134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0012 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 		 469 aa  954    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  78.04 
 
 		 495 aa  771    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  76.22 
 
 		 471 aa  743    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  65.74 
 
 		 469 aa  618  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  62.96 
 
 		 467 aa  575  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  55.25 
 
 		 470 aa  465  9.999999999999999e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  35.79 
 
 		 488 aa  282  8.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  37.04 
 
 		 472 aa  269  1e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  36.38 
 
 		 490 aa  267  2.9999999999999995e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  31.87 
 
 		 473 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  32.77 
 
 		 479 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  34.82 
 
 		 469 aa  257  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  33.55 
 
 		 463 aa  253  8.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  34.67 
 
 		 491 aa  252  1e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  32 
 
 		 473 aa  251  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  32.91 
 
 		 509 aa  250  4e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 		 473 aa  249  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  31.79 
 
 		 473 aa  249  8e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  31.79 
 
 		 473 aa  246  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 473 aa  246  8e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 473 aa  246  8e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 473 aa  246  8e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  31.01 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 473 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  32.68 
 
 		 474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  36.02 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  36.02 
 
 		 446 aa  240  4e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  33.99 
 
 		 475 aa  231  2e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  29.91 
 
 		 456 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  31.84 
 
 		 482 aa  223  4.9999999999999996e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  32.62 
 
 		 476 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  32.24 
 
 		 459 aa  219  6e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  32.54 
 
 		 467 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  31.05 
 
 		 441 aa  213  7e-54  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  32.91 
 
 		 473 aa  209  8e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  31.25 
 
 		 460 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  30.3 
 
 		 442 aa  206  6e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  29.69 
 
 		 435 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  26.93 
 
 		 482 aa  196  1e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  35.6 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  33.17 
 
 		 454 aa  193  7e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  27.42 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  27.42 
 
 		 466 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.8 
 
 		 465 aa  191  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  29.19 
 
 		 470 aa  186  8e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  32.96 
 
 		 520 aa  182  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  26.2 
 
 		 466 aa  179  8e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  25.99 
 
 		 466 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  29.94 
 
 		 470 aa  177  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  25.62 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  25.88 
 
 		 466 aa  176  6e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  25.67 
 
 		 466 aa  176  7e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  25.67 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  25.67 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  25.78 
 
 		 466 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  30.06 
 
 		 472 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  25.52 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  29.83 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  24.48 
 
 		 466 aa  168  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 463 aa  168  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  29.65 
 
 		 482 aa  166  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  27.74 
 
 		 470 aa  156  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  29.98 
 
 		 463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  28.35 
 
 		 479 aa  153  5.9999999999999996e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  30.3 
 
 		 421 aa  146  7.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  26.71 
 
 		 471 aa  145  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  27.01 
 
 		 477 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  27.85 
 
 		 473 aa  141  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  28.05 
 
 		 482 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  26.57 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  26.69 
 
 		 463 aa  129  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  25 
 
 		 488 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  26.57 
 
 		 454 aa  127  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  28.69 
 
 		 493 aa  125  1e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  25.54 
 
 		 475 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  29.39 
 
 		 444 aa  121  3e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  28.9 
 
 		 452 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.74 
 
 		 460 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  28.69 
 
 		 589 aa  113  8.000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  23.3 
 
 		 424 aa  109  1e-22  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  28.17 
 
 		 419 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  26.34 
 
 		 482 aa  105  1e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  26.74 
 
 		 477 aa  99  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  23.85 
 
 		 553 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  26.75 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  26.55 
 
 		 469 aa  95.5  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  27.11 
 
 		 454 aa  93.6  7e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  26.58 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  24.64 
 
 		 476 aa  81.3  0.00000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  24.46 
 
 		 487 aa  80.9  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  27.01 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  26.8 
 
 		 479 aa  75.1  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  29.62 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  29.55 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  29.55 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  25.16 
 
 		 475 aa  67  0.0000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15220  protoporphyrinogen oxidase  23.77 
 
 		 502 aa  65.5  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  22.94 
 
 		 462 aa  59.3  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  25.58 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>