117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0704 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  100 
 
 		 519 aa  1076    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  53.7 
 
 		 530 aa  571  1e-161  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  53.7 
 
 		 535 aa  569  1e-161  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  54.05 
 
 		 532 aa  565  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  51.35 
 
 		 533 aa  552  1e-156  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  50.58 
 
 		 533 aa  548  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  50.38 
 
 		 537 aa  545  1e-154  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  47.68 
 
 		 541 aa  502  1e-141  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  45.66 
 
 		 526 aa  492  9.999999999999999e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  43.02 
 
 		 528 aa  377  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  38.88 
 
 		 527 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  38.74 
 
 		 516 aa  336  7.999999999999999e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  38.74 
 
 		 516 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  36.95 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  37.29 
 
 		 531 aa  297  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  37.6 
 
 		 531 aa  295  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  33.97 
 
 		 529 aa  291  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  37.9 
 
 		 536 aa  290  4e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  34.03 
 
 		 535 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  32.95 
 
 		 527 aa  269  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  37.42 
 
 		 520 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  33.46 
 
 		 527 aa  266  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  32.35 
 
 		 507 aa  252  1e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  29.65 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3896  amine oxidase  29.35 
 
 		 638 aa  213  7.999999999999999e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.322927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2873  amine oxidase flavin-containing  27.56 
 
 		 646 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  31.2 
 
 		 492 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  29.2 
 
 		 491 aa  170  5e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  30 
 
 		 478 aa  169  1e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  26.08 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  26.08 
 
 		 482 aa  168  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  26.08 
 
 		 487 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.87 
 
 		 490 aa  167  4e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  26.3 
 
 		 487 aa  167  4e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  26.08 
 
 		 482 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  26.34 
 
 		 485 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  26.23 
 
 		 487 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25.93 
 
 		 490 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  25.93 
 
 		 490 aa  164  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  26.32 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  26.32 
 
 		 478 aa  157  3e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  28.72 
 
 		 478 aa  158  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  27.35 
 
 		 482 aa  156  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  26 
 
 		 478 aa  153  7e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  26.27 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  25.89 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  25.68 
 
 		 478 aa  152  1e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  25.79 
 
 		 478 aa  151  3e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  25.47 
 
 		 478 aa  150  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  26.42 
 
 		 478 aa  145  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  25.89 
 
 		 644 aa  143  7e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  32.24 
 
 		 418 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  24.37 
 
 		 523 aa  124  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  26.44 
 
 		 564 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  26.4 
 
 		 572 aa  111  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  32.1 
 
 		 503 aa  96.7  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  23.45 
 
 		 573 aa  95.1  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  28.69 
 
 		 624 aa  83.6  0.000000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  25 
 
 		 685 aa  76.3  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  24.59 
 
 		 496 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  24.19 
 
 		 496 aa  75.1  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  22.59 
 
 		 575 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  23.4 
 
 		 495 aa  71.2  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  24.87 
 
 		 454 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  23.24 
 
 		 623 aa  62.8  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  21.91 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  22.53 
 
 		 525 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  22.48 
 
 		 698 aa  58.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  22.28 
 
 		 528 aa  57.8  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  40.62 
 
 		 496 aa  57  0.0000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  25.82 
 
 		 445 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  25.76 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  23.67 
 
 		 544 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  27.37 
 
 		 570 aa  53.5  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.48 
 
 		 592 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  24.25 
 
 		 456 aa  51.2  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  23.76 
 
 		 484 aa  50.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  22.94 
 
 		 457 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.48 
 
 		 536 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  27.32 
 
 		 578 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  36 
 
 		 565 aa  48.5  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  23.27 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  26.23 
 
 		 576 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  31.31 
 
 		 560 aa  47  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4944  flavin-containing monooxygenase FMO  30.77 
 
 		 455 aa  47  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.310384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4710  amine oxidase  25 
 
 		 481 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173844  normal  0.0970024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  33.68 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  39.24 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  39.24 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  39.24 
 
 		 594 aa  46.6  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2728  putative amine oxidase (flavin-containing)  24.49 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.252608  normal  0.150023 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  31.31 
 
 		 560 aa  47  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  29.2 
 
 		 619 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  31.96 
 
 		 560 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  30.1 
 
 		 560 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  46.43 
 
 		 444 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  30.3 
 
 		 580 aa  45.4  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  30.97 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2955  amine oxidase  25.37 
 
 		 413 aa  46.2  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000016357  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03220  flavin-containing mono amine oxidase  26.72 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.158318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>