173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_23220 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  100 
 
 		 464 aa  880    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  41.91 
 
 		 415 aa  226  9e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  35.33 
 
 		 448 aa  181  2e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  34.07 
 
 		 423 aa  152  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  34.35 
 
 		 451 aa  142  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  32.97 
 
 		 418 aa  129  8.000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  27.96 
 
 		 426 aa  94.7  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  32.08 
 
 		 407 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  30.48 
 
 		 420 aa  88.6  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  25.41 
 
 		 470 aa  84.7  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  28.38 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  28 
 
 		 418 aa  81.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  29.52 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  26.61 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  26.51 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  35.27 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  29.49 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  31.66 
 
 		 414 aa  73.6  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  34.35 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  29.06 
 
 		 413 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  28.69 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  26.18 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  38.32 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  43.57 
 
 		 413 aa  65.1  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  28.38 
 
 		 437 aa  63.5  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  36.92 
 
 		 455 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  47.54 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1399  phytoene desaturase  40.83 
 
 		 502 aa  58.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  34.48 
 
 		 645 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  35.29 
 
 		 647 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  49.18 
 
 		 484 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  35.29 
 
 		 647 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  52.46 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3573  phytoene desaturase  38.84 
 
 		 509 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  44 
 
 		 503 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  46.05 
 
 		 492 aa  53.5  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1387  amine oxidase  42.57 
 
 		 503 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.600466  hitchhiker  0.00651843 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  38.89 
 
 		 359 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2259  amine oxidase  46.15 
 
 		 459 aa  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00770255  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5128  zeta-phytoene desaturase  56 
 
 		 506 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.146602 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  44.26 
 
 		 354 aa  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  51.79 
 
 		 474 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  36.23 
 
 		 647 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  44.74 
 
 		 456 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  47.27 
 
 		 468 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  23 
 
 		 495 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3075  putative phytoene desaturase  39.01 
 
 		 506 aa  51.2  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.873802  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 346 aa  51.2  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  48 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  48 
 
 		 502 aa  51.2  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  45.45 
 
 		 468 aa  51.2  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2545  phytoene desaturase  32.58 
 
 		 536 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.139145  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5454  phytoene dehydrogenase-related protein  52 
 
 		 512 aa  50.4  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  47.27 
 
 		 468 aa  50.4  0.00006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  55.17 
 
 		 400 aa  50.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5075  amine oxidase  52 
 
 		 512 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5163  phytoene dehydrogenase-related protein  52 
 
 		 512 aa  50.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.134146  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  29.7 
 
 		 476 aa  49.3  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  22.65 
 
 		 495 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3228  Zeta-phytoene desaturase  38.39 
 
 		 519 aa  49.7  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285222  normal  0.0185992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  41.82 
 
 		 428 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  40 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  40.96 
 
 		 548 aa  49.3  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  54 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1847  phytoene dehydrogenase-related protein  52 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  45.59 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  51.72 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  51.72 
 
 		 401 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  45.59 
 
 		 450 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  38.89 
 
 		 571 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  50.88 
 
 		 456 aa  47.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  46.77 
 
 		 491 aa  47.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1523  amine oxidase  50.91 
 
 		 438 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.834861  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  43.94 
 
 		 338 aa  47.4  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3248  phytoene dehydrogenase-related protein  53.33 
 
 		 495 aa  47.4  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.242639  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  41.27 
 
 		 508 aa  47  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0040  putrescine oxidase  50.85 
 
 		 462 aa  47  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  43.75 
 
 		 507 aa  47  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  44.19 
 
 		 510 aa  46.6  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  46.67 
 
 		 445 aa  47  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  43.64 
 
 		 547 aa  46.6  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  40.68 
 
 		 506 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2704  phytoene desaturase  48 
 
 		 498 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0507  FAD dependent oxidoreductase  36.84 
 
 		 342 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.770202  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  32.17 
 
 		 330 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  47.14 
 
 		 460 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1866  amine oxidase  45.45 
 
 		 447 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.591896  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  52.83 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  49.09 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0160  hypothetical protein  45.31 
 
 		 319 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443199  normal  0.129694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.56 
 
 		 535 aa  45.8  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  31.01 
 
 		 434 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  42.86 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  49.09 
 
 		 552 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0040  amine oxidase  50.88 
 
 		 463 aa  45.4  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  36.27 
 
 		 506 aa  45.8  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  43.64 
 
 		 519 aa  45.8  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  44.64 
 
 		 520 aa  45.8  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  47.92 
 
 		 501 aa  45.8  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  52.83 
 
 		 551 aa  45.4  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>