More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2061 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 372 aa  720    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  55.62 
 
 		 365 aa  339  5e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  56.84 
 
 		 369 aa  325  1e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  47.87 
 
 		 365 aa  280  4e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  48.36 
 
 		 367 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  47.34 
 
 		 360 aa  269  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.98 
 
 		 361 aa  264  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  47.72 
 
 		 357 aa  261  1e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  52.79 
 
 		 362 aa  260  3e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  46.86 
 
 		 355 aa  258  1e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  47.21 
 
 		 353 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  48.08 
 
 		 358 aa  253  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  48.49 
 
 		 360 aa  252  7e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  45.98 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  49.69 
 
 		 377 aa  245  8e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  49.04 
 
 		 360 aa  240  2e-62  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.65 
 
 		 362 aa  241  2e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  45.86 
 
 		 364 aa  241  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  48.32 
 
 		 356 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  46.45 
 
 		 364 aa  235  8e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  43.92 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.24 
 
 		 373 aa  221  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  45.35 
 
 		 362 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  43.77 
 
 		 359 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  44.55 
 
 		 368 aa  218  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  41.21 
 
 		 359 aa  214  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  51.21 
 
 		 634 aa  212  9e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  43.6 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  43.6 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  43.6 
 
 		 359 aa  211  2e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  44.99 
 
 		 375 aa  209  6e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  42.16 
 
 		 376 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  43.42 
 
 		 377 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  44.44 
 
 		 377 aa  197  3e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  39.63 
 
 		 371 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  42.57 
 
 		 361 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  48.68 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  45.03 
 
 		 384 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  42.4 
 
 		 380 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  39.51 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  39.51 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  39.21 
 
 		 374 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 362 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 347 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  41.5 
 
 		 352 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  38.89 
 
 		 350 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  41.55 
 
 		 385 aa  169  8e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  40.13 
 
 		 418 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  40.13 
 
 		 418 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  40.13 
 
 		 418 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.73 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  29.66 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  36.27 
 
 		 1155 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  28.19 
 
 		 368 aa  127  4.0000000000000003e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  35.49 
 
 		 336 aa  122  8e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  33.95 
 
 		 347 aa  121  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  40.71 
 
 		 329 aa  121  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.52 
 
 		 382 aa  118  9.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  34.3 
 
 		 332 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2135  geranyltranstransferase  33.08 
 
 		 327 aa  113  6e-24  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0551821  decreased coverage  0.00000978796 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.86 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03732  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.69 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.100816  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  30.86 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  24.11 
 
 		 332 aa  102  9e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.01 
 
 		 341 aa  102  9e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  29.08 
 
 		 326 aa  102  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49325  predicted protein  30.59 
 
 		 343 aa  101  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.6 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  28.33 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  29.67 
 
 		 320 aa  100  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  30.31 
 
 		 325 aa  100  5e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.19 
 
 		 325 aa  99.8  7e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  31.87 
 
 		 299 aa  99.4  8e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.48 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  33.74 
 
 		 334 aa  97.4  3e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  32.53 
 
 		 327 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3672  Polyprenyl synthetase  27.57 
 
 		 323 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00904172  normal  0.171557 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.53 
 
 		 354 aa  96.7  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.51 
 
 		 337 aa  96.7  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  32.1 
 
 		 334 aa  96.3  7e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  30.58 
 
 		 349 aa  96.3  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  33.19 
 
 		 338 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  26.97 
 
 		 324 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  29.94 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  37.29 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  29.54 
 
 		 323 aa  95.1  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  28.34 
 
 		 317 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  33.88 
 
 		 359 aa  95.1  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 332 aa  94  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  35.51 
 
 		 334 aa  94  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 324 aa  94.4  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.27 
 
 		 323 aa  94  4e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  32.91 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  26.39 
 
 		 324 aa  93.6  5e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  28.08 
 
 		 317 aa  93.6  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3130  trans-hexaprenyltranstransferase  31.84 
 
 		 367 aa  93.6  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  29.76 
 
 		 319 aa  93.2  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2399  farnesyltranstransferase  31.09 
 
 		 322 aa  92  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0453989  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  33.73 
 
 		 366 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>