More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1893 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 421 aa  814    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  46.74 
 
 		 452 aa  318  1e-85  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  45.19 
 
 		 475 aa  278  1e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  47.42 
 
 		 451 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  47.42 
 
 		 451 aa  273  3e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  47.42 
 
 		 451 aa  271  1e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  44.99 
 
 		 454 aa  269  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  42.76 
 
 		 473 aa  266  7e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  44.88 
 
 		 453 aa  264  3e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  40.18 
 
 		 482 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  40.32 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  38.78 
 
 		 470 aa  229  6e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  40.23 
 
 		 469 aa  217  4e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  39.09 
 
 		 469 aa  212  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  35.96 
 
 		 471 aa  208  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  36.73 
 
 		 477 aa  207  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  37.84 
 
 		 479 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  37.56 
 
 		 482 aa  191  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  37.91 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  36.94 
 
 		 488 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  36.6 
 
 		 460 aa  180  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  35.81 
 
 		 475 aa  180  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  37.39 
 
 		 463 aa  179  1e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  29.49 
 
 		 474 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  37.75 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  38.07 
 
 		 493 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  32.97 
 
 		 490 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  36.73 
 
 		 454 aa  167  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  32.39 
 
 		 488 aa  166  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  28.6 
 
 		 473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  30.3 
 
 		 469 aa  157  4e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  28.08 
 
 		 479 aa  155  9e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 473 aa  155  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  28.81 
 
 		 495 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 473 aa  152  1e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  25.65 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  25.7 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  25.65 
 
 		 473 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  24.2 
 
 		 482 aa  150  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  26.07 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  26.07 
 
 		 466 aa  150  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 473 aa  149  8e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 473 aa  149  8e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 473 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 		 473 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  32.39 
 
 		 460 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  32.96 
 
 		 467 aa  147  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  28.01 
 
 		 491 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  31.13 
 
 		 447 aa  145  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  28.99 
 
 		 509 aa  144  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  25.75 
 
 		 456 aa  142  8e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  28.85 
 
 		 476 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  31.03 
 
 		 488 aa  139  8.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  28.12 
 
 		 471 aa  138  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  31.54 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  29.98 
 
 		 470 aa  136  7.000000000000001e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  33.62 
 
 		 473 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  29.11 
 
 		 470 aa  132  9e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  29.57 
 
 		 469 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  34.27 
 
 		 479 aa  124  2e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  24.42 
 
 		 463 aa  124  4e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  24.03 
 
 		 466 aa  123  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  24.46 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  24.03 
 
 		 463 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  24.46 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  24.03 
 
 		 466 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  24.25 
 
 		 466 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  24.36 
 
 		 466 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  27.46 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  23.82 
 
 		 466 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  23.77 
 
 		 466 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  23.61 
 
 		 466 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  26.6 
 
 		 470 aa  114  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  29.91 
 
 		 472 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  31.76 
 
 		 491 aa  112  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  25.34 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  32.18 
 
 		 476 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  27.23 
 
 		 475 aa  104  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  25.54 
 
 		 467 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  29.91 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  29.91 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  29.64 
 
 		 462 aa  99.8  8e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  31.6 
 
 		 487 aa  99.8  8e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  26.3 
 
 		 482 aa  94.7  3e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  26.34 
 
 		 465 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 		 423 aa  88.2  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  24.94 
 
 		 442 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  28.2 
 
 		 463 aa  85.9  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  27.13 
 
 		 419 aa  85.5  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  33.5 
 
 		 492 aa  82  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  31.05 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 499 aa  78.6  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  23.82 
 
 		 429 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  25.89 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  30.09 
 
 		 476 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  22.22 
 
 		 441 aa  75.1  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  23.09 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  26.97 
 
 		 444 aa  73.9  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  24.08 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  25.23 
 
 		 400 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>