More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1577 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_2330  MMPL  63.8 
 
 
748 aa  810    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2933  MMPL  58.52 
 
 
767 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.667476  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4064  MMPL  63.88 
 
 
769 aa  877    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0676  MMPL domain protein  52.11 
 
 
736 aa  652    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2377  MMPL domain-containing protein  63.8 
 
 
754 aa  810    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2977  MMPL domain-containing protein  58.52 
 
 
767 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1612  MMPL domain protein  50.79 
 
 
770 aa  676    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4139  MMPL domain-containing protein  63.88 
 
 
769 aa  877    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1197  hypothetical protein  63.6 
 
 
727 aa  803    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  100 
 
 
1155 aa  2276    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4573  MMPL domain-containing protein  62.32 
 
 
778 aa  852    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.479628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2948  MMPL domain-containing protein  58.39 
 
 
767 aa  767    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.24292  normal  0.448539 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4293  MMPL domain-containing protein  65.31 
 
 
751 aa  886    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.707525  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0467  MMPL domain-containing protein  62.57 
 
 
731 aa  800    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0196039  normal  0.101106 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2131  MMPL domain-containing protein  64.17 
 
 
738 aa  875    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.329514 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5139  MMPL domain-containing protein  61.9 
 
 
743 aa  827    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1751  MMPL domain protein  50.14 
 
 
738 aa  623  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11170  transmembrane transport protein mmpL13b  62.57 
 
 
500 aa  548  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.356849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0656  MMPL domain-containing protein  43.09 
 
 
796 aa  491  1e-137  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177102  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  44.31 
 
 
773 aa  469  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  40.38 
 
 
741 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2752  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.33 
 
 
724 aa  444  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0520418 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4060  hypothetical protein  41.78 
 
 
783 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4195  MMPL domain-containing protein  41.75 
 
 
953 aa  417  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0876454  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2842  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.2 
 
 
740 aa  416  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1537  MMPL  40.24 
 
 
839 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167617  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6797  MMPL domain-containing protein  38.11 
 
 
733 aa  409  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.693929  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  58.45 
 
 
371 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  57.93 
 
 
374 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1530  MMPL domain-containing protein  37.11 
 
 
766 aa  394  1e-108  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  57.93 
 
 
374 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  57.93 
 
 
374 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3767  MMPL domain protein  39.22 
 
 
717 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  35.17 
 
 
710 aa  373  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  34.05 
 
 
740 aa  355  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  36.14 
 
 
758 aa  353  1e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  33.85 
 
 
741 aa  347  8e-94  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8829  drug exporter of the RND superfamily-like protein  35.7 
 
 
1308 aa  346  1e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00314237  decreased coverage  0.000466085 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2844  MMPL domain protein  36.4 
 
 
738 aa  338  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4759  MMPL domain protein  33.82 
 
 
805 aa  332  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  35.09 
 
 
731 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4481  drug exporter of the RND superfamily-like protein  31.01 
 
 
1095 aa  314  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.150601  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  31.37 
 
 
1013 aa  313  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17640  predicted RND superfamily drug exporter  35.35 
 
 
761 aa  308  5.0000000000000004e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0285272 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11169  transmembrane transport protein mmpL13a  56.12 
 
 
361 aa  301  6e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.266542 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5174  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.56 
 
 
738 aa  291  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  31.32 
 
 
944 aa  287  7e-76  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1813  integral membrane protein  35 
 
 
743 aa  280  8e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00875807  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1403  transporter, putative  27.48 
 
 
730 aa  279  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1184  transporter  27.38 
 
 
730 aa  278  3e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.410115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  27.25 
 
 
730 aa  278  4e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  28.16 
 
 
730 aa  278  5e-73  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  28.16 
 
 
730 aa  278  5e-73  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  28.16 
 
 
730 aa  278  5e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1444  putative transporter  27.49 
 
 
730 aa  273  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  27.29 
 
 
730 aa  270  1e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  27.44 
 
 
730 aa  269  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1206  MmpL family protein  26.69 
 
 
730 aa  268  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0364  large membrane protein  30.41 
 
 
997 aa  266  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.149912  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2255  MMPL  34.07 
 
 
745 aa  260  1e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1012  transporter  27.03 
 
 
729 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.699507  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2009  integral membrane protein  32.02 
 
 
757 aa  251  5e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.12603  normal  0.560669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5721  MMPL domain-containing protein  32.13 
 
 
752 aa  248  6e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.59 
 
 
717 aa  246  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  32.78 
 
 
723 aa  244  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  31.94 
 
 
842 aa  244  1e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  33.66 
 
 
740 aa  241  5e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  31.01 
 
 
735 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0955  integral membrane protein  33.96 
 
 
709 aa  240  1e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.778456  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3388  anti-sigma-factor antagonist  33.63 
 
 
846 aa  239  3e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7157  MmpL domain-containing protein  32.84 
 
 
723 aa  236  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00858649 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  41.57 
 
 
360 aa  234  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3269  MMPL domain-containing protein  30.28 
 
 
832 aa  232  3e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930257  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  45.28 
 
 
353 aa  230  1e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  44.51 
 
 
375 aa  229  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0152  MmpL11  30.06 
 
 
979 aa  229  3e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0400788 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0816  MMPL  31.3 
 
 
758 aa  228  6e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  30.94 
 
 
737 aa  227  8e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0162  MmpL11  29.92 
 
 
983 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.39769  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0171  MmpL11  29.92 
 
 
983 aa  226  2e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  35.04 
 
 
741 aa  226  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  26.14 
 
 
704 aa  224  6e-57  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  30.61 
 
 
978 aa  224  9.999999999999999e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4966  MMPL domain-containing protein  31.1 
 
 
758 aa  223  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.586388  hitchhiker  0.00568973 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  28.97 
 
 
743 aa  221  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  28.19 
 
 
829 aa  220  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  28.19 
 
 
829 aa  220  1e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  29.81 
 
 
781 aa  219  2.9999999999999998e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  32.11 
 
 
724 aa  217  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  26.62 
 
 
893 aa  215  3.9999999999999995e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3624  MMPL domain protein  29.7 
 
 
743 aa  214  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.745933  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  32.52 
 
 
734 aa  212  3e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0188  MmpL11  28.44 
 
 
968 aa  211  9e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  45.21 
 
 
358 aa  210  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0188  RND superfamily-like drug exporter  30.9 
 
 
743 aa  209  2e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  42.14 
 
 
367 aa  208  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  40.69 
 
 
360 aa  206  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.42 
 
 
718 aa  206  2e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  29.6 
 
 
735 aa  205  3e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0208  MMPL domain-containing protein  35.69 
 
 
734 aa  205  4e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.46376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>