More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1779 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  100 
 
 		 420 aa  811    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  43.74 
 
 		 425 aa  289  5.0000000000000004e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  42.37 
 
 		 427 aa  276  4e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  42.86 
 
 		 428 aa  276  6e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  45.39 
 
 		 410 aa  272  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  40.71 
 
 		 431 aa  254  3e-66  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  41.91 
 
 		 446 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  40.05 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  38.75 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.31 
 
 		 468 aa  216  5.9999999999999996e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  36.21 
 
 		 437 aa  204  2e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  38.06 
 
 		 438 aa  199  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  31.93 
 
 		 470 aa  182  7e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  40.38 
 
 		 436 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  36.3 
 
 		 407 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  39.56 
 
 		 394 aa  176  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  33.18 
 
 		 426 aa  168  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  34.78 
 
 		 451 aa  163  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  34.44 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  36.98 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  36.12 
 
 		 415 aa  150  6e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  38.66 
 
 		 413 aa  144  3e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  36.25 
 
 		 414 aa  144  3e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  31.77 
 
 		 433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  37.57 
 
 		 413 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  32.36 
 
 		 418 aa  132  9e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  28.67 
 
 		 433 aa  113  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  35.71 
 
 		 418 aa  89.7  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  28.29 
 
 		 474 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  30.62 
 
 		 438 aa  70.9  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.3 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  31.52 
 
 		 413 aa  62  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  28.24 
 
 		 472 aa  62  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2005  amine oxidase  28.21 
 
 		 492 aa  60.5  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 469 aa  60.5  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  32.71 
 
 		 456 aa  60.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  26.71 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  36.36 
 
 		 507 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  28.52 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  33.14 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  27.6 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  23.89 
 
 		 425 aa  57.4  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  30.56 
 
 		 467 aa  57  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  40 
 
 		 536 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  31.71 
 
 		 479 aa  56.6  0.0000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  35.16 
 
 		 436 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  32.81 
 
 		 436 aa  55.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  33.59 
 
 		 436 aa  55.1  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  30.05 
 
 		 456 aa  55.1  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  33.59 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  32.81 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  33.59 
 
 		 436 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  27.83 
 
 		 938 aa  54.3  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  33.59 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  35.53 
 
 		 245 aa  53.9  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 520 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 520 aa  53.9  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  52.83 
 
 		 361 aa  53.5  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  38.68 
 
 		 520 aa  53.9  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  56.14 
 
 		 463 aa  53.9  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  45 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  45.33 
 
 		 528 aa  53.5  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  51.61 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  54.55 
 
 		 338 aa  53.5  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  51.61 
 
 		 450 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  43.62 
 
 		 492 aa  53.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.03 
 
 		 639 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1001  amine oxidase  23.13 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.880623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1747  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.83 
 
 		 642 aa  52.8  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  43.75 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 		 530 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  25.68 
 
 		 503 aa  52.4  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  25.84 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  54.39 
 
 		 462 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  25.84 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  46.38 
 
 		 447 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  26.63 
 
 		 530 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  55.56 
 
 		 504 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  33.06 
 
 		 436 aa  51.6  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  44.64 
 
 		 503 aa  51.6  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3809  phytoene desaturase  30.18 
 
 		 492 aa  51.6  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  47.95 
 
 		 506 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  54.39 
 
 		 463 aa  51.2  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  50.65 
 
 		 580 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  28.05 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  42.42 
 
 		 492 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  45.9 
 
 		 354 aa  50.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  30.04 
 
 		 476 aa  51.2  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  25.9 
 
 		 410 aa  50.8  0.00005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  50 
 
 		 359 aa  50.4  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  27.65 
 
 		 480 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.76 
 
 		 465 aa  50.4  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  30.8 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  30.8 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  24.15 
 
 		 640 aa  50.4  0.00006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  24.52 
 
 		 645 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  30.8 
 
 		 432 aa  50.4  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>