 aa  110  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  32.96 
 
 		 322 aa  109  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.55 
 
 		 343 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  37.19 
 
 		 322 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  27.65 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  32.17 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  29 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  26.67 
 
 		 343 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.43 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.38 
 
 		 339 aa  107  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  27.61 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  28.57 
 
 		 322 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.47 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.33 
 
 		 330 aa  107  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  27.1 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  28.91 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.59 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  31.82 
 
 		 322 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  27.06 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  31.73 
 
 		 327 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  29.43 
 
 		 317 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  32.59 
 
 		 327 aa  103  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  34.74 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  34.14 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  31.03 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>