More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0190 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0190  prenyl transferase  100 
 
 
326 aa  665    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1738  polyprenyl synthetase family protein  44.14 
 
 
326 aa  295  8e-79  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1084  polyprenyl synthetase  42.99 
 
 
326 aa  284  2.0000000000000002e-75  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1085  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.69 
 
 
325 aa  229  5e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.171148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  37.73 
 
 
322 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0352  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  34.25 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1465  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.71 
 
 
319 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00436047  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  33.23 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.9 
 
 
322 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0223  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.64 
 
 
332 aa  170  3e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  35.16 
 
 
318 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.83 
 
 
321 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  32.63 
 
 
317 aa  154  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.93 
 
 
320 aa  153  4e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  30.82 
 
 
318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.46 
 
 
323 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.06 
 
 
326 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  31.03 
 
 
336 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  31.15 
 
 
336 aa  147  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  28.97 
 
 
319 aa  145  6e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  31.03 
 
 
336 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1835  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  33.33 
 
 
335 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  33.09 
 
 
320 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.83 
 
 
324 aa  144  3e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.06 
 
 
322 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  33.57 
 
 
323 aa  142  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  29.81 
 
 
336 aa  142  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.92 
 
 
324 aa  142  8e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  33.19 
 
 
327 aa  142  8e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 
322 aa  142  8e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  32.06 
 
 
322 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1254  Polyprenyl synthetase  34.14 
 
 
337 aa  141  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0961033 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  29.91 
 
 
336 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  30.53 
 
 
344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0553  Polyprenyl synthetase  32.9 
 
 
336 aa  139  4.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.926134 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.68 
 
 
320 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.14 
 
 
345 aa  139  7e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  31.41 
 
 
330 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  30.18 
 
 
322 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  28.93 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  28.93 
 
 
319 aa  139  8.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.57 
 
 
320 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  31.1 
 
 
322 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  29.91 
 
 
336 aa  137  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  33.19 
 
 
327 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  31.79 
 
 
334 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0752  trans-hexaprenyltranstransferase  29.94 
 
 
327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0130726 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  33.57 
 
 
324 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  28.04 
 
 
336 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  29.84 
 
 
327 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  32.64 
 
 
359 aa  135  8e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3918  dimethylallyltranstransferase  31.93 
 
 
342 aa  135  9e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00996484 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  32.28 
 
 
326 aa  135  9e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  29.01 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  33.7 
 
 
334 aa  134  9.999999999999999e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  29.31 
 
 
322 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1586  trans-hexaprenyltranstransferase  29.39 
 
 
323 aa  135  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0840  trans-hexaprenyltranstransferase  30.13 
 
 
327 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.24671  normal  0.90387 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  30 
 
 
326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  31.4 
 
 
331 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  31.4 
 
 
331 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  34.13 
 
 
339 aa  133  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  34.12 
 
 
341 aa  134  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  31.4 
 
 
331 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  32.52 
 
 
323 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  31.4 
 
 
331 aa  133  5e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  28.62 
 
 
323 aa  132  6.999999999999999e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  33.62 
 
 
313 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  35.81 
 
 
340 aa  132  9e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  29.41 
 
 
332 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  28.66 
 
 
335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  31.97 
 
 
334 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  31.82 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  36.41 
 
 
333 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  35.81 
 
 
340 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  31.82 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3623  octaprenyl diphosphate synthase  29.81 
 
 
323 aa  131  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000129591  normal  0.282199 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0557  octaprenyl diphosphate synthase  28.86 
 
 
323 aa  130  3e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000813107  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  29.02 
 
 
332 aa  130  3e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  30.17 
 
 
323 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.09 
 
 
334 aa  130  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.65 
 
 
323 aa  130  3e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.19 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  29.62 
 
 
324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  29.02 
 
 
332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1003  polyprenyl synthetase  32.3 
 
 
323 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000127512  decreased coverage  0.00000500836 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.44 
 
 
322 aa  129  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00798  octaprenyl-diphosphate synthase  29.14 
 
 
323 aa  129  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  31.42 
 
 
323 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.05 
 
 
351 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  28.75 
 
 
322 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  31.56 
 
 
323 aa  129  8.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  30.64 
 
 
323 aa  129  9.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  31.12 
 
 
324 aa  129  9.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  31.06 
 
 
358 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.69 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  30.22 
 
 
322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  28.96 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  30.55 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  30.77 
 
 
323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>