More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5453 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 374 aa  736    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  99.47 
 
 		 374 aa  733    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  99.47 
 
 		 374 aa  733    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  63.4 
 
 		 371 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  56.82 
 
 		 1155 aa  388  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  44.31 
 
 		 358 aa  228  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  43.07 
 
 		 355 aa  228  1e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  41.9 
 
 		 360 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  43.14 
 
 		 353 aa  224  2e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  39.6 
 
 		 365 aa  221  9.999999999999999e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  43.12 
 
 		 360 aa  218  1e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.71 
 
 		 362 aa  214  2.9999999999999995e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  42.28 
 
 		 361 aa  211  1e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  40 
 
 		 359 aa  209  4e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  43.18 
 
 		 358 aa  209  9e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  44.64 
 
 		 634 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  40.62 
 
 		 367 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  41.71 
 
 		 375 aa  205  1e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  43 
 
 		 357 aa  202  6e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  41.48 
 
 		 360 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 359 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  38.35 
 
 		 356 aa  195  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  44.55 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  40.76 
 
 		 356 aa  193  4e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  40.78 
 
 		 362 aa  191  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  39.38 
 
 		 352 aa  182  6e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 359 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  38.56 
 
 		 347 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  40.57 
 
 		 361 aa  177  3e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.97 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  41.92 
 
 		 377 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.73 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  42.76 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 376 aa  169  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  38.11 
 
 		 377 aa  169  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  39.21 
 
 		 372 aa  168  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  39.31 
 
 		 385 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 365 aa  163  6e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  35.98 
 
 		 364 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  36 
 
 		 364 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  37.75 
 
 		 350 aa  157  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  42.58 
 
 		 380 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  39.75 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.63 
 
 		 373 aa  146  7.0000000000000006e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  39.66 
 
 		 362 aa  142  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  34.64 
 
 		 362 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  27.87 
 
 		 350 aa  138  1e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  35.16 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  35.16 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  35.16 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.04 
 
 		 364 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.15 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23090  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.22 
 
 		 335 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.55516  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.01 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13417  polyprenyl synthetase idsB  32.37 
 
 		 350 aa  107  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  27.63 
 
 		 337 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5744  Dimethylallyltranstransferase  30.56 
 
 		 323 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  25.98 
 
 		 317 aa  106  6e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0383  Polyprenyl synthetase  26.27 
 
 		 337 aa  104  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.955565  normal  0.0650374 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  28.07 
 
 		 331 aa  104  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0461  geranyltranstransferase (farnesyl-diphosphate synthase)  25.98 
 
 		 325 aa  103  5e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.215839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1604  Polyprenyl synthetase  31.6 
 
 		 343 aa  102  7e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.643499 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0384  polyprenyl synthetase  27.61 
 
 		 332 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.671664  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  24.57 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3215  Polyprenyl synthetase  34.39 
 
 		 334 aa  99.8  7e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.119356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3558  Polyprenyl synthetase  26.71 
 
 		 324 aa  99.4  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0315  Polyprenyl synthetase  25.57 
 
 		 332 aa  99  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.69 
 
 		 354 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  27.09 
 
 		 317 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  28.51 
 
 		 320 aa  97.4  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  25.68 
 
 		 317 aa  96.7  6e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  29.4 
 
 		 343 aa  96.3  8e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  26.74 
 
 		 317 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  30.79 
 
 		 346 aa  95.5  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  27.63 
 
 		 325 aa  95.1  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5714  polyprenyl synthetase  31.35 
 
 		 338 aa  94.7  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0414957  normal  0.844261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1263  polyprenyl synthetase  26.84 
 
 		 324 aa  94.7  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2632  farnesyl-diphosphate synthase  36.33 
 
 		 297 aa  94.4  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.76 
 
 		 321 aa  94  4e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  25.61 
 
 		 324 aa  94  4e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  33.09 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  29.26 
 
 		 323 aa  93.2  7e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0416  Polyprenyl synthetase  25.34 
 
 		 332 aa  93.2  7e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0642376 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  28.84 
 
 		 349 aa  92.8  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  29.02 
 
 		 323 aa  92  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  31.63 
 
 		 339 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.29 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.29 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  30.08 
 
 		 338 aa  91.7  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 323 aa  92  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.29 
 
 		 331 aa  91.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  31.29 
 
 		 331 aa  91.3  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0822  polyprenyl synthetase  30.82 
 
 		 338 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  29.57 
 
 		 351 aa  90.5  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  31.2 
 
 		 338 aa  90.1  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  26.06 
 
 		 332 aa  90.1  6e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6906  Geranylgeranyl pyrophosphate synthase-like protein  31.99 
 
 		 346 aa  89.7  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2027  trans-hexaprenyltranstransferase  29.46 
 
 		 331 aa  89.7  7e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>