More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12201 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  100 
 
 		 352 aa  695    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  66.76 
 
 		 359 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  67.61 
 
 		 359 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  69.14 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  69.14 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  69.14 
 
 		 359 aa  434  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  45.94 
 
 		 356 aa  280  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  49.24 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.15 
 
 		 361 aa  272  7e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  48.31 
 
 		 362 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  48.05 
 
 		 360 aa  258  2e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  45.69 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  44.51 
 
 		 365 aa  252  7e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  41.74 
 
 		 360 aa  246  4e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  44.88 
 
 		 375 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  44.6 
 
 		 367 aa  236  4e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  43.48 
 
 		 356 aa  235  9e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  46.25 
 
 		 360 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  46.65 
 
 		 361 aa  233  4.0000000000000004e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  47.28 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  43.32 
 
 		 355 aa  227  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  44.09 
 
 		 357 aa  225  7e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  49.22 
 
 		 634 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  42.3 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  39.15 
 
 		 364 aa  216  5.9999999999999996e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  47.42 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  37.18 
 
 		 364 aa  211  1e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  41 
 
 		 377 aa  209  7e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  43.34 
 
 		 384 aa  206  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  39.31 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  43.15 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  43.21 
 
 		 365 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.67 
 
 		 369 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  39.38 
 
 		 374 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.08 
 
 		 362 aa  188  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  39.06 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  39.06 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  40.76 
 
 		 362 aa  182  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.69 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  39.88 
 
 		 372 aa  179  8e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 368 aa  176  4e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  44.06 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  39.75 
 
 		 1155 aa  175  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  36.99 
 
 		 371 aa  170  4e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.07 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  38.8 
 
 		 385 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.7 
 
 		 347 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  41.53 
 
 		 418 aa  153  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  41.53 
 
 		 418 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  41.53 
 
 		 418 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  37.12 
 
 		 350 aa  149  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  30.51 
 
 		 350 aa  142  8e-33  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  27.1 
 
 		 341 aa  123  5e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  29.3 
 
 		 323 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  34.73 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  28.66 
 
 		 324 aa  115  8.999999999999998e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  31.4 
 
 		 326 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.08 
 
 		 360 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  31.15 
 
 		 338 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  34.49 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  31.03 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.14 
 
 		 382 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.46 
 
 		 364 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  31.85 
 
 		 338 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  27.04 
 
 		 324 aa  108  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  29.49 
 
 		 317 aa  107  3e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.03 
 
 		 325 aa  107  4e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  28.83 
 
 		 320 aa  106  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1844  Polyprenyl synthetase  27.44 
 
 		 321 aa  105  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  36 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.11 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  29.97 
 
 		 323 aa  103  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  32.41 
 
 		 366 aa  103  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5921  Polyprenyl synthetase  34.42 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.214743  normal  0.354023 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  28.62 
 
 		 337 aa  103  4e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  30.24 
 
 		 324 aa  102  7e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  29.87 
 
 		 337 aa  102  9e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.8 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  29.88 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  25.15 
 
 		 332 aa  101  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  32.87 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1275  Polyprenyl synthetase  33.03 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.360405  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0150  polyprenyl synthetase  29.75 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  28.67 
 
 		 332 aa  100  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  32.22 
 
 		 334 aa  100  4e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.56 
 
 		 322 aa  100  5e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1206  polyprenyl synthetase  28.85 
 
 		 334 aa  100  5e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.513986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  28.31 
 
 		 344 aa  99.4  9e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  38.92 
 
 		 329 aa  99.4  9e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 331 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1628  Polyprenyl synthetase  34.09 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.310703 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 331 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  27.11 
 
 		 326 aa  99  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  30 
 
 		 323 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  29.72 
 
 		 333 aa  98.6  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3432  farnesyl-diphosphate synthase  33.46 
 
 		 315 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  29.9 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>