More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_14310 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 377 aa  732    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  40.57 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.75 
 
 		 361 aa  220  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  40.3 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  40.74 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.87 
 
 		 362 aa  205  9e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  38.51 
 
 		 365 aa  202  7e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  37.05 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  38.2 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  41.28 
 
 		 377 aa  199  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  41.46 
 
 		 358 aa  199  7.999999999999999e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  37.63 
 
 		 359 aa  196  7e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  39.22 
 
 		 377 aa  195  9e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  42.14 
 
 		 356 aa  191  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  37.99 
 
 		 357 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  39.44 
 
 		 360 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  38.85 
 
 		 358 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  39.59 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  42.09 
 
 		 365 aa  186  6e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  37.85 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  38.78 
 
 		 353 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  38.9 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  38.9 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  38.9 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  40.68 
 
 		 360 aa  180  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 634 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  38.33 
 
 		 364 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  38.97 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  38.97 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  38.97 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  43.42 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  36.42 
 
 		 364 aa  172  1e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  37.83 
 
 		 362 aa  172  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  36.64 
 
 		 371 aa  169  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  36.52 
 
 		 1155 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.57 
 
 		 369 aa  165  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  39.93 
 
 		 368 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  46.35 
 
 		 380 aa  159  6e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  40.31 
 
 		 361 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  39.63 
 
 		 352 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  36.29 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  36.29 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  36.29 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  35.85 
 
 		 347 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  39.38 
 
 		 350 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  41.21 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  36.09 
 
 		 384 aa  139  7e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.13 
 
 		 360 aa  139  7e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 384 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  27.81 
 
 		 350 aa  133  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.38 
 
 		 373 aa  132  9e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  36.49 
 
 		 385 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  28.57 
 
 		 368 aa  122  9.999999999999999e-27  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 336 aa  113  7.000000000000001e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.79 
 
 		 361 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  29.23 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  25.9 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  30.19 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  29.81 
 
 		 317 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.6 
 
 		 358 aa  105  9e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.38 
 
 		 364 aa  104  3e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  26.04 
 
 		 320 aa  103  5e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  28.47 
 
 		 317 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  26.19 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  31.97 
 
 		 332 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0472  farnesyltranstransferase  29.51 
 
 		 327 aa  101  2e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0424008  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  34.1 
 
 		 329 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  31.69 
 
 		 348 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2351  polyprenyl synthetase  30.83 
 
 		 386 aa  99.8  7e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.777136 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  30.16 
 
 		 347 aa  99.4  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2312  polyprenyl synthetase  30.83 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  27.21 
 
 		 324 aa  99  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2359  polyprenyl synthetase  30.83 
 
 		 386 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.852076  normal  0.554984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  32.08 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  29.79 
 
 		 322 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  29.43 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  28.73 
 
 		 349 aa  97.4  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 334 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  27.36 
 
 		 321 aa  97.1  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  26.89 
 
 		 332 aa  96.3  9e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  25.35 
 
 		 332 aa  95.9  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  28.18 
 
 		 324 aa  95.5  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.53 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.29 
 
 		 382 aa  94.4  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.21 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0496  dimethylallyltransferase  31.65 
 
 		 575 aa  93.6  5e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.432422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  27.34 
 
 		 325 aa  93.2  8e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.87 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  28.92 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  28.09 
 
 		 322 aa  92.4  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  30.21 
 
 		 332 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.61 
 
 		 331 aa  91.3  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  27.71 
 
 		 322 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  25.87 
 
 		 332 aa  90.1  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.81 
 
 		 325 aa  90.1  6e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34113  predicted protein  28.33 
 
 		 348 aa  89.7  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.176681 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  27.71 
 
 		 344 aa  88.2  2e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  28.37 
 
 		 326 aa  88.6  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  27.56 
 
 		 334 aa  88.2  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>