More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5603 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  100 
 
 
492 aa  1006    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  50 
 
 
478 aa  456  1e-127  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  50.11 
 
 
478 aa  452  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  46.68 
 
 
418 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  39.18 
 
 
491 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  37.47 
 
 
487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  37.05 
 
 
482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  37.05 
 
 
487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  37.05 
 
 
482 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  37.05 
 
 
482 aa  335  7.999999999999999e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  38.09 
 
 
482 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  36.84 
 
 
485 aa  335  1e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  36.84 
 
 
490 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  37.26 
 
 
487 aa  334  3e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  36.63 
 
 
490 aa  333  4e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  36.42 
 
 
490 aa  332  9e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  36.86 
 
 
478 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  36.86 
 
 
478 aa  329  6e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  36.65 
 
 
478 aa  329  8e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  36.88 
 
 
478 aa  322  7e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  37.53 
 
 
478 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  37.45 
 
 
478 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  37.45 
 
 
478 aa  320  3.9999999999999996e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  38.06 
 
 
478 aa  318  9e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  37.23 
 
 
478 aa  318  1e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  32.04 
 
 
573 aa  265  2e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  34.05 
 
 
564 aa  244  3e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  31.32 
 
 
527 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  29.36 
 
 
516 aa  217  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  29.41 
 
 
516 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  30.21 
 
 
524 aa  214  3.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  31.13 
 
 
526 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0808  amine oxidase  31.1 
 
 
535 aa  203  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  27.88 
 
 
533 aa  194  4e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  27.93 
 
 
537 aa  194  4e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  27.86 
 
 
533 aa  193  5e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  31.79 
 
 
624 aa  192  8e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  27.86 
 
 
523 aa  192  9e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  31 
 
 
572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  29.22 
 
 
532 aa  189  1e-46  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  31.2 
 
 
519 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  32.48 
 
 
530 aa  188  1e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  30.11 
 
 
541 aa  188  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  34.11 
 
 
503 aa  176  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  29.68 
 
 
528 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  30.65 
 
 
496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0085  L-amino-acid oxidase  30.68 
 
 
536 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  30.11 
 
 
495 aa  155  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  29.94 
 
 
507 aa  154  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  27.89 
 
 
531 aa  150  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2888  amine oxidase  30.87 
 
 
527 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.511968  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  28.02 
 
 
531 aa  145  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3007  amine oxidase, flavin-containing protein  31.18 
 
 
527 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.306413  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3201  L-amino-acid oxidase  28.4 
 
 
535 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00292344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  26.71 
 
 
557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  27.46 
 
 
529 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  27.54 
 
 
520 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  26.54 
 
 
557 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  27.36 
 
 
544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  27.61 
 
 
560 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  26.59 
 
 
560 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  27.45 
 
 
560 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  26.71 
 
 
469 aa  125  1e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  25.65 
 
 
570 aa  126  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  26.59 
 
 
560 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  27.62 
 
 
563 aa  125  2e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  27.16 
 
 
559 aa  125  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  25.45 
 
 
560 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  26.09 
 
 
723 aa  116  8.999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  25.35 
 
 
576 aa  116  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02350  L-amino acid oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5UL69]  26.4 
 
 
685 aa  114  3e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.670859  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.71 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  26.57 
 
 
578 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  27.88 
 
 
565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  27.92 
 
 
499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  27.15 
 
 
572 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  24.28 
 
 
575 aa  109  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  25.75 
 
 
562 aa  108  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  26.56 
 
 
566 aa  107  7e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  28.35 
 
 
459 aa  106  8e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.65 
 
 
496 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  25.81 
 
 
592 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  26.92 
 
 
496 aa  100  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01808  L-amino acid oxidase LaoA (AFU_orthologue; AFUA_7G06810)  24.32 
 
 
698 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.308702 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  26.15 
 
 
580 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  27.47 
 
 
459 aa  95.9  2e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  27.41 
 
 
644 aa  94.4  4e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  25.79 
 
 
457 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  25.38 
 
 
625 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  26.3 
 
 
447 aa  90.9  4e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  25.21 
 
 
456 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  24.03 
 
 
565 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  24.17 
 
 
556 aa  85.9  0.000000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4983  amine oxidase  24.68 
 
 
619 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  25.93 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  24.57 
 
 
449 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4856  amine oxidase  24.68 
 
 
619 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.314626  normal  0.125904 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  25.43 
 
 
624 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5032  amine oxidase  24.03 
 
 
616 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  27.62 
 
 
444 aa  83.2  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>