216 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1781 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1781  amine oxidase  100 
 
 
367 aa  739    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.524453  normal  0.068532 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0870  amine oxidase  45.35 
 
 
381 aa  297  2e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.993041  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0882  flavin monoamine oxidase family protein  44.41 
 
 
387 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1006  amine oxidase  44.41 
 
 
387 aa  296  6e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.74329  hitchhiker  0.00000000109904 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6444  amine oxidase  44.53 
 
 
387 aa  294  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.138786  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6151  amine oxidase  44.8 
 
 
387 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.275464  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0841  monoamine oxidase  43.21 
 
 
378 aa  282  5.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.541876 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  45.23 
 
 
382 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1377  amine oxidase  40.93 
 
 
382 aa  267  2e-70  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00890  putative oxidoreductase protein  41.01 
 
 
378 aa  262  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0664967  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0981  putative flavin containing amine oxidoreductase  41.06 
 
 
368 aa  250  3e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07013  oxidoreductase  38.84 
 
 
365 aa  231  1e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3839  amine oxidase  38.46 
 
 
367 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0266  amine oxidase  38.23 
 
 
361 aa  203  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000119304  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2164  putative amine oxidase  38.78 
 
 
537 aa  194  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0102  amine oxidase  41.1 
 
 
547 aa  193  3e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3575  amine oxidase  38.42 
 
 
529 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0911962  normal  0.896388 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1737  amine oxidase  37.22 
 
 
521 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.821362 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1588  amine oxidase  37.43 
 
 
543 aa  188  1e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.790833 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2837  amine oxidase  37.74 
 
 
523 aa  187  2e-46  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.859396  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1957  amine oxidase  32.21 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1418  amine oxidase  34.9 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  34.69 
 
 
371 aa  183  4.0000000000000006e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5972  amine oxidase  33.61 
 
 
349 aa  182  1e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.824241  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1970  amine oxidase  40.48 
 
 
365 aa  167  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  32.76 
 
 
353 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3776  amine oxidase  34.72 
 
 
352 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.435082 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5977  amine oxidase  29.91 
 
 
350 aa  150  4e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2753  amine oxidase  34.11 
 
 
352 aa  144  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394653  normal  0.0187617 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3628  amine oxidase  27.95 
 
 
465 aa  72.8  0.000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.533226  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  29.85 
 
 
459 aa  68.6  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  28.63 
 
 
462 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5789  amine oxidase  40.54 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  28.33 
 
 
463 aa  67.4  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  32.84 
 
 
449 aa  67.8  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2065  amine oxidase  27.44 
 
 
458 aa  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1822  amine oxidase  27 
 
 
445 aa  65.1  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4356  amine oxidase  28.84 
 
 
493 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2278  amine oxidase  41.3 
 
 
435 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.682646 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  46.67 
 
 
436 aa  63.5  0.000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  31.31 
 
 
447 aa  63.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13191  flavin-containing monoamine oxidase aofH  29.58 
 
 
454 aa  62.8  0.000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.28865 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5037  amine oxidase (flavin-containing)  28.84 
 
 
493 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5823  amine oxidase (flavin-containing)  28.84 
 
 
493 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105573  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  40.2 
 
 
479 aa  62  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2278  amine oxidase  35.42 
 
 
464 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.381011  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0141  amine oxidase (flavin-containing)  28.09 
 
 
452 aa  59.7  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5578  amine oxidase (flavin-containing)  34.92 
 
 
456 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6829  amine oxidase  28.07 
 
 
492 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.423551  normal  0.420009 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  47.37 
 
 
469 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  39.81 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  39.81 
 
 
450 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05890  conserved hypothetical protein  42.68 
 
 
492 aa  57.4  0.0000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.314478  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  41.89 
 
 
501 aa  57.4  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0745  amine oxidase (flavin-containing)  24.89 
 
 
469 aa  57  0.0000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  53.33 
 
 
463 aa  56.6  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  41.76 
 
 
498 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  41.76 
 
 
498 aa  56.6  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10320  monoamine oxidase  41.18 
 
 
510 aa  56.2  0.0000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2093  phytoene desaturase  40 
 
 
493 aa  55.5  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.456364  decreased coverage  0.00855511 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  54.72 
 
 
433 aa  55.8  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4388  amine oxidase  36.67 
 
 
445 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.48846  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4501  amine oxidase  27.9 
 
 
446 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129259  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05276  Putative monoamine oxidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5B2F4]  48.39 
 
 
492 aa  55.5  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  27.48 
 
 
490 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0369  putative flavin-containing monoamine oxidase  27.31 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.431172 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  20.8 
 
 
445 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  39.33 
 
 
454 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57813  predicted protein  46.15 
 
 
494 aa  54.7  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.266253  normal  0.196096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1230  amine oxidase (flavin-containing)  37.08 
 
 
457 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.333981  normal  0.164061 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6401  twin-arginine translocation pathway signal  29.15 
 
 
493 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  31.48 
 
 
499 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2361  amine oxidase  46.58 
 
 
419 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000435651  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  46.58 
 
 
426 aa  53.9  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  26.83 
 
 
488 aa  53.5  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  52.46 
 
 
448 aa  53.5  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1526  amine oxidase (flavin-containing)  38 
 
 
439 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.028024  normal  0.955332 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  27.57 
 
 
487 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  22.53 
 
 
495 aa  53.1  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6833  amine oxidase  32.06 
 
 
532 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.574218  normal  0.40808 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  42.5 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2738  amine oxidase  30.22 
 
 
494 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  26.13 
 
 
512 aa  52.8  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  31.58 
 
 
451 aa  52.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  56.86 
 
 
394 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  43.64 
 
 
495 aa  51.6  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  34.29 
 
 
487 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5048  twin-arginine translocation pathway signal  28.99 
 
 
578 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5812  amine oxidase; FAD dependent oxidoreductase  28.99 
 
 
494 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.377478  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4452  Amine oxidase (flavin-containing)  36.07 
 
 
498 aa  52  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.383006  normal  0.183412 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  40 
 
 
537 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  31.54 
 
 
519 aa  51.2  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4367  amine oxidase (flavin-containing)  41.57 
 
 
494 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  38.2 
 
 
456 aa  50.1  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2381  amine oxidase  49.09 
 
 
496 aa  50.1  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.325197  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  32.06 
 
 
492 aa  50.1  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  43.1 
 
 
657 aa  49.7  0.00009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5620  phytoene desaturase  43.86 
 
 
497 aa  49.3  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.476172 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0409  phytoene dehydrogenase-related protein  30.84 
 
 
465 aa  49.3  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  33.33 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>