More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_5163 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  100 
 
 		 512 aa  1009    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  72.26 
 
 		 503 aa  692    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  100 
 
 		 512 aa  1009    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  74.25 
 
 		 504 aa  710    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  98.44 
 
 		 512 aa  993    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26410  UDP-galactopyranose mutase  64.6 
 
 		 507 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.739873 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  57.77 
 
 		 506 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  59.34 
 
 		 509 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  59.76 
 
 		 502 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  57.55 
 
 		 492 aa  494  9.999999999999999e-139  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  51.2 
 
 		 519 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4439  phytoene dehydrogenase-related protein  53.33 
 
 		 492 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.93912 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4929  zeta-phytoene desaturase  53.13 
 
 		 492 aa  441  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.258823  normal  0.799895 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  51.31 
 
 		 506 aa  413  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  51.51 
 
 		 503 aa  414  1e-114  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3309  phytoene desaturase  51.8 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2502  phytoene desaturase  48.86 
 
 		 494 aa  361  2e-98  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000691138  hitchhiker  0.00865975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  44.33 
 
 		 489 aa  336  7e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0470  phytoene desaturase  43.75 
 
 		 496 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.605444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0484  phytoene desaturase  40.66 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  35.43 
 
 		 498 aa  234  2.0000000000000002e-60  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  32.45 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  30.65 
 
 		 492 aa  225  2e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  34.76 
 
 		 507 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  27.52 
 
 		 502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  27.52 
 
 		 502 aa  221  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  31.72 
 
 		 493 aa  221  3e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  32.38 
 
 		 531 aa  221  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  32.59 
 
 		 507 aa  219  8.999999999999998e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  34.64 
 
 		 508 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3508  phytoene dehydrogenase  32.5 
 
 		 524 aa  219  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.691648  normal  0.885719 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  32.31 
 
 		 492 aa  215  1.9999999999999998e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  32.88 
 
 		 525 aa  210  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  32.32 
 
 		 504 aa  210  4e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3011  phytoene desaturase  35.46 
 
 		 508 aa  210  4e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.194152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1619  phytoene dehydrogenase-related protein  32.79 
 
 		 508 aa  210  6e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3236  phytoene desaturase  35.39 
 
 		 508 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.689878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02162  phytoene dehydrogenase  28.69 
 
 		 537 aa  208  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  31.98 
 
 		 512 aa  208  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  30.37 
 
 		 505 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  30.65 
 
 		 504 aa  204  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3436  phytoene desaturase  31.8 
 
 		 512 aa  204  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.240701 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3750  phytoene desaturase  31.95 
 
 		 530 aa  203  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3745  phytoene desaturase  31.6 
 
 		 512 aa  203  6e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  29.98 
 
 		 553 aa  203  7e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  29.7 
 
 		 518 aa  203  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2535  zeta-phytoene desaturase  31.59 
 
 		 491 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00482984  unclonable  0.000000000435247 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3632  phytoene desaturase  31.6 
 
 		 512 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.109765  normal  0.0371662 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2268  phytoene desaturase  30.28 
 
 		 497 aa  201  3.9999999999999996e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3441  phytoene desaturase  31.77 
 
 		 530 aa  200  6e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.826621  normal  0.0554878 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2045  phytoene desaturase  30.02 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.716362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  30.55 
 
 		 511 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  30.63 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1585  zeta-phytoene desaturase  33.67 
 
 		 492 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1811  phytoene dehydrogenase-related protein  30.86 
 
 		 502 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000642179  normal  0.0141145 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5031  phytoene desaturase  31.65 
 
 		 509 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  30.54 
 
 		 511 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  32.06 
 
 		 508 aa  194  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  29.41 
 
 		 518 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  30.35 
 
 		 504 aa  193  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  29.41 
 
 		 518 aa  193  5e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5038  phytoene desaturase  31.87 
 
 		 529 aa  193  7e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.710499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  28.63 
 
 		 511 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  30.58 
 
 		 511 aa  192  9e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  31.02 
 
 		 536 aa  190  5.999999999999999e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0943  phytoene dehydrogenase-related protein  31.04 
 
 		 495 aa  189  7e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.988075 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0609  zeta-phytoene desaturase  29.91 
 
 		 495 aa  190  7e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.392694  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2740  phytoene desaturase  29.84 
 
 		 518 aa  189  1e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  30.35 
 
 		 492 aa  188  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  28.8 
 
 		 497 aa  188  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3637  phytoene desaturase  30.46 
 
 		 530 aa  189  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.197726  normal  0.0326307 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  26.06 
 
 		 494 aa  187  3e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3488  zeta-phytoene desaturase  28.11 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2029  phytoene desaturase  31.38 
 
 		 496 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0116  phytoene dehydrogenase-related protein  29.5 
 
 		 491 aa  181  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1897  phytoene desaturase  28.94 
 
 		 499 aa  179  8e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.29228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  29.43 
 
 		 498 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3156  phytoene desaturase  31.03 
 
 		 509 aa  179  8e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.205158  normal  0.0797948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2155  phytoene dehydrogenase-related protein  27.92 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.774687  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  26.19 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  28.46 
 
 		 519 aa  178  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  30.34 
 
 		 566 aa  176  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1360  phytoene desaturase  30.36 
 
 		 500 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.259348 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  29.95 
 
 		 548 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 		 516 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  25.98 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13830  phytoene desaturase  30.52 
 
 		 552 aa  174  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000359632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12770  phytoene desaturase  28.68 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.500323 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2983  phytoene desaturase  29.44 
 
 		 495 aa  169  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00166806  normal  0.0111696 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1000  phytoene desaturase  26.48 
 
 		 549 aa  164  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.987884 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  26.22 
 
 		 488 aa  164  3e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  27.9 
 
 		 501 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0340  phytoene desaturase  26.61 
 
 		 542 aa  162  1e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0903063 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  25.34 
 
 		 488 aa  162  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  29.58 
 
 		 506 aa  162  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5960  phytoene desaturase  28.37 
 
 		 490 aa  160  5e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  23.69 
 
 		 511 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3491  phytoene desaturase  31.18 
 
 		 551 aa  160  7e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1001  phytoene desaturase  27.69 
 
 		 527 aa  159  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.917372  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  32.47 
 
 		 495 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>