178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0144 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  76.22 
 
 
469 aa  743    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  73.25 
 
 
495 aa  733    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  67.87 
 
 
469 aa  657    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
471 aa  961    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  61.19 
 
 
467 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  56.65 
 
 
470 aa  481  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  35.91 
 
 
472 aa  272  1e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  35.08 
 
 
469 aa  262  1e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  33.75 
 
 
488 aa  260  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  33.91 
 
 
463 aa  259  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  31.52 
 
 
479 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  34.66 
 
 
490 aa  253  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  32.78 
 
 
509 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  29.46 
 
 
473 aa  252  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  30.64 
 
 
473 aa  245  9.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  33.55 
 
 
474 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  32.92 
 
 
491 aa  241  2.9999999999999997e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  30.17 
 
 
473 aa  239  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  30.02 
 
 
473 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  30.37 
 
 
473 aa  238  2e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  30.58 
 
 
473 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 
473 aa  234  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 
473 aa  234  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 
473 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  30.59 
 
 
482 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  29.61 
 
 
473 aa  231  2e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  31.9 
 
 
467 aa  225  2e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  33.99 
 
 
446 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  33.99 
 
 
446 aa  223  4e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  31.03 
 
 
475 aa  223  7e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  32.12 
 
 
476 aa  219  6e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  31.51 
 
 
460 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  28.91 
 
 
456 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  29.79 
 
 
441 aa  212  1e-53  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  31.18 
 
 
459 aa  211  2e-53  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  31.3 
 
 
442 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
466 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
466 aa  208  1e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  32.91 
 
 
473 aa  207  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  28.51 
 
 
482 aa  206  6e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  30.15 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  32.13 
 
 
454 aa  197  3e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  31.2 
 
 
470 aa  196  6e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  31.55 
 
 
472 aa  194  4e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  34.02 
 
 
476 aa  193  7e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  26.9 
 
 
466 aa  188  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  30.27 
 
 
470 aa  187  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  26.95 
 
 
466 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.06 
 
 
465 aa  183  7e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 
466 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 
466 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  25.98 
 
 
466 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  26.6 
 
 
463 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  25.77 
 
 
466 aa  179  7e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  26.34 
 
 
466 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  25.77 
 
 
466 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  27.01 
 
 
463 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  25.47 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  32.29 
 
 
520 aa  173  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
488 aa  164  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  30.13 
 
 
482 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  30.56 
 
 
463 aa  154  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  26.96 
 
 
479 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  27.46 
 
 
488 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  26.19 
 
 
470 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  27.95 
 
 
421 aa  130  7.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  25.55 
 
 
475 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  26.28 
 
 
473 aa  125  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  25.83 
 
 
454 aa  125  1e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  26.33 
 
 
477 aa  125  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  24.32 
 
 
471 aa  124  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  27.59 
 
 
493 aa  124  5e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  28.6 
 
 
444 aa  123  7e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  27 
 
 
463 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  29.92 
 
 
452 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  29.07 
 
 
589 aa  119  7.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  24.33 
 
 
488 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.51 
 
 
419 aa  116  8.999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  25.37 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  25.09 
 
 
553 aa  111  3e-23  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  25.36 
 
 
460 aa  107  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  23.76 
 
 
424 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  27.48 
 
 
423 aa  104  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  24.03 
 
 
469 aa  100  4e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  25.59 
 
 
477 aa  99  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  26.34 
 
 
482 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  24.52 
 
 
469 aa  93.6  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  27.08 
 
 
454 aa  87  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26760  protoporphyrinogen oxidase  24.52 
 
 
487 aa  77.8  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  29.41 
 
 
453 aa  77.4  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  25.35 
 
 
479 aa  77  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  29.66 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  29.66 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  26.67 
 
 
447 aa  76.6  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  29.41 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  26.35 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  24.54 
 
 
476 aa  73.2  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  24.33 
 
 
491 aa  72.4  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03920  protoporphyrinogen oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08440)  26.13 
 
 
602 aa  68.9  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.556614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  22.94 
 
 
400 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>