138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1160 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
516 aa  1006    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  57.87 
 
 
505 aa  519  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4868  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  58.95 
 
 
517 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  56.41 
 
 
557 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  59.33 
 
 
504 aa  488  1e-137  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  59.19 
 
 
523 aa  487  1e-136  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  56.4 
 
 
520 aa  476  1e-133  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0674  phytoene dehydrogenase  53.71 
 
 
529 aa  454  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  52.19 
 
 
516 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10916  oxidoreductase  49.91 
 
 
535 aa  429  1e-119  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1732  hypothetical protein  52.41 
 
 
520 aa  427  1e-118  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1434  FAD dependent oxidoreductase  50.61 
 
 
522 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  50.68 
 
 
513 aa  412  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4452  hypothetical protein  50.1 
 
 
499 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.985838  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4539  hypothetical protein  50.1 
 
 
499 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773013  normal  0.693092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4834  hypothetical protein  50.1 
 
 
499 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.18285 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
536 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 
547 aa  154  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  32.72 
 
 
536 aa  154  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  35.75 
 
 
532 aa  150  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  29.01 
 
 
516 aa  149  2.0000000000000003e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.470789 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  31.1 
 
 
534 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 
518 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  35.39 
 
 
532 aa  147  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  31.02 
 
 
533 aa  146  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  35.45 
 
 
532 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  33.27 
 
 
523 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 
537 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  28.52 
 
 
555 aa  141  3e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.78 
 
 
535 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
536 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  31.23 
 
 
527 aa  137  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  32.26 
 
 
535 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  28.73 
 
 
549 aa  134  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  31.25 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  32.07 
 
 
552 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  28.65 
 
 
537 aa  127  4.0000000000000003e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  32.68 
 
 
531 aa  125  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 
527 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  30.12 
 
 
530 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  28.6 
 
 
531 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 
531 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  27.36 
 
 
530 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  28.42 
 
 
531 aa  118  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 
554 aa  118  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  31.55 
 
 
536 aa  117  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 
539 aa  114  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  27.72 
 
 
556 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  27.06 
 
 
530 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 
530 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  24.18 
 
 
430 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 
547 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
530 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  27.48 
 
 
530 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 
556 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  26.21 
 
 
547 aa  89  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  28.1 
 
 
510 aa  87.8  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 
532 aa  85.1  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 
523 aa  82.4  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 
514 aa  80.5  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  28.51 
 
 
548 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  26.3 
 
 
510 aa  77.4  0.0000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.09 
 
 
531 aa  74.3  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  27.17 
 
 
510 aa  70.5  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  27.51 
 
 
465 aa  69.7  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  29.63 
 
 
545 aa  70.1  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1363  FAD dependent oxidoreductase  23.59 
 
 
420 aa  68.6  0.0000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
528 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  27.43 
 
 
470 aa  67.8  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 
517 aa  67.4  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.81 
 
 
469 aa  65.1  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.43 
 
 
499 aa  64.3  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  26.36 
 
 
519 aa  63.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  26.26 
 
 
478 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  29.13 
 
 
523 aa  63.2  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  27.1 
 
 
468 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  24.95 
 
 
466 aa  61.6  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  28.12 
 
 
476 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  28.12 
 
 
491 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  28.12 
 
 
491 aa  61.2  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  27.97 
 
 
528 aa  61.2  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  26.64 
 
 
437 aa  60.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  31.15 
 
 
523 aa  60.1  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 
534 aa  58.9  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  27.76 
 
 
473 aa  59.3  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  28.66 
 
 
520 aa  58.2  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
520 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  62.22 
 
 
564 aa  57.4  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  26.97 
 
 
482 aa  57.8  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  30.22 
 
 
482 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  26.29 
 
 
481 aa  56.6  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  26.42 
 
 
472 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  30.41 
 
 
545 aa  56.2  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  38.39 
 
 
551 aa  55.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  29.66 
 
 
455 aa  55.8  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  25.08 
 
 
565 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  28.26 
 
 
528 aa  55.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>