214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3436 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3436  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
492 aa  885    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000341133  decreased coverage  0.00125797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  51.14 
 
 
476 aa  353  4e-96  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  48.68 
 
 
491 aa  323  3e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3250  FAD dependent oxidoreductase  47.36 
 
 
499 aa  300  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.211185  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  51.48 
 
 
479 aa  295  1e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4011  protoporphyrinogen oxidase  52.04 
 
 
504 aa  247  4e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  42.74 
 
 
502 aa  234  2.0000000000000002e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  42.15 
 
 
487 aa  233  6e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  40.25 
 
 
462 aa  231  2e-59  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36040  protoporphyrinogen oxidase  42.34 
 
 
531 aa  218  2e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0717647  normal  0.753343 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  37.81 
 
 
488 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  25.36 
 
 
473 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  25.52 
 
 
473 aa  142  9e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  25.52 
 
 
473 aa  140  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  25.52 
 
 
473 aa  140  7e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  25.31 
 
 
473 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  25.31 
 
 
473 aa  139  1e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  25.31 
 
 
473 aa  139  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  25.31 
 
 
473 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  36.36 
 
 
479 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  34.45 
 
 
488 aa  137  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  34.89 
 
 
463 aa  137  5e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  26.34 
 
 
473 aa  136  8e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  35.67 
 
 
482 aa  135  9.999999999999999e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  35.44 
 
 
473 aa  132  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  34.54 
 
 
477 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  25.44 
 
 
456 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  36.58 
 
 
460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  35.1 
 
 
421 aa  128  2.0000000000000002e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  36.29 
 
 
454 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  37.58 
 
 
493 aa  126  9e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  24.38 
 
 
466 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  24.38 
 
 
466 aa  125  2e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  24.53 
 
 
473 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  22.38 
 
 
482 aa  120  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  26.89 
 
 
479 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  35.52 
 
 
471 aa  116  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  34.57 
 
 
473 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  34.65 
 
 
482 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  25.86 
 
 
474 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  32.38 
 
 
453 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  33.12 
 
 
470 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  32.8 
 
 
482 aa  108  2e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  33.97 
 
 
475 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  33.76 
 
 
477 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  21.86 
 
 
463 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  21.65 
 
 
463 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  32.91 
 
 
475 aa  103  8e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  21.69 
 
 
466 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  21.69 
 
 
466 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  31.47 
 
 
460 aa  102  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  29.96 
 
 
452 aa  100  5e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  29.44 
 
 
490 aa  100  8e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  21.83 
 
 
466 aa  99  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  21.67 
 
 
466 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  21.99 
 
 
441 aa  97.4  4e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  21.67 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  21.67 
 
 
466 aa  97.4  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  24.74 
 
 
472 aa  97.4  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  21.28 
 
 
466 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  21.53 
 
 
466 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  21.88 
 
 
466 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  33.61 
 
 
488 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  33.92 
 
 
469 aa  94  5e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 
459 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  27.44 
 
 
469 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  31.68 
 
 
451 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  31.68 
 
 
451 aa  91.7  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  29.48 
 
 
470 aa  91.3  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  25.83 
 
 
509 aa  90.5  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  31.18 
 
 
469 aa  89  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  32.91 
 
 
476 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  25.63 
 
 
491 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  26.67 
 
 
470 aa  79.3  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  30.15 
 
 
447 aa  78.6  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.28 
 
 
465 aa  76.6  0.0000000000008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  24.33 
 
 
469 aa  75.1  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  23.04 
 
 
442 aa  74.3  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  23.94 
 
 
471 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  24.56 
 
 
469 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  25.93 
 
 
475 aa  72.4  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.39 
 
 
467 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  21.52 
 
 
495 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  23.81 
 
 
482 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  38.1 
 
 
451 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  29.1 
 
 
476 aa  63.9  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  48.65 
 
 
571 aa  60.5  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  23.65 
 
 
467 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  29.26 
 
 
470 aa  58.2  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 
454 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  35.29 
 
 
488 aa  57.4  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  22.05 
 
 
435 aa  56.6  0.0000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  42.65 
 
 
480 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  35 
 
 
429 aa  55.1  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  27.2 
 
 
524 aa  54.7  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  34.95 
 
 
499 aa  53.9  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  28.92 
 
 
496 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  46.34 
 
 
450 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  46.34 
 
 
450 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  28.88 
 
 
492 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>