More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_2291 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  99.76 
 
 		 418 aa  821    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  99.76 
 
 		 418 aa  821    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 418 aa  824    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.88 
 
 		 361 aa  208  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  36.44 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  41.59 
 
 		 359 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  40.84 
 
 		 356 aa  187  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  40.58 
 
 		 360 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  38.46 
 
 		 359 aa  181  2e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  42.19 
 
 		 365 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  38.31 
 
 		 353 aa  176  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  38.24 
 
 		 360 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  38.36 
 
 		 375 aa  172  7.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.29 
 
 		 377 aa  171  2e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  39.32 
 
 		 359 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  37.71 
 
 		 380 aa  169  8e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  40.96 
 
 		 634 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  38.48 
 
 		 360 aa  169  1e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  37.69 
 
 		 347 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  38.82 
 
 		 384 aa  167  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  40 
 
 		 367 aa  167  4e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  41.21 
 
 		 384 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  40.44 
 
 		 361 aa  165  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  35.78 
 
 		 365 aa  164  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  38.49 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  43.86 
 
 		 358 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  41.14 
 
 		 356 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 372 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  37.81 
 
 		 355 aa  164  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  37.23 
 
 		 376 aa  163  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  41.19 
 
 		 377 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  34.77 
 
 		 364 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 362 aa  158  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  41.72 
 
 		 352 aa  158  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  36.24 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  36.13 
 
 		 371 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  37.84 
 
 		 350 aa  153  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.58 
 
 		 369 aa  152  8.999999999999999e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  37.5 
 
 		 377 aa  149  6e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  35.46 
 
 		 1155 aa  149  7e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  35.37 
 
 		 364 aa  146  8.000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  39.94 
 
 		 362 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  35.26 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  35.26 
 
 		 374 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.33 
 
 		 362 aa  136  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  35.28 
 
 		 374 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.53 
 
 		 360 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  35.74 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  27.82 
 
 		 350 aa  126  9e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  33.57 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  27.22 
 
 		 317 aa  116  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  32.14 
 
 		 322 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.54 
 
 		 373 aa  115  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  24.7 
 
 		 341 aa  112  2.0000000000000002e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  28.41 
 
 		 368 aa  109  8.000000000000001e-23  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.57 
 
 		 337 aa  109  1e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  28.87 
 
 		 323 aa  108  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1446  isoprenyl synthetase  27.3 
 
 		 331 aa  107  3e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  33.2 
 
 		 333 aa  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  28.66 
 
 		 326 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  28.53 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0413  Polyprenyl synthetase  27.33 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0410  polyprenyl synthetase family protein  30.84 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.21047  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  28.83 
 
 		 323 aa  106  8e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0519  polyprenyl synthetase  30.7 
 
 		 356 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  33.1 
 
 		 319 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.33 
 
 		 330 aa  105  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  31.07 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.64 
 
 		 334 aa  104  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  30.09 
 
 		 322 aa  104  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  29.69 
 
 		 323 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  102  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  31.8 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  25 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1503  Dimethylallyltranstransferase  32.35 
 
 		 319 aa  101  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  29.04 
 
 		 323 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.77 
 
 		 361 aa  101  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  31.7 
 
 		 317 aa  101  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  29.03 
 
 		 322 aa  101  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  29.92 
 
 		 317 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_004310  BR0401  polyprenyl synthetase family protein  30.19 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  28.84 
 
 		 333 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  27.49 
 
 		 338 aa  100  6e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  29.96 
 
 		 317 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  25.16 
 
 		 332 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  28.27 
 
 		 313 aa  99.4  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  27.91 
 
 		 323 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  29.24 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  32.11 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  29.43 
 
 		 323 aa  98.2  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3653  octaprenyl-diphosphate synthase  27.76 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  27.87 
 
 		 323 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0447  octaprenyl-diphosphate synthase  30.04 
 
 		 330 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3491  octaprenyl-diphosphate synthase  30.04 
 
 		 330 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133442  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1306  octaprenyl-diphosphate synthase  30.04 
 
 		 330 aa  97.4  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  35.67 
 
 		 366 aa  97.4  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  28.01 
 
 		 331 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  28.01 
 
 		 331 aa  97.4  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>