More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1503 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_1503  Dimethylallyltranstransferase  100 
 
 		 319 aa  632  1e-180  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.29092 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0392  Dimethylallyltranstransferase  72.01 
 
 		 319 aa  445  1.0000000000000001e-124  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0147729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0496  dimethylallyltransferase  51.29 
 
 		 575 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.432422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.94 
 
 		 322 aa  179  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  34.77 
 
 		 317 aa  176  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  38.74 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  38.24 
 
 		 322 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3483  octaprenyl diphosphate synthase  36.09 
 
 		 323 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000324786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  33.53 
 
 		 323 aa  172  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  35.99 
 
 		 322 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03052  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0077638  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0520  Polyprenyl synthetase  35.76 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000996752  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3583  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000015877  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3673  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000447788  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3380  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.3954399999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03003  hypothetical protein  35.76 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00507808  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0513  octaprenyl diphosphate synthase  35.76 
 
 		 323 aa  172  5.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000265793  normal  0.0203333 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  35.92 
 
 		 322 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4509  octaprenyl diphosphate synthase  34.7 
 
 		 323 aa  172  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000159787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0953  trans-hexaprenyltranstransferase  37.87 
 
 		 323 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0940385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  34.07 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  34.94 
 
 		 322 aa  170  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3602  octaprenyl diphosphate synthase  34.29 
 
 		 370 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0102331  normal  0.778789 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3664  octaprenyl diphosphate synthase  34.29 
 
 		 370 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000479372  normal  0.0578061 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3495  octaprenyl diphosphate synthase  34.29 
 
 		 370 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000567296  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3566  octaprenyl diphosphate synthase  34.29 
 
 		 370 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000499434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3497  octaprenyl diphosphate synthase  34.29 
 
 		 370 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000502837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  33.64 
 
 		 323 aa  169  6e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  35.14 
 
 		 323 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  35.14 
 
 		 323 aa  168  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  32.64 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  32.44 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  34.81 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  38.89 
 
 		 330 aa  167  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3973  octaprenyl diphosphate synthase  34.82 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  35.02 
 
 		 322 aa  166  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  36.88 
 
 		 323 aa  166  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1574  octaprenyl-diphosphate synthase  36.09 
 
 		 349 aa  166  5e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.836554 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  32.63 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  36.48 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.06 
 
 		 325 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  38.36 
 
 		 322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.84 
 
 		 323 aa  165  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  35.14 
 
 		 322 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  37.79 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  33.12 
 
 		 323 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  34.33 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  37.1 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  35.76 
 
 		 344 aa  162  6e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  35.51 
 
 		 322 aa  162  8.000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2007  trans-hexaprenyltranstransferase  36.91 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00197396  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  35.8 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  36.73 
 
 		 336 aa  161  2e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  36.45 
 
 		 333 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  31.99 
 
 		 327 aa  159  4e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  31.15 
 
 		 326 aa  159  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  36.1 
 
 		 332 aa  159  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  38.4 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0851  polyprenyl synthetase  35.22 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000684066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  37.33 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1016  Polyprenyl synthetase  41.94 
 
 		 332 aa  157  2e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00162211  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  37.13 
 
 		 322 aa  158  2e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  37.42 
 
 		 322 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  31.93 
 
 		 326 aa  156  4e-37  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  35.12 
 
 		 318 aa  155  6e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  35.53 
 
 		 345 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  34.11 
 
 		 322 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  33.87 
 
 		 345 aa  155  7e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  40.34 
 
 		 335 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  35.33 
 
 		 323 aa  155  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  37.11 
 
 		 343 aa  154  1e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  35.1 
 
 		 323 aa  154  1e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3376  polyprenyl synthetase  37 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  35.64 
 
 		 322 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0890  polyprenyl synthetase  35.1 
 
 		 309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0253423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  34.94 
 
 		 336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  34.67 
 
 		 331 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  35.64 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  32.39 
 
 		 348 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  35.81 
 
 		 345 aa  153  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  37.93 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  33.12 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2412  Dimethylallyltranstransferase  38.13 
 
 		 322 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00033108 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2653  polyprenyl synthetase  36.75 
 
 		 330 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00415418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  41.51 
 
 		 351 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  31.69 
 
 		 332 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  36.67 
 
 		 336 aa  152  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  32 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  37.59 
 
 		 340 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2004  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.61 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.39 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  37.34 
 
 		 358 aa  151  2e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0383  polyprenyl synthetase  32.48 
 
 		 338 aa  150  3e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.398476  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  39.58 
 
 		 324 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>