255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4000 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  100 
 
 		 499 aa  995    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  43.47 
 
 		 465 aa  325  1e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  41.58 
 
 		 492 aa  313  4.999999999999999e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  40.18 
 
 		 452 aa  296  4e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  39.61 
 
 		 447 aa  296  7e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  40.48 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  40.48 
 
 		 450 aa  293  6e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  41.52 
 
 		 454 aa  291  2e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  38.21 
 
 		 454 aa  288  1e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  40.09 
 
 		 439 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  35.67 
 
 		 456 aa  270  4e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  39.08 
 
 		 446 aa  269  1e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  39.82 
 
 		 449 aa  268  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  38.27 
 
 		 498 aa  266  8e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  37.83 
 
 		 459 aa  266  8.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  38.41 
 
 		 494 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  36.5 
 
 		 457 aa  259  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  37.47 
 
 		 456 aa  257  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  37.75 
 
 		 498 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  37.75 
 
 		 498 aa  256  6e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  36.74 
 
 		 490 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  37.42 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  39.09 
 
 		 493 aa  253  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  35.4 
 
 		 532 aa  253  6e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  37.2 
 
 		 494 aa  253  6e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  37.2 
 
 		 578 aa  253  7e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  36.52 
 
 		 463 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  36.03 
 
 		 484 aa  251  2e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  36.28 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  37.2 
 
 		 494 aa  251  3e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  38.88 
 
 		 493 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  38.88 
 
 		 493 aa  250  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  38.51 
 
 		 463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  36.4 
 
 		 492 aa  242  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2472  amine oxidase  31.96 
 
 		 459 aa  238  3e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  32.49 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  31.25 
 
 		 510 aa  222  9.999999999999999e-57  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  34.56 
 
 		 487 aa  222  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  36.59 
 
 		 458 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  31.53 
 
 		 512 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  34.74 
 
 		 444 aa  196  7e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  33.41 
 
 		 445 aa  188  2e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  29.67 
 
 		 464 aa  182  9.000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal  1 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  28.22 
 
 		 492 aa  170  7e-41  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03291  flavin-containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G00100)  29.07 
 
 		 457 aa  164  4.0000000000000004e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0113455 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7453  amine oxidase  29.87 
 
 		 438 aa  119  7.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0863551  normal  0.347937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5603  amine oxidase, flavin-containing  28.09 
 
 		 492 aa  117  3.9999999999999997e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.296815  normal  0.150795 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1150  amine oxidase  25.4 
 
 		 491 aa  107  6e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  25.1 
 
 		 478 aa  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02566  conserved hypothetical protein  26.28 
 
 		 510 aa  102  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.676497 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  25.78 
 
 		 469 aa  102  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5079  amine oxidase  22.3 
 
 		 459 aa  100  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.392573 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  24.11 
 
 		 496 aa  100  8e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1742  amine oxidase, flavin-containing  24.15 
 
 		 478 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1864  amine oxidase  27.64 
 
 		 478 aa  93.2  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.866463 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  30.43 
 
 		 352 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  24.03 
 
 		 478 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1799  amine oxidase  23.9 
 
 		 482 aa  89.4  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2594  amine oxidase  26.95 
 
 		 478 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2029  amine oxidase, flavin-containing  23.31 
 
 		 478 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0460488  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0521  hypothetical protein  26.13 
 
 		 496 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1960  amine oxidase, flavin-containing  23.11 
 
 		 478 aa  87  7e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000207748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  24.18 
 
 		 350 aa  87  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1928  amine oxidase, flavin-containing  23.11 
 
 		 478 aa  87  8e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.336524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3414  amine oxidase, flavin-containing  23.21 
 
 		 478 aa  86.3  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000395874 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  22.38 
 
 		 487 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0846  amine oxidase  23.22 
 
 		 525 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  22.38 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  22.92 
 
 		 485 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  22.38 
 
 		 482 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05480  hypothetical protein  25.72 
 
 		 496 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  30.77 
 
 		 368 aa  85.9  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0946  UDP-galactopyranose mutase  24.56 
 
 		 495 aa  84.7  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  29.96 
 
 		 352 aa  84.7  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  28.7 
 
 		 367 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  22.18 
 
 		 482 aa  83.6  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  23.82 
 
 		 479 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0817  Amine oxidase (flavin-containing)  23.03 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  21.69 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  22.52 
 
 		 490 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  22.38 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  22.33 
 
 		 487 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1764  amine oxidase, flavin-containing  22.71 
 
 		 478 aa  81.3  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.425068  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  27.42 
 
 		 349 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0586  amine oxidase  25 
 
 		 427 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  21.29 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  22.46 
 
 		 436 aa  77.8  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5286  amine oxidase  23.75 
 
 		 592 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.456502  normal  0.921895 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  31.35 
 
 		 543 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  25.94 
 
 		 353 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  22.98 
 
 		 495 aa  72.8  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0482  amine oxidase  25.45 
 
 		 565 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23.23 
 
 		 495 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  27.87 
 
 		 361 aa  70.1  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06658  flavin containing polyamine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03510)  23.61 
 
 		 536 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.182585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0081  L-amino-acid oxidase  22.45 
 
 		 527 aa  67.4  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5074  amine oxidase, flavin-containing protein  23.61 
 
 		 625 aa  67  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  26.32 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0455  amine oxidase  23.44 
 
 		 624 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>