117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0518 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0383  amine oxidase  88.05 
 
 		 560 aa  1016    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.356833  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0518  tryptophan 2-monooxygenase, putative  100 
 
 		 544 aa  1129    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501765  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4667  tryptophan 2-monooxygenase  98.53 
 
 		 559 aa  1115    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3618  amine oxidase  56.81 
 
 		 570 aa  667    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1732  amine oxidase  57.8 
 
 		 566 aa  671    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.175296  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  89.52 
 
 		 560 aa  1027    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  60.89 
 
 		 576 aa  726    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2670  amine oxidase  69.24 
 
 		 556 aa  751    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0407  amine oxidase  88.24 
 
 		 560 aa  1019    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.184143  normal  0.94923 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1432  amine oxidase  60.36 
 
 		 580 aa  712    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0411  amine oxidase  87.87 
 
 		 560 aa  1017    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4820  amine oxidase  88.42 
 
 		 560 aa  1021    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  60.52 
 
 		 578 aa  716    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8157  amine oxidase  57.95 
 
 		 572 aa  661    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  54.64 
 
 		 565 aa  629  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3191  tryptophan 2-monooxygenase  36.05 
 
 		 623 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.67015  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4304  tryptophan 2-monooxygenase  33.33 
 
 		 649 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.506274  normal  0.0401456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3740  amine oxidase  30.51 
 
 		 563 aa  210  5e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1536  amine oxidase  30.42 
 
 		 557 aa  204  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1245  tryptophan 2-monooxygenase  29.4 
 
 		 575 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.861844 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8288  tryptophan 2-monooxygenase  28.44 
 
 		 723 aa  189  1e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.658122  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7769  amine oxidase  27.76 
 
 		 562 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  27.36 
 
 		 492 aa  128  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2915  amine oxidase  23.01 
 
 		 564 aa  113  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  27.49 
 
 		 478 aa  107  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  22.55 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  25.7 
 
 		 478 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5898  amine oxidase  24.64 
 
 		 803 aa  94  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.167887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1778  amine oxidase  24.13 
 
 		 572 aa  91.3  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.63 
 
 		 487 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  23.31 
 
 		 482 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  23.31 
 
 		 482 aa  88.6  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  23.31 
 
 		 487 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  23.29 
 
 		 485 aa  87.4  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.11 
 
 		 482 aa  87.4  6e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  22.8 
 
 		 490 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  22.71 
 
 		 490 aa  84  0.000000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.9 
 
 		 487 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1175  amine oxidase  22.08 
 
 		 644 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.11925  normal  0.0306653 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  22.15 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  22.15 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  23.12 
 
 		 491 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  22.71 
 
 		 490 aa  79.3  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  22.2 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  21.77 
 
 		 478 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  21.54 
 
 		 478 aa  68.6  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  23.48 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1131  amine oxidase  22.62 
 
 		 533 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.451606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2329  amine oxidase  44.83 
 
 		 503 aa  64.7  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0980631  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  21.44 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  22.75 
 
 		 533 aa  62  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  23.94 
 
 		 478 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  24.47 
 
 		 478 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  35.79 
 
 		 573 aa  57.8  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  28.11 
 
 		 532 aa  57.8  0.0000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  23.94 
 
 		 478 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6128  L-amino-acid oxidase  21.66 
 
 		 524 aa  57  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  23.4 
 
 		 478 aa  55.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1535  putative flavin monoamine oxidase-related protein  21.75 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136151  normal  0.956268 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2643  amine oxidase  25.5 
 
 		 516 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.686426 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3473  amine oxidase  25.5 
 
 		 516 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3888  L-amino-acid oxidase  23.73 
 
 		 541 aa  54.7  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898233  normal  0.195386 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0704  L-amino-acid oxidase  23.67 
 
 		 519 aa  55.1  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  39.77 
 
 		 469 aa  52.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  33 
 
 		 456 aa  52  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  35.71 
 
 		 457 aa  52  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1827  twin-arginine translocation pathway signal  22.12 
 
 		 526 aa  51.6  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.959499  normal  0.603483 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2438  amine oxidase, flavin-containing protein  33.7 
 
 		 507 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.806593  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  23.81 
 
 		 532 aa  49.7  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  38.1 
 
 		 419 aa  49.3  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0764  twin-arginine translocation pathway signal  40.23 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0778  amine oxidase  40.23 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0758  amine oxidase  40.23 
 
 		 594 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.744737 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  27.47 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1328  L-amino-acid oxidase  22.97 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.492445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  43.94 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4256  hypothetical protein  30.85 
 
 		 157 aa  48.5  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7142  L-amino-acid oxidase  22.99 
 
 		 624 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574825  normal  0.291351 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.72 
 
 		 456 aa  48.1  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0821  amine oxidase  23.76 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.707747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  36.89 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  36.89 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  39.24 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  36.89 
 
 		 493 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  39.47 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  40.3 
 
 		 496 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  28.79 
 
 		 495 aa  46.6  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  40.62 
 
 		 524 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  36.76 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  25.95 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_42289  amine oxidase  30.95 
 
 		 628 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.317329  decreased coverage  0.00000000282984 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  41.57 
 
 		 448 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  37.35 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  37.35 
 
 		 355 aa  45.8  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3923  Dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  23 
 
 		 362 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3583  FAD dependent oxidoreductase  35.71 
 
 		 609 aa  45.1  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0502256  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  36.59 
 
 		 479 aa  45.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1379  L-amino-acid oxidase  31.48 
 
 		 528 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.115116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  36 
 
 		 350 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>