231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_4560 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  61.94 
 
 		 558 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  64.83 
 
 		 551 aa  663    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  64.09 
 
 		 552 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  62.55 
 
 		 549 aa  658    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  62.39 
 
 		 557 aa  645    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  64.91 
 
 		 566 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  65.65 
 
 		 556 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  65.09 
 
 		 548 aa  691    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  60.96 
 
 		 553 aa  638    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  61.07 
 
 		 558 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  68.55 
 
 		 551 aa  682    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  65.64 
 
 		 573 aa  640    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  76.37 
 
 		 571 aa  811    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  65.65 
 
 		 556 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  63.59 
 
 		 555 aa  656    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  65.81 
 
 		 555 aa  654    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  65.11 
 
 		 556 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  64 
 
 		 545 aa  661    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  62.77 
 
 		 552 aa  665    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  67.42 
 
 		 551 aa  674    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  63.02 
 
 		 558 aa  646    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 557 aa  1127    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  62.55 
 
 		 550 aa  630  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  59.31 
 
 		 551 aa  626  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  62.02 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  62.02 
 
 		 551 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  58.95 
 
 		 559 aa  608  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  61.15 
 
 		 549 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  59.46 
 
 		 552 aa  595  1e-169  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.98 
 
 		 597 aa  587  1e-166  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  57.64 
 
 		 555 aa  573  1.0000000000000001e-162  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.93 
 
 		 551 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.54 
 
 		 550 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.4 
 
 		 559 aa  553  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.54 
 
 		 558 aa  521  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.31 
 
 		 571 aa  488  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  38.38 
 
 		 552 aa  340  5e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.47 
 
 		 537 aa  312  1e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.53 
 
 		 541 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  36.09 
 
 		 549 aa  310  4e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  35.92 
 
 		 533 aa  298  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.88 
 
 		 537 aa  295  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.88 
 
 		 537 aa  290  3e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.71 
 
 		 522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  62.03 
 
 		 98 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  24.24 
 
 		 597 aa  89  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.47 
 
 		 511 aa  87.8  5e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.27 
 
 		 598 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  25.91 
 
 		 512 aa  84  0.000000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  29.21 
 
 		 598 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.07 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.91 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  24.48 
 
 		 508 aa  72.4  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  24.42 
 
 		 598 aa  72.8  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.17 
 
 		 498 aa  67.4  0.0000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  24.08 
 
 		 482 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.23 
 
 		 519 aa  66.6  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  27.94 
 
 		 499 aa  65.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  26.52 
 
 		 519 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.02 
 
 		 586 aa  65.5  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.3 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  22.7 
 
 		 668 aa  64.7  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.64 
 
 		 509 aa  64.7  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.47 
 
 		 509 aa  63.5  0.000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.78 
 
 		 488 aa  63.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  23.89 
 
 		 519 aa  63.2  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5555  putative FAD-binding dehydrogenase  27.58 
 
 		 555 aa  62.4  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.96 
 
 		 527 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.47 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  29.59 
 
 		 511 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.61 
 
 		 504 aa  60.5  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  26.35 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  23.78 
 
 		 587 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  23.78 
 
 		 587 aa  60.5  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.84 
 
 		 517 aa  60.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  24.6 
 
 		 506 aa  59.7  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  25.62 
 
 		 596 aa  59.7  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  24.67 
 
 		 569 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  25.62 
 
 		 586 aa  60.1  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  40.91 
 
 		 627 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  23.48 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.66 
 
 		 502 aa  59.3  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  22.18 
 
 		 464 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  23.97 
 
 		 596 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  24.37 
 
 		 616 aa  58.2  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25.3 
 
 		 623 aa  58.2  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  24.51 
 
 		 506 aa  57.8  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  28.87 
 
 		 500 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  41.25 
 
 		 515 aa  57.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  23.48 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  37.65 
 
 		 599 aa  57.4  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  24.51 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  23.3 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  23.08 
 
 		 596 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  23.08 
 
 		 596 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  23.08 
 
 		 596 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.55 
 
 		 491 aa  57  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2827  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.79 
 
 		 511 aa  57  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  23.08 
 
 		 596 aa  57  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  26.94 
 
 		 518 aa  56.6  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>