156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6128 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  100 
 
 
524 aa  1086    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  51.63 
 
 
527 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  49.05 
 
 
516 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  49.24 
 
 
516 aa  504  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  45.04 
 
 
528 aa  402  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  43.92 
 
 
536 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  44.31 
 
 
531 aa  369  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  41.79 
 
 
535 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  42.71 
 
 
520 aa  351  2e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  38.84 
 
 
537 aa  351  2e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  38.75 
 
 
533 aa  349  6e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  37.81 
 
 
526 aa  349  6e-95  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  40 
 
 
531 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  39.26 
 
 
533 aa  346  5e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  41.12 
 
 
532 aa  337  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  39.22 
 
 
535 aa  333  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  36.95 
 
 
519 aa  330  4e-89  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  40.24 
 
 
530 aa  329  7e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  39.45 
 
 
557 aa  315  9e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  35.97 
 
 
541 aa  305  2.0000000000000002e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  35.87 
 
 
527 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  33.46 
 
 
529 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  35.2 
 
 
527 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  34.25 
 
 
507 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  31.19 
 
 
638 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  30.06 
 
 
478 aa  218  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  30.21 
 
 
492 aa  214  3.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  28.81 
 
 
478 aa  202  9e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  27.75 
 
 
478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  27.75 
 
 
478 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  28.4 
 
 
490 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  28.46 
 
 
482 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  28.46 
 
 
482 aa  188  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  28.46 
 
 
487 aa  187  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  28.46 
 
 
482 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  28.94 
 
 
487 aa  187  4e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  28.74 
 
 
490 aa  187  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  29.06 
 
 
485 aa  187  6e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  29.41 
 
 
646 aa  186  9e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  28.66 
 
 
490 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  28.97 
 
 
487 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  27.24 
 
 
491 aa  182  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  28.83 
 
 
478 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  27.33 
 
 
482 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  27.69 
 
 
478 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  27.48 
 
 
478 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  27.69 
 
 
478 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  27.37 
 
 
478 aa  170  6e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  27.69 
 
 
478 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  27.07 
 
 
478 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  24.83 
 
 
644 aa  157  6e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  27.03 
 
 
503 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  31.54 
 
 
418 aa  133  9e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  26.33 
 
 
564 aa  130  8.000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  25.39 
 
 
523 aa  128  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  24.64 
 
 
572 aa  89.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  21.98 
 
 
496 aa  86.3  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  28.29 
 
 
624 aa  84.7  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.88 
 
 
495 aa  84.3  0.000000000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  23.81 
 
 
685 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.41 
 
 
592 aa  66.6  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  34.02 
 
 
573 aa  65.1  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  24.27 
 
 
698 aa  62.8  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  22.29 
 
 
560 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.29 
 
 
560 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  22.58 
 
 
560 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  22.72 
 
 
628 aa  60.1  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  23.09 
 
 
459 aa  59.3  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  21.97 
 
 
560 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  22.02 
 
 
456 aa  57.8  0.0000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30688  amine oxidase  27.59 
 
 
1199 aa  57.8  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.602004 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  32.45 
 
 
469 aa  57.4  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  21.66 
 
 
544 aa  57  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  21.71 
 
 
559 aa  57  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  21.55 
 
 
723 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  22.51 
 
 
462 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  22.1 
 
 
560 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4445  amine oxidase  24.23 
 
 
487 aa  55.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  21.65 
 
 
575 aa  54.7  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  52.94 
 
 
431 aa  54.7  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  24.03 
 
 
499 aa  54.3  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  20.93 
 
 
464 aa  54.3  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  23.08 
 
 
484 aa  53.9  0.000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  22.7 
 
 
436 aa  53.9  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  22 
 
 
459 aa  54.3  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  22.8 
 
 
525 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  25.51 
 
 
496 aa  53.5  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  49.09 
 
 
474 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  22.31 
 
 
487 aa  52.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.88 
 
 
454 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  31.67 
 
 
353 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  56 
 
 
463 aa  52  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.1 
 
 
496 aa  52  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  22.11 
 
 
492 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  53.49 
 
 
445 aa  50.4  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1280  amine oxidase  23.84 
 
 
433 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  34.44 
 
 
647 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  34.44 
 
 
647 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.56 
 
 
528 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  36.62 
 
 
645 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>