More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2574 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  100 
 
 
455 aa  905    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  61.23 
 
 
446 aa  503  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  55.66 
 
 
437 aa  434  1e-120  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  54.19 
 
 
418 aa  417  9.999999999999999e-116  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  54.95 
 
 
431 aa  397  1e-109  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  45.05 
 
 
410 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  40.49 
 
 
425 aa  270  5e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  40.04 
 
 
427 aa  256  4e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  40.71 
 
 
428 aa  254  3e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  38.98 
 
 
420 aa  228  2e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  34 
 
 
468 aa  212  9e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  34.18 
 
 
470 aa  202  9.999999999999999e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  36.58 
 
 
436 aa  189  1e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  33.98 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  33.7 
 
 
426 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  34.79 
 
 
407 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  33.19 
 
 
423 aa  139  7e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  34.62 
 
 
414 aa  139  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  32.35 
 
 
418 aa  137  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  30.64 
 
 
448 aa  133  6.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  30.44 
 
 
451 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  30.22 
 
 
433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  33.63 
 
 
394 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  41.28 
 
 
415 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  30.45 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  40.93 
 
 
418 aa  100  5e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  37.24 
 
 
413 aa  100  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  29.2 
 
 
433 aa  94.7  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  28.63 
 
 
434 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  23.37 
 
 
473 aa  85.9  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.17 
 
 
475 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.17 
 
 
475 aa  78.2  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.95 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.65 
 
 
465 aa  77  0.0000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  21.53 
 
 
466 aa  74.3  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.25 
 
 
474 aa  73.2  0.000000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  22.96 
 
 
472 aa  70.9  0.00000000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.25 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.04 
 
 
464 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.06 
 
 
472 aa  67  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.08 
 
 
472 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  32 
 
 
472 aa  65.1  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  23.42 
 
 
477 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  25 
 
 
589 aa  63.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  24.15 
 
 
519 aa  63.2  0.000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  25.99 
 
 
413 aa  62.8  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  27.73 
 
 
506 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  28.63 
 
 
460 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  43.24 
 
 
552 aa  60.1  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  22.98 
 
 
436 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  59.18 
 
 
497 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  30.86 
 
 
496 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  56 
 
 
525 aa  58.9  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  23.62 
 
 
469 aa  59.3  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  31.93 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  40.74 
 
 
516 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  33.06 
 
 
471 aa  57.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  29.39 
 
 
516 aa  57.4  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  43.84 
 
 
479 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  43.94 
 
 
537 aa  56.2  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  42.03 
 
 
498 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  44.58 
 
 
548 aa  55.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  45.1 
 
 
488 aa  56.2  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  39.62 
 
 
524 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  42.03 
 
 
494 aa  56.2  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  50.94 
 
 
542 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  31 
 
 
473 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  25.85 
 
 
437 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  41.1 
 
 
599 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  30.05 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  54.39 
 
 
507 aa  55.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  23.24 
 
 
488 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  48 
 
 
498 aa  54.7  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  23.99 
 
 
492 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  21.8 
 
 
483 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  39.73 
 
 
472 aa  54.3  0.000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  31.28 
 
 
460 aa  54.3  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4945  amine oxidase  33.17 
 
 
452 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5033  amine oxidase  33.17 
 
 
452 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5326  amine oxidase  33.17 
 
 
452 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.778847  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  54.39 
 
 
512 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  54.39 
 
 
512 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  54.39 
 
 
512 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  24.62 
 
 
484 aa  53.9  0.000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.59 
 
 
465 aa  53.5  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  30.89 
 
 
447 aa  53.5  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  23.08 
 
 
484 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  23.47 
 
 
436 aa  53.1  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  23.41 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  42.5 
 
 
367 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  41.18 
 
 
502 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  47.27 
 
 
492 aa  53.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  41.18 
 
 
502 aa  53.1  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  50 
 
 
503 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1077  all-trans-retinol 13,14-reductase  31.52 
 
 
505 aa  52.4  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  48.39 
 
 
512 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1513  squalene-associated FAD-dependent desaturase  28.76 
 
 
444 aa  52.4  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.156187  hitchhiker  0.00817062 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  45 
 
 
506 aa  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  53.45 
 
 
504 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  36.36 
 
 
624 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>