193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2357 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  76.13 
 
 
533 aa  890    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  78.38 
 
 
533 aa  911    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  76.12 
 
 
537 aa  886    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  100 
 
 
532 aa  1114    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  56.35 
 
 
535 aa  611  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  54.05 
 
 
519 aa  582  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  53.65 
 
 
530 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  50.29 
 
 
526 aa  540  9.999999999999999e-153  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  50.19 
 
 
541 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  38.97 
 
 
516 aa  380  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  38.78 
 
 
516 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  39.92 
 
 
528 aa  372  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  39.73 
 
 
527 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  41.12 
 
 
524 aa  350  4e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  38.59 
 
 
536 aa  299  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  36.63 
 
 
531 aa  296  5e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  38.22 
 
 
520 aa  294  3e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  35.99 
 
 
531 aa  281  2e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  33.07 
 
 
529 aa  281  3e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  33.33 
 
 
527 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  34.58 
 
 
535 aa  276  6e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  33.21 
 
 
527 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  30.75 
 
 
507 aa  237  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  29.51 
 
 
557 aa  230  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  29.47 
 
 
638 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  29.22 
 
 
492 aa  206  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  27.68 
 
 
646 aa  202  9.999999999999999e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  29.73 
 
 
478 aa  190  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  28.78 
 
 
478 aa  181  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  29.68 
 
 
491 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  28.19 
 
 
478 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  28.19 
 
 
478 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  25.96 
 
 
644 aa  172  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  27.1 
 
 
478 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  26.98 
 
 
482 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  26.37 
 
 
478 aa  163  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  26.17 
 
 
478 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  26.22 
 
 
478 aa  161  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.46 
 
 
478 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  26.63 
 
 
478 aa  160  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  25.61 
 
 
478 aa  160  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.84 
 
 
482 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.84 
 
 
482 aa  158  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.84 
 
 
487 aa  159  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  26.84 
 
 
482 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  26.84 
 
 
487 aa  157  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.73 
 
 
487 aa  157  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  26.64 
 
 
490 aa  155  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.01 
 
 
485 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  26.07 
 
 
490 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25.81 
 
 
490 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  33.74 
 
 
418 aa  142  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  28.27 
 
 
564 aa  137  5e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  25.34 
 
 
523 aa  122  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  23.91 
 
 
573 aa  120  6e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  26.09 
 
 
503 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  29.89 
 
 
624 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  30.29 
 
 
572 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  27.86 
 
 
685 aa  75.5  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  20.9 
 
 
698 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  22.59 
 
 
560 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  23.68 
 
 
469 aa  67.8  0.0000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  22.4 
 
 
560 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  22.73 
 
 
544 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  22.54 
 
 
559 aa  62  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  36.63 
 
 
575 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  22.58 
 
 
560 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  59.26 
 
 
495 aa  60.8  0.00000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  21.99 
 
 
444 aa  57  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  21.78 
 
 
560 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  26.54 
 
 
454 aa  57  0.0000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  39.6 
 
 
496 aa  56.2  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  23.89 
 
 
496 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  20.33 
 
 
456 aa  55.1  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  21.97 
 
 
560 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  27.41 
 
 
469 aa  54.7  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  25.47 
 
 
445 aa  54.7  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  23.64 
 
 
578 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  23.64 
 
 
494 aa  54.3  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  57.78 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  57.78 
 
 
450 aa  53.5  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.74 
 
 
536 aa  53.1  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  23.08 
 
 
496 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  23.03 
 
 
445 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  32.03 
 
 
570 aa  51.6  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2283  Polyamine oxidase  23.87 
 
 
427 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.844558 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  23.43 
 
 
494 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  39.71 
 
 
465 aa  51.6  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  25.58 
 
 
435 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  35.87 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2268  amine oxidase  54 
 
 
431 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  50.85 
 
 
524 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  49.12 
 
 
463 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  26.09 
 
 
459 aa  51.2  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  21.28 
 
 
572 aa  50.8  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  47.37 
 
 
462 aa  50.8  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0790  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  36.26 
 
 
700 aa  50.8  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  24.8 
 
 
484 aa  50.4  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  59.52 
 
 
445 aa  50.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  47.62 
 
 
492 aa  50.1  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>