160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4898 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  88.24 
 
 		 498 aa  885    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  71.72 
 
 		 512 aa  748    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  64.68 
 
 		 524 aa  664    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  66.12 
 
 		 516 aa  670    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  100 
 
 		 494 aa  1021    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  51.1 
 
 		 507 aa  497  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  49.69 
 
 		 496 aa  484  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  50.51 
 
 		 511 aa  466  9.999999999999999e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  49.5 
 
 		 500 aa  464  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2880  hypothetical protein  50.92 
 
 		 511 aa  459  9.999999999999999e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0436694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  49.7 
 
 		 500 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  47.31 
 
 		 480 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  48.21 
 
 		 500 aa  443  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  47.76 
 
 		 520 aa  437  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0991  hypothetical protein  42.94 
 
 		 519 aa  408  1.0000000000000001e-112  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.97338  hitchhiker  0.00393632 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  40.65 
 
 		 472 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0064  hypothetical protein  39.67 
 
 		 549 aa  378  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  40.04 
 
 		 1033 aa  362  7.0000000000000005e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1201  hypothetical protein  39.39 
 
 		 537 aa  350  5e-95  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2934  hypothetical protein  38.1 
 
 		 538 aa  349  8e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0109  FAD dependent oxidoreductase  37.64 
 
 		 539 aa  330  5.0000000000000004e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1418  FAD dependent oxidoreductase  34 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.804281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  35.5 
 
 		 465 aa  278  2e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3587  hypothetical protein  36.55 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.584997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3582  hypothetical protein  36.63 
 
 		 463 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.932394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3655  hypothetical protein  36.63 
 
 		 463 aa  273  6e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4750  hypothetical protein  35.57 
 
 		 436 aa  272  1e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  26.76 
 
 		 465 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.7 
 
 		 459 aa  137  6.0000000000000005e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.12 
 
 		 459 aa  131  3e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  24.53 
 
 		 722 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7546  FAD dependent oxidoreductase  27.74 
 
 		 489 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.50279 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1446  amine oxidase  25.61 
 
 		 446 aa  125  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.14723  normal  0.0175327 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  24.63 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2937  amine oxidase  27.33 
 
 		 448 aa  123  8e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  25.16 
 
 		 449 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0121  amine oxidase  25.64 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.406547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1076  amine oxidase  26.39 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2101  amine oxidase  24.48 
 
 		 452 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2150  amine oxidase  24.19 
 
 		 1293 aa  108  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017557  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8137  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  26.13 
 
 		 491 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163406  normal  0.434149 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1142  amine oxidase  22.98 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.86 
 
 		 435 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG00060  conserved expressed protein  23.12 
 
 		 538 aa  96.7  8e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0591276  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03112  conserved hypothetical protein  23.06 
 
 		 532 aa  94.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.630535  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1512  amine oxidase, flavin-containing  22.27 
 
 		 454 aa  90.9  5e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.118585  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  23.19 
 
 		 431 aa  90.5  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0375  hypothetical protein  22.1 
 
 		 428 aa  88.6  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.427757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  27.23 
 
 		 424 aa  81.6  0.00000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2685  amine oxidase, flavin-containing  22.63 
 
 		 449 aa  78.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.327813  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0216  UDP-galactopyranose mutase  21.49 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1928  FAD dependent oxidoreductase  22.86 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0481  hypothetical protein  23.13 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.0000175856  decreased coverage  0.00000000723889 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  23.38 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1072  hypothetical protein  29.03 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00830956 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4100  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  20.83 
 
 		 467 aa  62.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105834  normal  0.0160826 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  26.42 
 
 		 429 aa  62.4  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2901  hypothetical protein  21 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000885481  normal  0.0535803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3047  O-antigen synthesis protein WbyH  20.78 
 
 		 427 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0665883  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  31.82 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1741  UDP-galactopyranose mutase  28.22 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  42.03 
 
 		 455 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  21.59 
 
 		 437 aa  55.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1143  UDP-galactopyranose mutase  27.98 
 
 		 372 aa  55.5  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000571156  hitchhiker  0.00000314352 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1374  UDP-galactopyranose mutase  27.59 
 
 		 372 aa  55.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2265  UDP-galactopyranose mutase  25.88 
 
 		 384 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1402  UDP-galactopyranose mutase  27.01 
 
 		 396 aa  55.1  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2040  UDP-galactopyranose mutase  27.22 
 
 		 366 aa  55.1  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00394808  normal  0.0793604 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0219  UDP-galactopyranose mutase  30.46 
 
 		 380 aa  54.7  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  38.55 
 
 		 525 aa  53.9  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4165  UDP-galactopyranose mutase  24.77 
 
 		 373 aa  53.9  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367331 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  23.09 
 
 		 465 aa  53.1  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  35.71 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4000  hypothetical protein  28.49 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0779  UDP-galactopyranose mutase  23.79 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.110856  normal  0.152549 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0842  UDP-galactopyranose mutase  23.79 
 
 		 383 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000837318 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  33.33 
 
 		 482 aa  52  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  23.82 
 
 		 473 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  22.69 
 
 		 423 aa  51.2  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  24.03 
 
 		 512 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0876  UDP-galactopyranose mutase  24.14 
 
 		 383 aa  50.8  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.1789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  20.06 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1621  UDP-galactopyranose mutase  26.79 
 
 		 367 aa  49.7  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0464676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  25.89 
 
 		 489 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  21.74 
 
 		 473 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  38.89 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1658  UDP-galactopyranose mutase  40.91 
 
 		 501 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17731  phytoene dehydrogenase  42.19 
 
 		 501 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0404  FAD dependent oxidoreductase  24.08 
 
 		 443 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  42.86 
 
 		 494 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  23.67 
 
 		 512 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  38.67 
 
 		 347 aa  48.9  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  22.14 
 
 		 516 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.45 
 
 		 507 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  27.59 
 
 		 519 aa  48.5  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  21.27 
 
 		 473 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  22.69 
 
 		 364 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  43.75 
 
 		 407 aa  48.1  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  41.51 
 
 		 468 aa  48.1  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5197  phytoene desaturase  48 
 
 		 525 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.128771 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>