131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0764 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 594 aa  1219    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  100 
 
 		 594 aa  1219    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  99.49 
 
 		 594 aa  1215    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  40.22 
 
 		 989 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  38.81 
 
 		 609 aa  402  9.999999999999999e-111  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  39.54 
 
 		 565 aa  364  3e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2309  hypothetical protein  25.37 
 
 		 972 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2356  hypothetical protein  25.37 
 
 		 972 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.416517 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2348  hypothetical protein  25.37 
 
 		 972 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.284959 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 570 aa  97.1  8e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  23.86 
 
 		 578 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  23.76 
 
 		 577 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13759  oxidoreductase  23.49 
 
 		 602 aa  84.3  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649685  normal  0.108342 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  27.16 
 
 		 460 aa  71.6  0.00000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1769  Carotene 7,8-desaturase  22.9 
 
 		 453 aa  70.1  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1524  Carotene 7,8-desaturase  22.27 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000615844  normal  0.187981 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  22.2 
 
 		 482 aa  67  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1590  zeta-carotene desaturase  25.08 
 
 		 455 aa  66.6  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0949  Carotene 7,8-desaturase  26.28 
 
 		 453 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  25.72 
 
 		 453 aa  64.3  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  22.58 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0916  Carotene 7,8-desaturase  23.11 
 
 		 453 aa  63.5  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  25.04 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0830  zeta-carotene desaturase  24.35 
 
 		 453 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.762196  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  25.04 
 
 		 506 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  22.33 
 
 		 473 aa  62.4  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  22.68 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  22.68 
 
 		 490 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  23.75 
 
 		 472 aa  61.2  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  22.54 
 
 		 483 aa  60.1  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  24.82 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1283  carotene 7,8-desaturase  26.49 
 
 		 462 aa  57.8  0.0000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.859886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  24.52 
 
 		 472 aa  57.8  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.67 
 
 		 465 aa  57.4  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  36.61 
 
 		 647 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.57 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.1 
 
 		 466 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  33.83 
 
 		 647 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  22.74 
 
 		 503 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  44.58 
 
 		 495 aa  55.8  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  21.1 
 
 		 466 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  23.5 
 
 		 484 aa  55.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  33.83 
 
 		 647 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1394  hypothetical protein  22.04 
 
 		 530 aa  55.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.178095  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.03 
 
 		 462 aa  54.7  0.000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  46.03 
 
 		 639 aa  54.3  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  49.23 
 
 		 572 aa  53.5  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  24.76 
 
 		 461 aa  53.1  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  38.64 
 
 		 486 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  25 
 
 		 464 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.8 
 
 		 474 aa  53.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  28.57 
 
 		 591 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.58 
 
 		 642 aa  53.1  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  44.93 
 
 		 645 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  38.1 
 
 		 528 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  23.62 
 
 		 499 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  38.64 
 
 		 486 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  43.37 
 
 		 644 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.43 
 
 		 472 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2256  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.59 
 
 		 643 aa  51.2  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.429922  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  34.78 
 
 		 541 aa  50.8  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  36.45 
 
 		 519 aa  50.8  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  46.03 
 
 		 639 aa  50.4  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  46.15 
 
 		 532 aa  50.4  0.00009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  41.38 
 
 		 560 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  40.23 
 
 		 544 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  40.48 
 
 		 559 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  41.67 
 
 		 560 aa  48.9  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  36.97 
 
 		 527 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 479 aa  49.3  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  37.93 
 
 		 535 aa  49.3  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  41.67 
 
 		 560 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  22.05 
 
 		 589 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  33.33 
 
 		 489 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  43.1 
 
 		 537 aa  48.5  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0659  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  50 
 
 		 644 aa  48.9  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  41.38 
 
 		 560 aa  48.9  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  41.38 
 
 		 533 aa  48.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  23.55 
 
 		 479 aa  48.1  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2356  zeta-carotene desaturase  34.51 
 
 		 488 aa  48.5  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  46.15 
 
 		 648 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  31.03 
 
 		 484 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3166  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  44.58 
 
 		 501 aa  48.1  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0116079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5425  squalene-associated FAD-dependent desaturase  34.82 
 
 		 433 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1181  Carotene 7,8-desaturase  23.42 
 
 		 459 aa  48.5  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.0000113252  normal  0.0145788 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  32.23 
 
 		 530 aa  47.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  37.33 
 
 		 478 aa  47.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  23.62 
 
 		 484 aa  47.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  41.18 
 
 		 580 aa  47.4  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  40.48 
 
 		 560 aa  47.4  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  44 
 
 		 565 aa  47.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.64 
 
 		 471 aa  47  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  21.69 
 
 		 479 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1890  FAD dependent oxidoreductase  60.53 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00119586  hitchhiker  0.00883124 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  37.76 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1327  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.91 
 
 		 1481 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06887  protoporphyrinogen  34.15 
 
 		 129 aa  46.6  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1706  phytoene desaturase  38.89 
 
 		 519 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  39.68 
 
 		 640 aa  46.6  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  54.17 
 
 		 450 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>