More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1465 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1465  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 319 aa  647    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00436047  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1085  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  38.44 
 
 		 325 aa  236  4e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.171148  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1738  polyprenyl synthetase family protein  36.92 
 
 		 326 aa  226  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1084  polyprenyl synthetase  37.23 
 
 		 326 aa  222  6e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  35.83 
 
 		 322 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0352  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.39 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0190  prenyl transferase  35.71 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0223  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  35.17 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  32.17 
 
 		 318 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  35.03 
 
 		 319 aa  179  5.999999999999999e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  33.02 
 
 		 319 aa  175  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.8 
 
 		 320 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  31.96 
 
 		 318 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0055  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.95 
 
 		 323 aa  166  5e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.827638  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.84 
 
 		 320 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06761  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  36.95 
 
 		 323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  35.56 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  36.14 
 
 		 322 aa  163  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.17 
 
 		 320 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.53 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  34.18 
 
 		 323 aa  162  8.000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.53 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.53 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  35.47 
 
 		 323 aa  161  1e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  35.4 
 
 		 322 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.85 
 
 		 320 aa  162  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.53 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.53 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.33 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.53 
 
 		 320 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.21 
 
 		 323 aa  160  3e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1137  trans-hexaprenyltranstransferase  34.31 
 
 		 323 aa  159  7e-38  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.11534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18951  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.34 
 
 		 323 aa  159  8e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.47365 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.44 
 
 		 323 aa  158  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.85 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.59 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06441  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.45 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.21 
 
 		 322 aa  157  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06741  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.45 
 
 		 323 aa  157  3e-37  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.290207  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  35.62 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0618  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  34.65 
 
 		 323 aa  156  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 321 aa  155  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  34.3 
 
 		 323 aa  155  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  32.49 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16615  predicted protein  35.22 
 
 		 325 aa  153  5e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.366634  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  33.02 
 
 		 322 aa  152  8.999999999999999e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1320  trans-hexaprenyltranstransferase  33.45 
 
 		 323 aa  151  1e-35  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.195026  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0389  heptaprenyl diphosphate synthase component II  34.35 
 
 		 324 aa  151  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0293538  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  32.98 
 
 		 351 aa  150  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  34.56 
 
 		 311 aa  151  2e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1088  farnesyltranstransferase  34.38 
 
 		 336 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.720427 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  34.38 
 
 		 336 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  33.33 
 
 		 322 aa  150  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10311  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  32.03 
 
 		 323 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.537163 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  34.12 
 
 		 323 aa  149  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1214  farnesyltranstransferase  34.38 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1232  Polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 336 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  32.39 
 
 		 322 aa  149  7e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  29.62 
 
 		 313 aa  149  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0369  polyprenyl synthetase  34.15 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000634343  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  32.75 
 
 		 340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_332  heptaprenyl diphosphate synthase component II  33.67 
 
 		 324 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00419568  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.01 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  30.94 
 
 		 323 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  34.07 
 
 		 345 aa  147  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  30.18 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  34.43 
 
 		 345 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  30.52 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 322 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  35.19 
 
 		 339 aa  146  5e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  31.99 
 
 		 322 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  30.31 
 
 		 322 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0149  Trans-hexaprenyltranstransferase  35.46 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4861  polyprenyl synthetase  32.7 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.615334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  32.99 
 
 		 336 aa  144  2e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31245  predicted protein  33.98 
 
 		 332 aa  144  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00231541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.32 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0383  solanesyl diphosphate synthase  33.55 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  34.97 
 
 		 322 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0374  solanesyl diphosphate synthase  33.55 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  32.3 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2349  octaprenyl diphosphate synthase  32.99 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.130526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.82 
 
 		 322 aa  143  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 		 322 aa  142  6e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1373  polyprenyl synthetase  32.87 
 
 		 335 aa  142  8e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  31.76 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  32.39 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3342  Polyprenyl synthetase  28.39 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000667178  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0711  polyprenyl synthetase  37.85 
 
 		 338 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0498261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  30.1 
 
 		 317 aa  139  4.999999999999999e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  32.98 
 
 		 332 aa  138  1e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  30 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  32.64 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  31.45 
 
 		 322 aa  138  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1115  Polyprenyl synthetase  30.77 
 
 		 337 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  34.2 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>