61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0031 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  76.13 
 
 		 549 aa  845    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  100 
 
 		 1033 aa  2126    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  57.69 
 
 		 519 aa  622  1e-176  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  55 
 
 		 538 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0049  hypothetical protein  54.73 
 
 		 490 aa  553  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  46.17 
 
 		 539 aa  463  1e-129  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  45.14 
 
 		 537 aa  460  9.999999999999999e-129  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  38.63 
 
 		 507 aa  374  1e-102  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  39.25 
 
 		 480 aa  372  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  39.35 
 
 		 496 aa  370  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  40.11 
 
 		 516 aa  367  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  38.69 
 
 		 511 aa  363  1e-98  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  39.31 
 
 		 494 aa  355  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  37.57 
 
 		 500 aa  353  1e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  38.66 
 
 		 512 aa  352  3e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  37.55 
 
 		 524 aa  352  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  37.61 
 
 		 500 aa  351  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  37.7 
 
 		 511 aa  349  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  38.43 
 
 		 500 aa  344  5e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  38 
 
 		 472 aa  341  5e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  37.48 
 
 		 520 aa  337  7.999999999999999e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  36.25 
 
 		 498 aa  331  4e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0032  hypothetical protein  40.04 
 
 		 506 aa  311  2.9999999999999997e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0053  hypothetical protein  36.4 
 
 		 484 aa  298  3e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  28.08 
 
 		 450 aa  218  7e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  28.15 
 
 		 465 aa  211  6e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  29.13 
 
 		 463 aa  196  1e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  29.13 
 
 		 463 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  29.13 
 
 		 463 aa  196  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  26.23 
 
 		 436 aa  184  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.97 
 
 		 465 aa  114  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  22.33 
 
 		 459 aa  113  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  22.13 
 
 		 459 aa  108  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  22.54 
 
 		 722 aa  104  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  23.62 
 
 		 1293 aa  102  3e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  25.53 
 
 		 452 aa  93.6  2e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  22.03 
 
 		 448 aa  93.6  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  23.26 
 
 		 454 aa  89.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  20.95 
 
 		 491 aa  88.6  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.54 
 
 		 449 aa  88.6  6e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  21.36 
 
 		 489 aa  87  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.3 
 
 		 538 aa  86.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  23.75 
 
 		 447 aa  85.5  0.000000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  22.92 
 
 		 437 aa  76.3  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  21.5 
 
 		 532 aa  73.9  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  21.67 
 
 		 436 aa  71.6  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  20.95 
 
 		 452 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  21.75 
 
 		 424 aa  65.1  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  22.8 
 
 		 446 aa  64.3  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  21.91 
 
 		 435 aa  63.5  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  24.31 
 
 		 421 aa  61.6  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  20.95 
 
 		 449 aa  56.6  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  21.08 
 
 		 460 aa  57  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  21.41 
 
 		 428 aa  55.1  0.000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  21.43 
 
 		 431 aa  52  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  27.92 
 
 		 369 aa  51.6  0.00007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  21.15 
 
 		 450 aa  50.4  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  21.66 
 
 		 441 aa  46.6  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  36.62 
 
 		 373 aa  46.2  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  23.31 
 
 		 437 aa  45.8  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2020  UDP-galactopyranose mutase  32.39 
 
 		 814 aa  45.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.843123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>