62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0481 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  100 
 
 
450 aa  894    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  49.42 
 
 
428 aa  409  1e-113  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  38.55 
 
 
435 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  36.32 
 
 
449 aa  259  9e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  36.11 
 
 
446 aa  251  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  34.6 
 
 
447 aa  242  1e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  36.76 
 
 
437 aa  239  5e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  34.31 
 
 
436 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  26.12 
 
 
431 aa  168  2e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  28.34 
 
 
1293 aa  162  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  30.53 
 
 
454 aa  161  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  32.31 
 
 
449 aa  159  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  30.47 
 
 
460 aa  150  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  29.24 
 
 
452 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  30.85 
 
 
452 aa  143  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  23.29 
 
 
428 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  23.41 
 
 
532 aa  120  6e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  24.95 
 
 
538 aa  119  9.999999999999999e-26  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  25.71 
 
 
421 aa  116  6.9999999999999995e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  23.85 
 
 
424 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.87 
 
 
722 aa  113  7.000000000000001e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.69 
 
 
467 aa  107  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  28.1 
 
 
507 aa  105  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  25.66 
 
 
496 aa  97.8  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  26.83 
 
 
480 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  27.1 
 
 
516 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  25.96 
 
 
500 aa  94  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  22.05 
 
 
427 aa  94.4  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  21.79 
 
 
427 aa  94  6e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  22.37 
 
 
472 aa  91.3  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  23.93 
 
 
512 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  28.07 
 
 
520 aa  90.1  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  27.13 
 
 
524 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  25.75 
 
 
500 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  24.6 
 
 
519 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  25.54 
 
 
500 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  26.33 
 
 
511 aa  78.2  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  25 
 
 
511 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  23.08 
 
 
498 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  20.82 
 
 
459 aa  73.6  0.000000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  20.81 
 
 
459 aa  71.2  0.00000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  22.45 
 
 
494 aa  71.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0329  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  24.55 
 
 
431 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  26.81 
 
 
463 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  26.81 
 
 
463 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  26.22 
 
 
463 aa  60.8  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  28.29 
 
 
450 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  24.04 
 
 
436 aa  60.5  0.00000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  21.06 
 
 
549 aa  57.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  24.04 
 
 
465 aa  57.4  0.0000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
489 aa  55.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  28.09 
 
 
366 aa  51.2  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  21.15 
 
 
1033 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  22.73 
 
 
537 aa  48.9  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  24.62 
 
 
421 aa  47.4  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  24.48 
 
 
465 aa  47  0.0006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2131  protoporphyrinogen oxidase  26.96 
 
 
444 aa  46.6  0.0009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.298059 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  21.74 
 
 
369 aa  46.2  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  21.26 
 
 
539 aa  45.4  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  24.72 
 
 
367 aa  45.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5059  UDP-galactopyranose mutase  27.22 
 
 
367 aa  43.9  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3361  UDP-galactopyranose mutase  24.57 
 
 
368 aa  43.5  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.509275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>