220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1344 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 559 aa  1088    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  74.46 
 
 		 551 aa  722    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  73.11 
 
 		 571 aa  726    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  64.25 
 
 		 551 aa  656    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  57.82 
 
 		 548 aa  600  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  60.83 
 
 		 555 aa  585  1e-166  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.4 
 
 		 557 aa  560  1e-158  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  54.55 
 
 		 552 aa  555  1e-157  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  56.81 
 
 		 545 aa  557  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.41 
 
 		 550 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  58.29 
 
 		 559 aa  550  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  56.04 
 
 		 552 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.07 
 
 		 555 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  59.46 
 
 		 549 aa  549  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  55.06 
 
 		 551 aa  548  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  55.9 
 
 		 555 aa  543  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  54.58 
 
 		 566 aa  543  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.56 
 
 		 550 aa  536  1e-151  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.44 
 
 		 597 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  53.96 
 
 		 556 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  54.83 
 
 		 558 aa  526  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  53.96 
 
 		 556 aa  525  1e-148  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  56.42 
 
 		 551 aa  526  1e-148  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  52.28 
 
 		 549 aa  520  1e-146  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  53.61 
 
 		 558 aa  520  1e-146  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  54.48 
 
 		 556 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  55.66 
 
 		 551 aa  515  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  55.15 
 
 		 552 aa  511  1e-143  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  53.62 
 
 		 557 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  52.32 
 
 		 558 aa  507  9.999999999999999e-143  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  56.92 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  52.3 
 
 		 553 aa  502  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.55 
 
 		 571 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  51.57 
 
 		 551 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  51.38 
 
 		 551 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  47.93 
 
 		 558 aa  450  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  36.92 
 
 		 549 aa  318  2e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.25 
 
 		 552 aa  306  9.000000000000001e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  39.18 
 
 		 533 aa  303  5.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  37.46 
 
 		 541 aa  302  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.15 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.07 
 
 		 537 aa  294  3e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  38.94 
 
 		 537 aa  288  2e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.96 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  69.14 
 
 		 98 aa  107  7e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  24.82 
 
 		 597 aa  87.8  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  25.09 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  24.46 
 
 		 588 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  25.85 
 
 		 497 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.84 
 
 		 463 aa  77.4  0.0000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.59 
 
 		 519 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  24.78 
 
 		 521 aa  76.6  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  26.02 
 
 		 517 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  24.59 
 
 		 517 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  26.71 
 
 		 519 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  23.45 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.35 
 
 		 515 aa  72.4  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.04 
 
 		 598 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  24.96 
 
 		 506 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  24.96 
 
 		 506 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  23.64 
 
 		 506 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  23.95 
 
 		 637 aa  67.4  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  23.43 
 
 		 596 aa  67  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  24.96 
 
 		 506 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  24.6 
 
 		 598 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.05 
 
 		 517 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  22.54 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  24.39 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.73 
 
 		 593 aa  65.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  22.89 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  23.26 
 
 		 596 aa  64.7  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  25.74 
 
 		 482 aa  64.3  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  24.65 
 
 		 512 aa  64.3  0.000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  22.22 
 
 		 596 aa  64.3  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  20.96 
 
 		 608 aa  63.9  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  24.3 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  23.1 
 
 		 464 aa  63.5  0.000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.04 
 
 		 476 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.42 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  22.92 
 
 		 583 aa  62  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.15 
 
 		 543 aa  61.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  25.54 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  25.54 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.51 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0275  flavocytochrome c  29.05 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000326146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3939  flavocytochrome c  28.49 
 
 		 506 aa  60.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.45 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  22.78 
 
 		 504 aa  59.7  0.0000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  23.66 
 
 		 591 aa  59.7  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  23.08 
 
 		 596 aa  59.3  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  23.76 
 
 		 561 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1543  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  35.17 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  23.83 
 
 		 596 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.1 
 
 		 577 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.76 
 
 		 498 aa  57.4  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  23.83 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  24.02 
 
 		 582 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  24.02 
 
 		 582 aa  57  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  28.42 
 
 		 520 aa  57  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  29.32 
 
 		 506 aa  57  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>