More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1571 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 367 aa  730    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  52.88 
 
 		 365 aa  350  2e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  57.06 
 
 		 353 aa  345  6e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  52.97 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  55.37 
 
 		 360 aa  344  1e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  55.49 
 
 		 357 aa  339  5e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  55.65 
 
 		 360 aa  330  4e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  54.52 
 
 		 356 aa  329  6e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  52.1 
 
 		 355 aa  317  3e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  52.38 
 
 		 358 aa  311  2e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  51.28 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  48.76 
 
 		 361 aa  300  4e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  49.86 
 
 		 364 aa  299  6e-80  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  48.19 
 
 		 364 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  48.08 
 
 		 356 aa  284  2.0000000000000002e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  52.53 
 
 		 634 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  49.18 
 
 		 369 aa  275  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  50 
 
 		 375 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  48.48 
 
 		 359 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  46.24 
 
 		 362 aa  272  6e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  46.57 
 
 		 359 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  49.04 
 
 		 365 aa  267  2.9999999999999995e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  48.36 
 
 		 372 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  46.61 
 
 		 362 aa  266  4e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  47.32 
 
 		 359 aa  258  9e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  46.22 
 
 		 377 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  45.17 
 
 		 352 aa  243  6e-63  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.57 
 
 		 377 aa  235  8e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  43.59 
 
 		 362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  46.28 
 
 		 362 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  41.78 
 
 		 347 aa  229  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  44.35 
 
 		 377 aa  228  9e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  45.33 
 
 		 384 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  41.67 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  42.54 
 
 		 361 aa  223  6e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  46.75 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  41.21 
 
 		 376 aa  220  3.9999999999999997e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  44.44 
 
 		 373 aa  219  8.999999999999998e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 350 aa  216  5.9999999999999996e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  41.25 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  41.25 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  41.25 
 
 		 374 aa  215  8e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  38.9 
 
 		 371 aa  212  7e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  42.45 
 
 		 1155 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  42.41 
 
 		 380 aa  192  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 385 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  33.01 
 
 		 350 aa  162  6e-39  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  40.2 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  40.2 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  40.2 
 
 		 418 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.81 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04470  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.22 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21240  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.75 
 
 		 358 aa  116  6.9999999999999995e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.3 
 
 		 326 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1286  polyprenyl synthetase  33.86 
 
 		 338 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.916051  normal  0.252037 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0970  Polyprenyl synthetase  34.64 
 
 		 366 aa  113  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0268682 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0533  polyprenyl synthetase  34.59 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.506738 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  34.16 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  32.52 
 
 		 330 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  33.12 
 
 		 343 aa  107  5e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5018  Polyprenyl synthetase  32.19 
 
 		 346 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.59 
 
 		 361 aa  105  2e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.315144  normal  0.841822 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  34.64 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  35.28 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.03 
 
 		 345 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  29.73 
 
 		 322 aa  103  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0690  polyprenyl synthetase  26.98 
 
 		 368 aa  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1618  polyprenyl synthetase  36.14 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.399283 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.55 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  26.06 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1004  Polyprenyl synthetase  30.19 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000588963  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  32.73 
 
 		 340 aa  100  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  31.29 
 
 		 323 aa  100  6e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.73 
 
 		 340 aa  99.8  7e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1417  dimethylallyltranstransferase / geranyltranstransferase  32.78 
 
 		 321 aa  99.8  8e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0000231045  decreased coverage  0.000138058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0763  Polyprenyl synthetase  31.55 
 
 		 346 aa  99.4  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.830605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  28 
 
 		 322 aa  98.6  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2220  trans-hexaprenyltranstransferase  31.56 
 
 		 322 aa  97.8  2e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000307661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0164  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.53 
 
 		 325 aa  98.2  2e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0195554  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0016  Polyprenyl synthetase  30.94 
 
 		 332 aa  97.8  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24479 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  29.43 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  24.57 
 
 		 332 aa  98.2  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  32.42 
 
 		 359 aa  97.8  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0524  octaprenyl-diphosphate synthase  29.56 
 
 		 331 aa  98.2  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.84 
 
 		 323 aa  98.6  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  31.41 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  30.58 
 
 		 327 aa  97.4  3e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  31.35 
 
 		 333 aa  97.4  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  28.04 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0658  polyprenyl synthetase  30.09 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.586121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  29.81 
 
 		 323 aa  96.7  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0011  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 336 aa  95.9  9e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0606  geranyltranstransferase  29.91 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  33.09 
 
 		 327 aa  95.5  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2048  Polyprenyl synthetase  30.18 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.225827  normal  0.179552 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  30.21 
 
 		 333 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1756  trans-hexaprenyltranstransferase  29.34 
 
 		 344 aa  94.4  3e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.726809  normal  0.071428 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  30 
 
 		 322 aa  94.4  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>