94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8157 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  57.48 
 
 
560 aa  682    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  57.12 
 
 
560 aa  681    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  56.76 
 
 
560 aa  678    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  62.34 
 
 
580 aa  695    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  57.48 
 
 
560 aa  682    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  60.8 
 
 
578 aa  691    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  60.91 
 
 
576 aa  692    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  100 
 
 
572 aa  1170    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  68.01 
 
 
566 aa  788    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  58.17 
 
 
560 aa  690    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  58.02 
 
 
559 aa  689    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  66.43 
 
 
565 aa  724    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  57.95 
 
 
544 aa  680    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  65.98 
 
 
570 aa  758    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  55.17 
 
 
556 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  37.56 
 
 
623 aa  348  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  34.78 
 
 
649 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  32.54 
 
 
563 aa  237  5.0000000000000005e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  32.12 
 
 
557 aa  231  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  31.02 
 
 
562 aa  220  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  30.24 
 
 
723 aa  211  4e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  29.77 
 
 
575 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  22.12 
 
 
564 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.15 
 
 
492 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  23.93 
 
 
523 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  26.37 
 
 
491 aa  103  7e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  26.35 
 
 
478 aa  101  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.99 
 
 
482 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.99 
 
 
482 aa  101  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.79 
 
 
482 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  24.08 
 
 
487 aa  101  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.99 
 
 
487 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.99 
 
 
485 aa  100  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  23.67 
 
 
490 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  23.29 
 
 
490 aa  98.2  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  23.14 
 
 
487 aa  96.3  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  23.25 
 
 
490 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.6 
 
 
478 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  24.9 
 
 
478 aa  95.9  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.6 
 
 
478 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  24.22 
 
 
803 aa  92.4  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  23 
 
 
478 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.31 
 
 
482 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.24 
 
 
478 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  21.06 
 
 
478 aa  84  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  21.26 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  21.26 
 
 
478 aa  82.8  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  23.75 
 
 
644 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  21.26 
 
 
478 aa  82  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  21.26 
 
 
478 aa  80.5  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  21.71 
 
 
541 aa  67  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  21.48 
 
 
572 aa  65.9  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  21.32 
 
 
573 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  21.81 
 
 
516 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  22.39 
 
 
519 aa  60.5  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  21.02 
 
 
516 aa  60.1  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  28.42 
 
 
418 aa  59.7  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  22.24 
 
 
527 aa  57  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  22.76 
 
 
464 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  41.46 
 
 
419 aa  55.5  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  38.89 
 
 
503 aa  54.7  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  49.23 
 
 
594 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  49.23 
 
 
594 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  49.23 
 
 
594 aa  53.9  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3962  Polyprenyl synthetase  40 
 
 
989 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.190104  normal  0.617204 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  28.65 
 
 
565 aa  52  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  24.86 
 
 
624 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  25.42 
 
 
526 aa  50.8  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  37.97 
 
 
456 aa  50.4  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  24.45 
 
 
456 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  21.92 
 
 
533 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  53.19 
 
 
609 aa  49.7  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  39.74 
 
 
350 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  27.63 
 
 
535 aa  48.5  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  35.44 
 
 
457 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  24.85 
 
 
447 aa  48.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  33.33 
 
 
157 aa  47.8  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1959  putative glutamate synthase (NADPH) small subunit  38.46 
 
 
647 aa  47.4  0.0008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  28.04 
 
 
524 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  39.71 
 
 
557 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  38.27 
 
 
444 aa  45.1  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  21.84 
 
 
524 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  24.15 
 
 
465 aa  45.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  25.97 
 
 
463 aa  45.4  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2030  FAD dependent oxidoreductase  45.83 
 
 
577 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.3933  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2308  FAD dependent oxidoreductase  46.94 
 
 
570 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231532  normal  0.0778846 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  35.9 
 
 
450 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  35.9 
 
 
450 aa  45.1  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1984  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  61.54 
 
 
576 aa  44.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  31.3 
 
 
421 aa  44.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  40.58 
 
 
547 aa  44.3  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  24.64 
 
 
638 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  32.35 
 
 
436 aa  43.9  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2295  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 
578 aa  43.9  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>