More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0352 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_0352  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  100 
 
 		 338 aa  699    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291218 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0190  prenyl transferase  34.25 
 
 		 326 aa  212  5.999999999999999e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1465  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  36.39 
 
 		 319 aa  211  1e-53  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00436047  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1738  polyprenyl synthetase family protein  37.54 
 
 		 326 aa  207  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000413587  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1085  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  39.69 
 
 		 325 aa  206  3e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.171148  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  35.38 
 
 		 322 aa  206  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1084  polyprenyl synthetase  34.66 
 
 		 326 aa  189  8e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0223  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  37.95 
 
 		 332 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  34.8 
 
 		 318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  35.64 
 
 		 326 aa  177  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  34.15 
 
 		 320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  32.59 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  33.54 
 
 		 318 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  31.35 
 
 		 322 aa  164  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.58 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  32.68 
 
 		 323 aa  156  6e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0963  polyprenyl synthetase  33.56 
 
 		 324 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1424  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.43 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.43 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.901054  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1396  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.43 
 
 		 323 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.947918  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1535  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.63 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0794192  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1677  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.63 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000206272  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1608  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.63 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00241713 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  33.71 
 
 		 313 aa  149  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1237  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.28 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.154205  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0157  trans-hexaprenyltranstransferase  32.2 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.5711 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1641  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.28 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0641659  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3775  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.28 
 
 		 320 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0992348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1570  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.28 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1188  Polyprenyl synthetase  34.36 
 
 		 324 aa  146  6e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000116702  normal  0.535135 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1219  trans-hexaprenyltranstransferase  32.64 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.581853 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1692  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.46 
 
 		 321 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  29.93 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0988  trans-hexaprenyltranstransferase  35.29 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.955039  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.52 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1103  Polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.789784  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1534  Polyprenyl synthetase  33.22 
 
 		 324 aa  144  3e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  28.81 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  28.81 
 
 		 319 aa  143  4e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_51700  chloroplast Clp protease, subunit of ClpP peptidase complex  33.88 
 
 		 311 aa  143  4e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.653243  hitchhiker  0.00209917 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  29.33 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1454  Polyprenyl synthetase  33.45 
 
 		 324 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.322683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3108  polyprenyl synthetase  29.82 
 
 		 340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.185036 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  31.17 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  32.28 
 
 		 326 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  31.17 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  32.45 
 
 		 318 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3427  Polyprenyl synthetase  29.53 
 
 		 340 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.640132 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5347  polyprenyl synthetase  30.5 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.960617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4840  solanesyl diphosphate synthase  29.81 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.854257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1227  solanesyl diphosphate synthase  30.89 
 
 		 323 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5209  octaprenyl-diphosphate synthase  30.23 
 
 		 322 aa  136  5e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.465308  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  31.64 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  31.33 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2582  hypothetical protein  29.78 
 
 		 322 aa  135  9e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0858  solanesyl diphosphate synthase  30.15 
 
 		 323 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0128707  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2709  hypothetical protein  29.78 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2749  polyprenyl synthetase  31.36 
 
 		 345 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0535555  normal  0.102238 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0053  trans-hexaprenyltrans transferase  32.17 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.88 
 
 		 337 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3301  Polyprenyl synthetase  33.84 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  28.21 
 
 		 317 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60470  octaprenyl-diphosphate synthase  30.35 
 
 		 322 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.456687  normal  0.0384277 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0796  octylprenyl diphosphate synthase  30.99 
 
 		 322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1469  polyprenyl synthetase  30.9 
 
 		 323 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793711  normal  0.386574 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4378  Polyprenyl synthetase  31.01 
 
 		 345 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.399439  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  27.74 
 
 		 327 aa  134  3e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4354  farnesyltranstransferase  28.44 
 
 		 336 aa  134  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.523786  hitchhiker  0.00985531 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0775  hypothetical protein  31.38 
 
 		 324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2592  polyprenyl synthetase  29.91 
 
 		 336 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.114773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  31.99 
 
 		 322 aa  132  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  31.47 
 
 		 327 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0700  trans-hexaprenyltranstransferase  29.58 
 
 		 322 aa  132  9e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.286073 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0193  farnesyltranstransferase  29.27 
 
 		 334 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000332441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5159  octaprenyl-diphosphate synthase  29.14 
 
 		 322 aa  131  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0320135  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02016  polyprenyl synthetase  29.97 
 
 		 332 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  30.82 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  32.16 
 
 		 337 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1687  farnesyl pyrophosphate synthetase  32.2 
 
 		 332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0622197  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5075  Polyprenyl synthetase  30.87 
 
 		 326 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.581141 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4498  polyprenyl synthetase  29.97 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.507536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0719  polyprenyl synthetase  31.25 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2928  trans-hexaprenyltranstransferase  31.72 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000191483  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0492  polyprenyl synthetase family protein  32.2 
 
 		 332 aa  130  4.0000000000000003e-29  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000926468  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  26.17 
 
 		 333 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0510  dimethylallyltransferase  29.72 
 
 		 330 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0303508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3006  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.54 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0680  trans-hexaprenyltranstransferase  33.82 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000360106  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0211  Polyprenyl synthetase  28.3 
 
 		 334 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.301992 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3215  farnesyltranstransferase  28.66 
 
 		 336 aa  129  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153645  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0687  polyprenyl synthetase  30.94 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.573498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  28.75 
 
 		 322 aa  129  7.000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05420  polyprenyl synthetase  31.47 
 
 		 311 aa  129  9.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.242903  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0718  polyprenyl synthetase  30.94 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.454253  decreased coverage  0.00754032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3613  octaprenyl diphosphate synthase  29.56 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000738852  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  29.45 
 
 		 327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0244  octaprenyl-diphosphate synthase  27.33 
 
 		 326 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000222684  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3758  octaprenyl diphosphate synthase  29.56 
 
 		 323 aa  128  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000253501  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3068  Polyprenyl synthetase  32.51 
 
 		 325 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3683  polyprenyl synthetase  30.97 
 
 		 322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.719488  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>