147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1724 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  100 
 
 		 470 aa  971    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  37.56 
 
 		 438 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  37.1 
 
 		 468 aa  262  1e-68  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  37.07 
 
 		 407 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  37.01 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  37.7 
 
 		 426 aa  232  1e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  37.13 
 
 		 410 aa  229  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  36.28 
 
 		 428 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  35.17 
 
 		 436 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  33.55 
 
 		 455 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  32.71 
 
 		 427 aa  195  1e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  34.13 
 
 		 446 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  33.71 
 
 		 431 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  34.15 
 
 		 413 aa  183  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  31.93 
 
 		 420 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  33.72 
 
 		 418 aa  182  9.000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  31.4 
 
 		 437 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  33.56 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  32.62 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  32.29 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  32.2 
 
 		 413 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  31.73 
 
 		 451 aa  173  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  33.03 
 
 		 423 aa  171  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  31.88 
 
 		 448 aa  160  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  29.56 
 
 		 433 aa  144  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  29 
 
 		 418 aa  139  7.999999999999999e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  28.57 
 
 		 418 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  31.71 
 
 		 415 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  25.61 
 
 		 469 aa  75.5  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  25 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  22.57 
 
 		 472 aa  60.5  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  43.28 
 
 		 344 aa  57.8  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  21.59 
 
 		 467 aa  57.4  0.0000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  47.62 
 
 		 504 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  24.38 
 
 		 419 aa  55.1  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  37.78 
 
 		 441 aa  53.5  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  48.44 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  48.44 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  48.44 
 
 		 512 aa  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  41.67 
 
 		 330 aa  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1110  amine oxidase  29.39 
 
 		 576 aa  51.6  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  23.64 
 
 		 464 aa  51.6  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  43.75 
 
 		 480 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  27.53 
 
 		 442 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  21.37 
 
 		 473 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  40 
 
 		 496 aa  50.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  26.03 
 
 		 516 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  49.12 
 
 		 506 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2128  phytoene desaturase  25.51 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.423753  decreased coverage  0.0000406201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  26.03 
 
 		 509 aa  49.3  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  36.51 
 
 		 354 aa  48.9  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  39.73 
 
 		 512 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  45 
 
 		 645 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  45.1 
 
 		 501 aa  48.1  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  50 
 
 		 436 aa  48.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  25.69 
 
 		 647 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1712  phytoene desaturase  40.68 
 
 		 504 aa  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678565  normal  0.384259 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  20.17 
 
 		 473 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.69 
 
 		 647 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  38.36 
 
 		 599 aa  47.8  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2211  phytoene desaturase  42.31 
 
 		 531 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.931782  normal  0.130578 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  38.57 
 
 		 421 aa  47.8  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1791  amine oxidase  55 
 
 		 371 aa  47.4  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.142114 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  42.86 
 
 		 313 aa  47.4  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3134  amine oxidase  42.31 
 
 		 492 aa  47  0.0007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.954476  normal  0.604257 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0183  amine oxidase  38.71 
 
 		 523 aa  47  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  49.12 
 
 		 503 aa  47  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  42.19 
 
 		 361 aa  47  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  47.37 
 
 		 506 aa  46.6  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0845  amine oxidase  36.36 
 
 		 492 aa  46.6  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6047  amine oxidase  38.57 
 
 		 353 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.629217  normal  0.078923 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1289  FAD dependent oxidoreductase  42.37 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.571457  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1414  amine oxidase  35.82 
 
 		 565 aa  46.2  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  37.5 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5154  tryptophan 2-monooxygenase  24.38 
 
 		 560 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513773 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  37.5 
 
 		 511 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1720  twin-arginine translocation pathway signal  59.46 
 
 		 529 aa  45.8  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1046  phytoene dehydrogenase  33.33 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.586405  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0117  amine oxidase  22.17 
 
 		 410 aa  45.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  37.5 
 
 		 512 aa  45.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8119  L-amino-acid oxidase  43.48 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.922273  normal  0.645684 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  44.26 
 
 		 519 aa  45.8  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  34.62 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3577  zeta-phytoene desaturase  37.93 
 
 		 504 aa  45.8  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  49.02 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  37.5 
 
 		 511 aa  45.1  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  40 
 
 		 359 aa  45.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  34.74 
 
 		 492 aa  45.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11801  hypothetical protein  34.96 
 
 		 644 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.377095 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  40 
 
 		 466 aa  45.1  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  43.14 
 
 		 445 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  36.36 
 
 		 329 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  25.44 
 
 		 425 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1816  amine oxidase  42.31 
 
 		 492 aa  44.3  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  24.82 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2710  phytoene desaturase  34.43 
 
 		 546 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.487747 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  24.82 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  24.82 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  24.82 
 
 		 432 aa  44.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>