More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0471 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_0471  Polyprenyl synthetase  100 
 
 		 362 aa  695    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.25272  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3478  polyprenyl synthetase  48.26 
 
 		 360 aa  232  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.395312  normal  0.0269783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1571  Polyprenyl synthetase  43.59 
 
 		 367 aa  225  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.40444 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3110  Polyprenyl synthetase  42.28 
 
 		 360 aa  222  6e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5028  Polyprenyl synthetase  44.19 
 
 		 357 aa  222  7e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8812  normal  0.206356 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3027  Polyprenyl synthetase  43.87 
 
 		 353 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.2268  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3251  polyprenyl synthetase  48.26 
 
 		 360 aa  217  2.9999999999999998e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.698392  normal  0.34714 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1051  putative polyprenyl synthase / dimethylallyltranstransferase  43.83 
 
 		 356 aa  206  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3536  polyprenyl synthetase  41.94 
 
 		 359 aa  200  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00519723  normal  0.472476 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27930  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.82 
 
 		 361 aa  196  5.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.496263  normal  0.0148812 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2975  polyprenyl synthetase  40.19 
 
 		 359 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.465028  normal  0.846295 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1400  Polyprenyl synthetase  42.22 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3084  polyprenyl synthetase  43.65 
 
 		 358 aa  193  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2787  putative farnesyltranstransferase  40.68 
 
 		 355 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2550  Polyprenyl synthetase  42.21 
 
 		 377 aa  186  8e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1344  polyprenyl synthetase  38.7 
 
 		 358 aa  186  8e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.522192  decreased coverage  0.000335452 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2662  Polyprenyl synthetase  38.72 
 
 		 362 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3227  Polyprenyl synthetase  37.82 
 
 		 365 aa  180  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274483  normal  0.0178795 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3810  Polyprenyl synthetase  42.63 
 
 		 361 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3280  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.75227  normal  0.786831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1388  polyprenyl synthetase  44.29 
 
 		 634 aa  178  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.196896  hitchhiker  0.00569212 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3269  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3331  polyprenyl synthetase  38.53 
 
 		 359 aa  177  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.232682  normal  0.219199 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3308  Polyprenyl synthetase  41.29 
 
 		 375 aa  176  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.816432  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3574  Polyprenyl synthetase  43.04 
 
 		 380 aa  175  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.504985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1911  Polyprenyl synthetase  43.67 
 
 		 362 aa  175  9e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000671619 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16070  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.62 
 
 		 362 aa  175  9.999999999999999e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00352979  normal  0.115981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15850  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  40.79 
 
 		 369 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.250165  normal  0.207317 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12201  geranylgeranyl pyrophosphate synthetase idsA2  40.76 
 
 		 352 aa  174  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1995  Polyprenyl synthetase  42.77 
 
 		 365 aa  173  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.465551  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2503  Polyprenyl synthetase  40.07 
 
 		 385 aa  170  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000233784  hitchhiker  0.00819501 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2061  Polyprenyl synthetase  40.85 
 
 		 372 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0993933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1558  Polyprenyl synthetase  40.65 
 
 		 364 aa  168  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1557  polyprenyl synthetase  38.64 
 
 		 364 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14310  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.31 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3033  Polyprenyl synthetase  36.84 
 
 		 376 aa  159  6e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13720  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  41.06 
 
 		 373 aa  159  9e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4440  polyprenyl synthetase  41.53 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3199  Polyprenyl synthetase  37.65 
 
 		 377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000246433  hitchhiker  0.000997068 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4930  polyprenyl synthetase  41.44 
 
 		 384 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.654302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1430  Polyprenyl synthetase  35.56 
 
 		 368 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.28506  normal  0.583365 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1125  Polyprenyl synthetase  32.38 
 
 		 350 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0728299  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5074  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5162  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 374 aa  143  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18985  normal  0.559036 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2252  polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 418 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.359432  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2299  polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 418 aa  142  7e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2291  polyprenyl synthetase  38.22 
 
 		 418 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3312  Polyprenyl synthetase  36.11 
 
 		 347 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5453  polyprenyl synthetase  34.64 
 
 		 374 aa  141  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1848  polyprenyl synthetase  32.35 
 
 		 371 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3476  Polyprenyl synthetase  36.05 
 
 		 350 aa  138  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1577  polyprenyl synthetase  37.4 
 
 		 1155 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141416 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001674  octaprenyl-diphosphate synthase/dimethylallyltransferase/geranyltranstransferase/ geranylgeranyl pyrophosphate synthetase  32.59 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000010929  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  30.67 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  30.28 
 
 		 326 aa  127  3e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0316  polyprenyl synthetase  27.86 
 
 		 341 aa  126  5e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0314791  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  31.19 
 
 		 323 aa  125  9e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0295  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.66 
 
 		 360 aa  125  2e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0106667  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19620  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.82 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0263779 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0577  Polyprenyl synthetase  31.13 
 
 		 349 aa  120  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.25249  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.99 
 
 		 322 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  32.2 
 
 		 334 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01980  putative isoprenoid biosynthesis related protein  31.37 
 
 		 324 aa  119  9.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.586835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  35.71 
 
 		 322 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0904  polyprenyl synthetase  29.34 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.28863  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03940  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  31.76 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.530934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  35.71 
 
 		 322 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1635  dimethylallyltranstransferase  29.04 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.750047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1363  polyprenyl synthetase  26.47 
 
 		 332 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.36149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  33.01 
 
 		 337 aa  117  3e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  35.39 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1814  farnesyltranstransferase  31.89 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0496  dimethylallyltransferase  35.09 
 
 		 575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.432422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1060  polyprenyl synthetase  28.96 
 
 		 317 aa  117  5e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 322 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  35.03 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 322 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1042  polyprenyl synthetase  28.44 
 
 		 317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.623686 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  35.71 
 
 		 322 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1042  Dimethylallyltranstransferase  30.28 
 
 		 332 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0345  Polyprenyl synthetase  32.29 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  31.95 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  31.85 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  35.03 
 
 		 322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  31.21 
 
 		 323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  32.8 
 
 		 320 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  30.84 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1186  polyprenyl synthetase  29.84 
 
 		 320 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  32.9 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  36.69 
 
 		 322 aa  113  6e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0472  octaprenyl diphosphate synthase  30.77 
 
 		 323 aa  112  7.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000437093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  30.74 
 
 		 336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  31.68 
 
 		 341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  30.74 
 
 		 336 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  32.7 
 
 		 323 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  33.77 
 
 		 330 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  35.39 
 
 		 322 aa  110  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  30.25 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  30.42 
 
 		 336 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_002950  PG0784  polyprenyl synthetase  32.67 
 
 		 325 aa  110  5e-23  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>