261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8013 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  68.07 
 
 		 516 aa  687    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1076    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  64.78 
 
 		 498 aa  673    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  67.62 
 
 		 512 aa  676    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  64.48 
 
 		 494 aa  661    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  56.03 
 
 		 507 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  51.33 
 
 		 496 aa  491  1e-137  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  51.04 
 
 		 480 aa  474  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  51.19 
 
 		 500 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  51.62 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  53.15 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  48.54 
 
 		 520 aa  463  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  52.84 
 
 		 511 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  50.59 
 
 		 500 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  42.77 
 
 		 472 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  42.75 
 
 		 519 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  38.22 
 
 		 549 aa  376  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  39.41 
 
 		 538 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  41.09 
 
 		 539 aa  352  8.999999999999999e-96  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  37.55 
 
 		 1033 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  39.96 
 
 		 537 aa  339  7e-92  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  40.51 
 
 		 463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  40.51 
 
 		 463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  40.51 
 
 		 463 aa  305  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  36.31 
 
 		 465 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  36.73 
 
 		 450 aa  273  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  36.24 
 
 		 436 aa  271  2.9999999999999997e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  26.24 
 
 		 465 aa  157  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  27.66 
 
 		 449 aa  148  3e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  26.75 
 
 		 459 aa  139  1e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  27.01 
 
 		 447 aa  136  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  26.33 
 
 		 459 aa  133  6.999999999999999e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  24.94 
 
 		 446 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  27.43 
 
 		 437 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  26.37 
 
 		 436 aa  131  3e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  29.81 
 
 		 448 aa  131  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  23.06 
 
 		 722 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 489 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  27.35 
 
 		 491 aa  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.92 
 
 		 452 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  26.27 
 
 		 435 aa  107  5e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  26.01 
 
 		 1293 aa  105  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  21.56 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  24.08 
 
 		 454 aa  99.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.78 
 
 		 538 aa  97.8  4e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  25.74 
 
 		 460 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  26.17 
 
 		 428 aa  97.1  8e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  25 
 
 		 452 aa  94.4  5e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  25.15 
 
 		 532 aa  93.2  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  25.05 
 
 		 449 aa  88.6  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  27.13 
 
 		 450 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  22.22 
 
 		 431 aa  81.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.94 
 
 		 424 aa  79  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  25.42 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  24.15 
 
 		 421 aa  73.2  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  25.8 
 
 		 429 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  21.16 
 
 		 436 aa  65.1  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  25.87 
 
 		 427 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  25.8 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  25.5 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.27 
 
 		 437 aa  60.8  0.00000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.88 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  25.45 
 
 		 525 aa  58.5  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.81 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  23.42 
 
 		 414 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  39.62 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  24.61 
 
 		 429 aa  55.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3286  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 		 488 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.370539 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  24.48 
 
 		 435 aa  54.7  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  42.86 
 
 		 525 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1454  UDP-galactopyranose mutase  28.81 
 
 		 370 aa  54.3  0.000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3088  UDP-galactopyranose mutase  26.01 
 
 		 367 aa  53.5  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552299  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  21.45 
 
 		 428 aa  53.5  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  27.98 
 
 		 396 aa  52.4  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  57.69 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  23.37 
 
 		 419 aa  52.8  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2357  L-amino-acid oxidase  50.85 
 
 		 532 aa  51.2  0.00004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  25.43 
 
 		 463 aa  50.8  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  46.15 
 
 		 468 aa  50.8  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  19.15 
 
 		 427 aa  50.8  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  46.15 
 
 		 468 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  44.23 
 
 		 468 aa  50.4  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  26.14 
 
 		 364 aa  50.4  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  27.65 
 
 		 391 aa  50.4  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  19.15 
 
 		 427 aa  50.1  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  55.77 
 
 		 463 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1780  L-amino acid oxidase  44.07 
 
 		 537 aa  49.7  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0360809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1186  amine oxidase  44.62 
 
 		 578 aa  50.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000340727 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.58 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  25.21 
 
 		 472 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1152  flavin monoamine oxidase related protein  42.37 
 
 		 533 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  42.67 
 
 		 536 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28030  glutamate synthase (NADH) small subunit  48.39 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.328015 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  41.54 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 		 520 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0068  amine oxidase  49.15 
 
 		 557 aa  48.9  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  44.74 
 
 		 520 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  50 
 
 		 506 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>