169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2493 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 476 aa  910    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  69.07 
 
 		 491 aa  618  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  48.3 
 
 		 479 aa  297  3e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  42.97 
 
 		 502 aa  265  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  51.1 
 
 		 492 aa  265  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  42.89 
 
 		 531 aa  251  3e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  42.27 
 
 		 487 aa  248  1e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  41.16 
 
 		 499 aa  243  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  37.9 
 
 		 462 aa  227  4e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4011  protoporphyrinogen oxidase  44.18 
 
 		 504 aa  189  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  36.17 
 
 		 488 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  33.68 
 
 		 477 aa  152  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  35.11 
 
 		 479 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  35.97 
 
 		 463 aa  143  6e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  33.12 
 
 		 488 aa  139  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  33.54 
 
 		 473 aa  126  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  34.62 
 
 		 482 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  32.92 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  35.84 
 
 		 493 aa  124  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  33.92 
 
 		 482 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  31.47 
 
 		 470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  32.65 
 
 		 477 aa  119  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  22.64 
 
 		 482 aa  117  3e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  32.57 
 
 		 473 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  30.54 
 
 		 459 aa  117  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  24.59 
 
 		 473 aa  117  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  24.63 
 
 		 466 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  24.63 
 
 		 466 aa  116  7.999999999999999e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  33.06 
 
 		 454 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  31.38 
 
 		 471 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  32.55 
 
 		 453 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  28.31 
 
 		 490 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  30 
 
 		 475 aa  113  8.000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  25.21 
 
 		 509 aa  110  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  23.29 
 
 		 473 aa  109  8.000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  22.96 
 
 		 473 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  29.37 
 
 		 460 aa  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  23.46 
 
 		 473 aa  107  6e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  32.31 
 
 		 421 aa  105  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 479 aa  104  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  32.56 
 
 		 454 aa  104  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  27.18 
 
 		 488 aa  103  7e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  33.05 
 
 		 475 aa  102  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  23.23 
 
 		 473 aa  102  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  22.32 
 
 		 473 aa  100  8e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  30.15 
 
 		 482 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  22.38 
 
 		 473 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.38 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.38 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.38 
 
 		 473 aa  99  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  31.97 
 
 		 469 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  25.06 
 
 		 474 aa  98.2  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  23.18 
 
 		 466 aa  97.4  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  23.41 
 
 		 466 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  23.25 
 
 		 466 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  22.97 
 
 		 463 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  22.97 
 
 		 463 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  33.48 
 
 		 469 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  22.73 
 
 		 466 aa  94  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  23.18 
 
 		 466 aa  93.6  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.75 
 
 		 469 aa  93.6  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  24.41 
 
 		 466 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  22.47 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  22.9 
 
 		 466 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  22.9 
 
 		 466 aa  91.7  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  26.14 
 
 		 491 aa  91.3  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 452 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  22.45 
 
 		 466 aa  89.7  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  28.95 
 
 		 488 aa  88.2  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  26.31 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  24.64 
 
 		 469 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 470 aa  80.1  0.00000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 495 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.04 
 
 		 441 aa  79  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  24.78 
 
 		 470 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  25.61 
 
 		 476 aa  74.7  0.000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  24.54 
 
 		 471 aa  73.2  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  28.8 
 
 		 465 aa  70.5  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  24.89 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  27.37 
 
 		 447 aa  70.5  0.00000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  25.12 
 
 		 476 aa  70.5  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  25.67 
 
 		 467 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  26.67 
 
 		 442 aa  68.6  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  28.89 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  25.85 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  25.05 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  24.85 
 
 		 469 aa  64.7  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  28.79 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 		 463 aa  63.5  0.000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  31.35 
 
 		 503 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  28.69 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  28.69 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.03 
 
 		 467 aa  63.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  23.24 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  28.25 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  27.85 
 
 		 444 aa  55.1  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  23.83 
 
 		 399 aa  55.1  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  30.05 
 
 		 455 aa  54.3  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  41.57 
 
 		 360 aa  52  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>